目的:通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的手段研究西紅花抗炎作用的分子機(jī)制。方法:搜集并整理得到西紅花的有效成分信息,上傳至Swiss數(shù)據(jù)庫,匹配得到西紅花有效成分對應(yīng)的靶點蛋白,利用Cytoscape3.4.1軟件構(gòu)建有效成分-靶點的網(wǎng)絡(luò),對得到的靶點進(jìn)行GO富集分析。通過TTD、CTD和OMIM數(shù)據(jù)庫得到抗炎作用相關(guān)的靶點信息,建立疾病-靶點網(wǎng)絡(luò)。選擇Cytoscape 3.4.1中Merge功能對兩個網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行結(jié)合,得到有效成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò)。利用DAVID數(shù)據(jù)庫對預(yù)測得到的靶點信息進(jìn)行GO生物功能學(xué)富集分析和KEGG pathway富集分析。結(jié)果:篩選得到西紅花抗炎活性成分14個,主要為類胡蘿卜素類、黃酮類和酚酸類化合物。與抗炎作用相關(guān)的靶點有13個,其中度值較高的靶點有EGFR、KDR、PTPRC、APP、MET、MAPK12。推測西紅花中活性成分通過EGFR、KDR、PTPRC、APP、MET、MAPK12等靶點參與了生物體內(nèi)細(xì)胞信號傳導(dǎo)、細(xì)胞代謝和基因表達(dá)等過程,抑制了炎癥因子的產(chǎn)生和釋放,從而發(fā)揮了抗炎作用。 

【文章來源】：中國野生植物資源. 2020,39(06)CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究西紅花抗炎作用流程圖

將化學(xué)成分-靶點網(wǎng)絡(luò)和抗炎-靶點網(wǎng)絡(luò)合并得到西紅花化學(xué)成分-靶點-疾病網(wǎng)絡(luò),見圖4。其中西紅花抗炎活性成分14個,主要有西紅花酸、異鼠李素、山奈酚、咖啡酸、苦藏紅花苷酸、藏花醛等;與西紅花發(fā)揮抗炎作用的靶點有13個,分別是EGFR、KDR、PTPRC、MAPK12、APP、MET、FGFR1、LPAR1、SELE、CD38、MIF、ERBB2、DRD2、FLT4。其中,西紅花酸、異鼠李素、山奈酚主要作用于EGFR和MAPK12; 咖啡酸、苦藏紅花苷酸、藏花醛、3,5-二甲基苯甲醛主要作用于KDR、MET和FGFR1。從圖4可以看出,西紅花酸、異鼠李素、咖啡酸是西紅花發(fā)揮抗炎作用的主要活性成分,EGFR、KDR、MAPK12、PTGRC、ERBB2為西紅花發(fā)揮抗炎活性的主要靶點。圖3b 抗炎靶點相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI)

將TTD、CTD和OMIM數(shù)據(jù)庫中篩選得到的抗炎靶點導(dǎo)入Cytoscape3.4.1,得到抗炎-靶點網(wǎng)絡(luò),結(jié)果見圖3a。利用String11.0在線數(shù)據(jù)庫構(gòu)建得到這些靶點的蛋白質(zhì)互相作用關(guān)系(PPI)網(wǎng)絡(luò),結(jié)果見圖3b。圖3a中共有63個與抗炎作用相關(guān)的靶點信息,圖3b為這63個靶點之間的相互作用,其中degree值較大的靶點有腫瘤壞死因子(TNF)、絲裂原活化蛋白激酶12(MAPK12)和人血管內(nèi)皮生長因子受體2(KDR)。表2 有效成分對應(yīng)的靶點信息Table 2 Target information of active components 靶點 通用名稱 Uniprot名稱 度值 Epidermal growth factor receptor EGFR P11511 11 Vascular endothelial growth factor receptor 2 KDR P00918 10 Hepatocyte growth factor receptor MET P08581 8 Mitogen-activated protein kinase 12 MAPK12 P53778 8 Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 TRPA1 O75762 8 Fibroblast growth factor receptor 1 FGFR1 P11362 6 Amine oxidase A MAO A P21397 6 Amine oxidase B MAO B Q14994 6 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 ERBB2 P04626 6 Vascular endothelial growth factor receptor 3 FLT4 P35916 6 Cyclic ADP-ribose hydrolase 1 CD38 P28907 5 E-selectin SELE P16581 5 Macrophage migration inhibitory factor MIF Q14174 5 Prostaglandin G/H synthase 2 COX-2 P35354 5 Fatty acid synthase FASN P49327 5 Alcohol dehydrogenase 1A ADH1A P07327 4 Carbonic anhydrase 1 CA1 P00915 4 Muscarinic acetylcholine receptor M1 CHRM1 P11229 4 Muscarinic acetylcholine receptor M2 CHRM2 P08172 4

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]國內(nèi)外不同來源藏紅花的品質(zhì)評價[J]. 林東昊,茅人飛.  食品研究與開發(fā). 2019(13)
[2]網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)與中醫(yī)藥現(xiàn)代研究的若干進(jìn)展[J]. 張彥瓊,李梢.  中國藥理學(xué)與毒理學(xué)雜志. 2015(06)
[3]西紅花的化學(xué)成分和藥理活性研究進(jìn)展[J]. 王平,童應(yīng)鵬,陶露霞,邵云東,劉曉平.  中草藥. 2014(20)



本文編號：3352738