發(fā)布時間：2021-08-14 06:22

　　基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測薏苡仁治療肝癌的有效活性成分及靶點。運用TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選薏苡仁的有效活性成分; ChEMBL及TCMSP數(shù)據(jù)庫預(yù)測薏苡仁有效活性成分對應(yīng)的靶點;運用GeneCards數(shù)據(jù)庫,TTD數(shù)據(jù)庫,GAD數(shù)據(jù)庫和TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選肝癌的相關(guān)靶點;通過Cytoscape軟件建立利用"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶點"網(wǎng)絡(luò)模型; DAVID數(shù)據(jù)庫對"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶點"進行GO注釋分析和KEGG通路分析。通過Discovery Studio軟件對薏苡仁有效活性成分與作用靶點進行分子對接驗證。該研究篩選得到薏苡仁15個有效成分,與肝癌相關(guān)的靶點有13個及相關(guān)信號通路7條。網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果表明薏苡仁可能通過作用于TERT,CYP3A4,NR1H3,ALDH1A1,ESR1,SLCO1B3,SRD5A2,CYP1A2,CYP2D6,FABP1等關(guān)鍵靶點發(fā)揮抗肝癌作用。分子對接結(jié)果顯示SRD5A2蛋白與薏苡仁成分對接評分最高,而薏苡仁成分中以sitosterol,stigmasterol,oleic acid 3個成分與SRD5A2蛋白結(jié)合作用最強。該研究初步揭示了薏苡仁治... 

【文章來源】：中國新藥雜志. 2020,29(16)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

薏苡仁有效活性成分-靶點網(wǎng)絡(luò)圖

在Gene Card中與肝癌有關(guān)的靶點共737個，在TCMSP中與肝癌相關(guān)的靶點有1個，在TTD中與肝癌有關(guān)的靶點共11個，在GAD中與肝癌有關(guān)的靶點共76個，將4種方法得到的靶點取并集，即確定為肝癌相關(guān)的靶點。采用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建AD蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。4薏苡仁有效活性成分-肝癌靶點網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建與分析

利用GAD,TCMSP,TTD和Gene Cards數(shù)據(jù)庫檢索肝癌相關(guān)靶點，并與ChEMBL數(shù)據(jù)庫篩選靶點結(jié)果進行篩選比對，其中油酸甲酯(methyl oleate)并無肝癌相關(guān)靶點，整理剩余6個活性成分調(diào)控結(jié)果，可知共調(diào)控13個肝癌相關(guān)靶點。運用Cytoscape3.5.1構(gòu)建“成分-靶點-疾病”網(wǎng)絡(luò)，其中橢圓形節(jié)點是薏苡仁抗肝癌的有效活性成分共6個，菱形節(jié)點是薏苡仁有效活性成分抗肝癌的靶點共13個，紅色節(jié)點為肝癌疾病(見表2和圖3)。對網(wǎng)絡(luò)節(jié)點進行網(wǎng)絡(luò)拓撲分析，節(jié)點的大小是依據(jù)網(wǎng)絡(luò)中的dgree而設(shè)定，即節(jié)點越大對應(yīng)的靶基因的dgree值越大(見表3)。5通路富集分析

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3341946