基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對(duì)接技術(shù)探討化濕敗毒方治療新型冠狀病毒肺炎的分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2021-08-17 15:56
目的:從網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)角度探討化濕敗毒方治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)的作用機(jī)制,為其臨床治療、新藥開(kāi)發(fā)提供參考。方法:在TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出化濕敗毒方的藥物有效活性成分,并提取其作用靶點(diǎn),在GeneCards數(shù)據(jù)庫(kù)檢索COVID-19相關(guān)疾病靶點(diǎn),將藥物及疾病的共同靶點(diǎn)導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫(kù)獲取靶標(biāo)蛋白互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,通過(guò)Cytoscape3.7.2軟件構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)、"中藥-潛在活性成分-潛在靶標(biāo)-疾病"網(wǎng)絡(luò),并利用Cytoscape3.7.2軟件、R軟件及相應(yīng)程序包進(jìn)行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。同時(shí)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。結(jié)果:檢索得到269個(gè)藥物活性成分和2 629個(gè)藥物靶標(biāo),其中藥物疾病共同靶標(biāo)49個(gè),GO功能富集分析涉及對(duì)脂多糖的反應(yīng)、氧化應(yīng)激反應(yīng)及γ-干擾素介導(dǎo)的信號(hào)通路調(diào)控等條目,KEGG通路富集分析涉及AGE-RAGE通路、TNF信號(hào)通路、NF-κB通路、RIG-I樣受體信號(hào)通路等。分子對(duì)接結(jié)果表明槲皮素、木犀草素和山柰酚與COVID-19相關(guān)蛋白及作用靶點(diǎn)具有較強(qiáng)的結(jié)合活性,可能起到類(lèi)似于抗病毒藥物的治療效果。結(jié)論:化濕敗毒方含槲皮素、木犀草素和山柰...
【文章來(lái)源】:中藥藥理與臨床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
GO生物學(xué)功能富集分析
利用GeneCards生物數(shù)據(jù)庫(kù)檢索得到319 個(gè)COVID-19疾病靶點(diǎn),查重后剩262 個(gè)。借助R軟件在239 個(gè)藥物靶點(diǎn)與262 個(gè)疾病靶點(diǎn)中找出藥物-疾病共同靶點(diǎn),即化濕敗毒方治療COVID-19的潛在靶點(diǎn),共49 個(gè),結(jié)果展示見(jiàn)圖1。2.3 化濕敗毒方治療COVID-19的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
化濕敗毒方治療COVID-19的PPI網(wǎng)絡(luò)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]從“雜氣致疫”談新型冠狀病毒肺炎證治[J]. 史光偉,梁永林,蘇穎. 中醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(06)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接法探尋黃連解毒湯治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 王琰,吳杰,向凈勻,李慧敏,周爽,王國(guó)全,史永恒,王斌. 中藥藥理與臨床. 2020(02)
[3]基于TCMIP V2.0探析新型冠狀病毒肺炎全病程中醫(yī)證候和推薦方劑的科學(xué)內(nèi)涵[J]. 許海玉,張彥瓊,秦月雯,趙海譽(yù),王萍,劉峰. 中國(guó)中藥雜志. 2020(07)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
[5]隱丹參酮通過(guò)抑制p38 MAPK/NF-κB通路改善哮喘氣道炎癥[J]. 李俊峰,王重陽(yáng),徐暢,李莉,王知廣,李良昌,延光海. 中藥新藥與臨床藥理. 2020(01)
[6]IL-1β、TNF-α聯(lián)合IL-6對(duì)胃癌的診斷價(jià)值[J]. 董志強(qiáng),劉美榮,任秀梅. 實(shí)用癌癥雜志. 2020(01)
[7]大黃的化學(xué)成分和藥理研究進(jìn)展[J]. 金麗霞,金麗軍,欒仲秋,劉聰,潘超. 中醫(yī)藥信息. 2020(01)
