基于網(wǎng)絡藥理學的黨參治療慢性萎縮性胃炎的機制研究
發(fā)布時間:2021-10-12 08:41
目的運用網(wǎng)絡藥理學的方法探討黨參治療慢性萎縮性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的分子作用機制。方法通過TCMSP數(shù)據(jù)庫和文獻挖掘獲取黨參的主要活性成分,利用人類基因數(shù)據(jù)庫GeneCards預測和篩選黨參活性成分的作用靶點。采用String數(shù)據(jù)庫和Cytoscape3.7.1軟件繪制蛋白相互作用網(wǎng)絡(PPI),借助DAVID6.8數(shù)據(jù)庫進行潛在基因的基因本體(GO)分析和基因組百科全書(KEGG)通路富集分析。結果篩選得到黨參21個活性成分,涉及27個作用靶點。GO分析結果顯示,黨參治療慢性萎縮性胃炎潛在基因的生物功能主要涉及影響染色體結合,蛋白質異二聚化活性,核受體活性,轉錄因子活性,類固醇激素受體,類固醇結合,NF-κB結合,雌激素受體,RNA聚合酶II,半胱氨酸型內肽酶等;KEGG通路富集分析結果顯示,黨參治療慢性萎縮性胃炎潛在基因的通路主要涉及前列腺癌,細胞凋亡,TNF信號通路,結直腸癌,乙型肝炎,AGE-RAGE信號通路,PI3K-Akt等信號通路。結論黨參治療慢性萎縮性胃炎是多成分、多靶點、多通路的復雜過程,主要通過參與抑制炎性分子、NF-...
【文章來源】:時珍國醫(yī)國藥. 2020,31(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
藥物有效成分-靶點網(wǎng)絡圖
圖1 藥物有效成分-靶點網(wǎng)絡圖表2 藥物-疾病交集基因具有的功能信息 ID Description Count P GO:0004879 核受體活性 5 9.03E-09 GO:0098531 轉錄因子活性,直接的配體調節(jié)序列特異性DNA結合 5 9.03E-09 GO:0003707 類固醇激素受體活性 5 2.07E-08 GO:0003682 染色質結合 7 4.07E-06 GO:0005496 類固醇結合 4 8.57E-06 GO:0046982 蛋白質異二聚活性 7 9.46E-06 GO:0051059 NF-κB結合 3 1.28E-05 GO:0030331 雌激素受體結合 3 3.68E-05 GO:0000978 RNA聚合酶II近端啟動子序列特異性DNA結合 6 4.94E-05 GO:0000987 近端啟動子序列特異性DNA結合 6 6.36E-05 GO:0004197 半胱氨酸型內肽酶活性 3 9.41E-05 GO:0051117 ATP酶結合 3 0.000243 GO:0008013 β-catenin結合 3 0.000252 GO:0001228 DNA結合轉錄激活劑活性,RNA聚合酶II特異性 5 0.000332 GO:0042277 肽結合 4 0.00035 GO:0035258 類固醇激素受體結合 3 0.00036 GO:0001091 RNA聚合酶II基礎轉錄因子結合 2 0.000367 GO:0001223 轉錄共激活因子結合 2 0.000503 GO:0001085 RNA聚合酶II轉錄因子結合 3 0.000749 GO:0033218 酰胺結合 4 0.00078 GO:0031625 泛素蛋白連接酶結合 4 0.000824 GO:0070851 生長因子受體結合 3 0.000913 GO:0042805 肌動蛋白結合 2 0.000964 GO:0044389 泛素樣蛋白連接酶結合 4 0.001021 GO:0004601 過氧化物酶活性 2 0.001569 GO:0035257 核激素受體結合 3 0.0016 GO:0008234 半胱氨酸型肽酶活性 3 0.001631 GO:0001221 轉錄輔因子結合 2 0.001654 GO:0016684 氧化還原酶活性,以過氧化物為受體 2 0.001832 GO:0050840 細胞外基質結合 2 0.002115
續(xù)表2 ID Description Count P GO:0051427 激素受體結合 3 0.002421 GO:0043621 蛋白質自締合 2 0.003561 GO:0001098 基礎轉錄機制結合 2 0.004077 GO:0001099 基底RNA聚合酶II轉錄機制結合 2 0.004077 GO:0003684 DNA結合受損 2 0.004077 GO:0030545 受體調節(jié)活性 4 0.004313 GO:0005126 細胞因子受體結合 3 0.00439 GO:0033613 激活轉錄因子結合 2 0.004625 GO:0002039 p53結合 2 0.004767 GO:0016209 抗氧化活性 2 0.004767 GO:1901681 硫化合物結合 3 0.005061 GO:0001618 病毒受體活性 2 0.006137 GO:0104005 被劫持的分子功能 2 0.006137 GO:0042562 激素結合 2 0.007311 GO:0042826 組蛋白脫乙;附Y合 2 0.0113882.6 KEGG 富集通路分析結果
【參考文獻】:
期刊論文
[1]中醫(yī)藥治療慢性萎縮性胃炎的研究進展[J]. 宋青,劉震,黃達. 首都醫(yī)科大學學報. 2019(03)
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[6]半夏瀉心湯對PLGC大鼠胃黏膜P13k/Akt/m TOR通路的影響及其防治研究[J]. 彭雪靖,劉潔. 湖南中醫(yī)雜志. 2018(10)
[7]四君子湯在慢性萎縮性胃炎中的療效觀察[J]. 徐梅. 內蒙古中醫(yī)藥. 2017(07)
