發(fā)布時(shí)間：2021-08-24 23:14

　　目的轉(zhuǎn)錄組分析松茸多糖（TMP-A）誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖的分子機(jī)制。方法分別用TMP-A（10μg/mL）、LPS（10μg/mL）處理T細(xì)胞24 h,采用RNA-seq測(cè)序技術(shù)對(duì)T細(xì)胞進(jìn)行測(cè)序并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果空白對(duì)照組、TMP-A組和LPS陽性對(duì)照組分別得到46 574 489、50 259 600、57 439 600條Clean reads,對(duì)應(yīng)的總大小分別為6.99、7.54、8.62 G。線粒體色素C氧化酶基因家族、鈣網(wǎng)蛋白基因等是TMP-A組的超高表達(dá)基因,在T細(xì)胞增殖過程中細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、蛋白質(zhì)合成及線粒體代謝增強(qiáng),且氧化磷酸化所產(chǎn)生的能量是T細(xì)胞增殖過程的主要能量來源。TMP-A組相比于空白對(duì)照組有485個(gè)基因差異表達(dá),其中上調(diào)的基因482個(gè),下調(diào)的基因3個(gè),主要與離子轉(zhuǎn)運(yùn)和系統(tǒng)過程,外周和質(zhì)膜以及分子功能中轉(zhuǎn)運(yùn)活性有關(guān);且通路涉及神經(jīng)活性配體-受體相互作用、Ras信號(hào)途徑、MAPK信號(hào)途徑等。結(jié)論 T細(xì)胞在TMP-A作用下的生物代謝發(fā)生差異,離子轉(zhuǎn)運(yùn)、質(zhì)膜、轉(zhuǎn)運(yùn)活性相關(guān)基因是TMP-A誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖的關(guān)鍵基因,且Ras-Raf-Erk-MAPK信號(hào)通路是TMP-A誘導(dǎo)T... 

【文章來源】：中成藥. 2020,42(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【部分圖文】：

LPS陽性對(duì)照組相比于空白對(duì)照組基因差異表達(dá)分析火山圖

圖4 TMP-A相比于空白對(duì)照組差異基因GO富集分析表9 TMP-A組與空白對(duì)照組差異基因KEGG pathway富集分析Tab.9 KEGG pathway enrichment analysis of DEGS of the TMP-A group vs the blank control group 通路描述 KEGG編號(hào) 差異基因數(shù)/個(gè) 上調(diào)的差異基因數(shù)/個(gè) 下調(diào)的差異基因數(shù)/個(gè) 代謝途徑(metabolic pathways) hsa01100 22 22 0 神經(jīng)活性配體-受體相互作用(neuroactive ligand-receptor interaction) hsa04080 9 9 0 Ras信號(hào)途徑(Ras signaling pathway) hsa04014 8 8 0 造血細(xì)胞系(hematopoietic cell lineage) hsa04640 7 7 0 MAPK信號(hào)途徑(MAPK signaling pathway) hsa04010 7 7 0 細(xì)胞因子-細(xì)胞因子-受體相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction) hsa04060 7 7 0 肥厚性心肌病[hypertrophic cardiomyopathy (HCM)] hsa05410 6 6 0 胰腺分泌(pancreatic secretion) hsa04972 6 6 0 破骨細(xì)胞分化(osteoclast differentiation) hsa04380 6 6 0 JAK-STAT信號(hào)通路(JAK-STAT signaling pathway) hsa04630 6 6 0 催產(chǎn)素信號(hào)通路(oxytocin signaling pathway) hsa04921 6 6 0 癌癥的途徑(pathways in cancer) hsa05200 6 6 0 PI3K-Akt信號(hào)通路(PI3K-Akt signaling pathway) hsa04151 6 6 0

MAPK信號(hào)途徑是在真核細(xì)胞中存在的一種高度保守的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)模式,通過激活絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶Raf-1(MAPKKK)、磷酸化MEK蛋白激酶(MAPKK)和MAPK(促分裂原活化蛋白激酶)將有絲分裂信號(hào)傳遞到細(xì)胞核內(nèi),進(jìn)而調(diào)控細(xì)胞的生長、分化和增殖等重要生理功能[27]。在Ras-Raf-Erk-MAPK信號(hào)途徑中,成纖維生長因子家族基因的Fgf2[28]表達(dá)上調(diào),提示TMP-A對(duì)于維持骨髓微環(huán)境,調(diào)控細(xì)胞的分化具有重要作用;上調(diào)磷脂酶基因家族PLA中的Pla2g2e、Pla2g3[29-31],表明TMP-A能夠調(diào)節(jié)T細(xì)胞的新陳代謝、增強(qiáng)T細(xì)胞參與炎癥和防御反應(yīng)的能力。Elk1為ETS轉(zhuǎn)錄因子ELK1基因[32-34],該基因表達(dá)上調(diào),表明TMP-A誘導(dǎo)下T細(xì)胞產(chǎn)生的炎癥相關(guān)因子IL-1β和TNF-α增多。Grin2b基因編碼的NR2B是NMDA受體(一種神經(jīng)遞質(zhì)通道)的亞單位之一[35],該基因表達(dá)上調(diào),提示在TMP-A作用下,T細(xì)胞對(duì)刺激做出反應(yīng)的能力增強(qiáng)。綜上所述,TMP-A通過上調(diào)成纖維生長因子家族(FGF)激活受體酪氨酸激酶RTK、下游Ras蛋白,進(jìn)而磷酸化MAPK信號(hào)通路,提示它主要通過Ras-Raf-Erk-MAPK信號(hào)途徑誘導(dǎo)T細(xì)胞增殖。


本文編號(hào)：3360909