[8]中藥阻斷NF-κB信號(hào)通路抑制Ⅰ型單純皰疹病毒感染的研究進(jìn)展[J]. 綦魯博,張保平. 中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2020(01)
[9]腫瘤壞死因子在惡性胸水局部治療中的應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 俞玲,徐興祥,許文景. 中華肺部疾病雜志(電子版). 2019(06)
[10]茯苓的化學(xué)成分、藥理作用及臨床應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 崔鶴蓉,王睿林,郭文博,王鵬龍,馬濤,李瑞生,賈天柱,何塞·路易斯·里奧斯,張振秋,雷海民. 西北藥學(xué)雜志. 2019(05)
博士論文
[1]RIG-I樣受體在登革病毒誘導(dǎo)的I型干擾素反應(yīng)中的作用[D]. 秦成峰.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009
[2]卡介苗、γ-干擾素及維生素A對(duì)毛細(xì)支氣管炎患兒免疫功能的影響[D]. 劉雅麗.重慶醫(yī)科大學(xué) 2002
本文編號(hào):3348061
【文章來(lái)源】:中藥藥理與臨床. 2020,36(03)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【部分圖文】:
GO生物學(xué)功能富集分析
利用GeneCards生物數(shù)據(jù)庫(kù)檢索得到319 個(gè)COVID-19疾病靶點(diǎn),查重后剩262 個(gè)。借助R軟件在239 個(gè)藥物靶點(diǎn)與262 個(gè)疾病靶點(diǎn)中找出藥物-疾病共同靶點(diǎn),即化濕敗毒方治療COVID-19的潛在靶點(diǎn),共49 個(gè),結(jié)果展示見(jiàn)圖1。2.3 化濕敗毒方治療COVID-19的PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建
化濕敗毒方治療COVID-19的PPI網(wǎng)絡(luò)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]從“雜氣致疫”談新型冠狀病毒肺炎證治[J]. 史光偉,梁永林,蘇穎. 中醫(yī)學(xué)報(bào). 2020(06)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接法探尋黃連解毒湯治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 王琰,吳杰,向凈勻,李慧敏,周爽,王國(guó)全,史永恒,王斌. 中藥藥理與臨床. 2020(02)
[3]基于TCMIP V2.0探析新型冠狀病毒肺炎全病程中醫(yī)證候和推薦方劑的科學(xué)內(nèi)涵[J]. 許海玉,張彥瓊,秦月雯,趙海譽(yù),王萍,劉峰. 中國(guó)中藥雜志. 2020(07)
[4]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao. Science China(Life Sciences). 2020(03)
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[6]IL-1β、TNF-α聯(lián)合IL-6對(duì)胃癌的診斷價(jià)值[J]. 董志強(qiáng),劉美榮,任秀梅. 實(shí)用癌癥雜志. 2020(01)
[7]大黃的化學(xué)成分和藥理研究進(jìn)展[J]. 金麗霞,金麗軍,欒仲秋,劉聰,潘超. 中醫(yī)藥信息. 2020(01)
[8]中藥阻斷NF-κB信號(hào)通路抑制Ⅰ型單純皰疹病毒感染的研究進(jìn)展[J]. 綦魯博,張保平. 中國(guó)醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2020(01)
[9]腫瘤壞死因子在惡性胸水局部治療中的應(yīng)用及進(jìn)展[J]. 俞玲,徐興祥,許文景. 中華肺部疾病雜志(電子版). 2019(06)
[10]茯苓的化學(xué)成分、藥理作用及臨床應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 崔鶴蓉,王睿林,郭文博,王鵬龍,馬濤,李瑞生,賈天柱,何塞·路易斯·里奧斯,張振秋,雷海民. 西北藥學(xué)雜志. 2019(05)
博士論文
[1]RIG-I樣受體在登革病毒誘導(dǎo)的I型干擾素反應(yīng)中的作用[D]. 秦成峰.中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院 2009
[2]卡介苗、γ-干擾素及維生素A對(duì)毛細(xì)支氣管炎患兒免疫功能的影響[D]. 劉雅麗.重慶醫(yī)科大學(xué) 2002
本文編號(hào):3348061
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