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[9]PI3K/Akt-mTOR信號通路介導潰瘍性結腸炎相關癌變的實驗研究[J]. 方培植,黃會云,張濤,羅淑娟,王囡囡,卓少元. 胃腸病學和肝病學雜志. 2015(07)
[10]胃腸道癌前病變和癌前疾病研究現(xiàn)狀[J]. 李仲啟,傅漢中. 臨床消化病雜志. 2015(03)
碩士論文
[1]健脾益氣方對CAG大鼠成模的抑制作用及Wnt/β-catenin通路相關蛋白表達的影響[D]. 馬錦霞.南京中醫(yī)藥大學 2018
[2]中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺的構建和應用[D]. 汝錦龍.西北農林科技大學 2015
本文編號:3432244
【文章來源】:時珍國醫(yī)國藥. 2020,31(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
藥物有效成分-靶點網(wǎng)絡圖
圖1 藥物有效成分-靶點網(wǎng)絡圖表2 藥物-疾病交集基因具有的功能信息 ID Description Count P GO:0004879 核受體活性 5 9.03E-09 GO:0098531 轉錄因子活性,直接的配體調節(jié)序列特異性DNA結合 5 9.03E-09 GO:0003707 類固醇激素受體活性 5 2.07E-08 GO:0003682 染色質結合 7 4.07E-06 GO:0005496 類固醇結合 4 8.57E-06 GO:0046982 蛋白質異二聚活性 7 9.46E-06 GO:0051059 NF-κB結合 3 1.28E-05 GO:0030331 雌激素受體結合 3 3.68E-05 GO:0000978 RNA聚合酶II近端啟動子序列特異性DNA結合 6 4.94E-05 GO:0000987 近端啟動子序列特異性DNA結合 6 6.36E-05 GO:0004197 半胱氨酸型內肽酶活性 3 9.41E-05 GO:0051117 ATP酶結合 3 0.000243 GO:0008013 β-catenin結合 3 0.000252 GO:0001228 DNA結合轉錄激活劑活性,RNA聚合酶II特異性 5 0.000332 GO:0042277 肽結合 4 0.00035 GO:0035258 類固醇激素受體結合 3 0.00036 GO:0001091 RNA聚合酶II基礎轉錄因子結合 2 0.000367 GO:0001223 轉錄共激活因子結合 2 0.000503 GO:0001085 RNA聚合酶II轉錄因子結合 3 0.000749 GO:0033218 酰胺結合 4 0.00078 GO:0031625 泛素蛋白連接酶結合 4 0.000824 GO:0070851 生長因子受體結合 3 0.000913 GO:0042805 肌動蛋白結合 2 0.000964 GO:0044389 泛素樣蛋白連接酶結合 4 0.001021 GO:0004601 過氧化物酶活性 2 0.001569 GO:0035257 核激素受體結合 3 0.0016 GO:0008234 半胱氨酸型肽酶活性 3 0.001631 GO:0001221 轉錄輔因子結合 2 0.001654 GO:0016684 氧化還原酶活性,以過氧化物為受體 2 0.001832 GO:0050840 細胞外基質結合 2 0.002115
續(xù)表2 ID Description Count P GO:0051427 激素受體結合 3 0.002421 GO:0043621 蛋白質自締合 2 0.003561 GO:0001098 基礎轉錄機制結合 2 0.004077 GO:0001099 基底RNA聚合酶II轉錄機制結合 2 0.004077 GO:0003684 DNA結合受損 2 0.004077 GO:0030545 受體調節(jié)活性 4 0.004313 GO:0005126 細胞因子受體結合 3 0.00439 GO:0033613 激活轉錄因子結合 2 0.004625 GO:0002039 p53結合 2 0.004767 GO:0016209 抗氧化活性 2 0.004767 GO:1901681 硫化合物結合 3 0.005061 GO:0001618 病毒受體活性 2 0.006137 GO:0104005 被劫持的分子功能 2 0.006137 GO:0042562 激素結合 2 0.007311 GO:0042826 組蛋白脫乙;附Y合 2 0.0113882.6 KEGG 富集通路分析結果
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[6]半夏瀉心湯對PLGC大鼠胃黏膜P13k/Akt/m TOR通路的影響及其防治研究[J]. 彭雪靖,劉潔. 湖南中醫(yī)雜志. 2018(10)
[7]四君子湯在慢性萎縮性胃炎中的療效觀察[J]. 徐梅. 內蒙古中醫(yī)藥. 2017(07)
[8]健脾益胃湯治療慢性萎縮性胃炎臨床研究[J]. 熊云華. 世界中醫(yī)藥. 2016(10)
[9]PI3K/Akt-mTOR信號通路介導潰瘍性結腸炎相關癌變的實驗研究[J]. 方培植,黃會云,張濤,羅淑娟,王囡囡,卓少元. 胃腸病學和肝病學雜志. 2015(07)
[10]胃腸道癌前病變和癌前疾病研究現(xiàn)狀[J]. 李仲啟,傅漢中. 臨床消化病雜志. 2015(03)
碩士論文
[1]健脾益氣方對CAG大鼠成模的抑制作用及Wnt/β-catenin通路相關蛋白表達的影響[D]. 馬錦霞.南京中醫(yī)藥大學 2018
[2]中藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫和分析平臺的構建和應用[D]. 汝錦龍.西北農林科技大學 2015
本文編號:3432244
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