基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)預(yù)測薏苡仁治療肝癌的有效活性成分及靶點(diǎn)。運(yùn)用TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選薏苡仁的有效活性成分; ChEMBL及TCMSP數(shù)據(jù)庫預(yù)測薏苡仁有效活性成分對(duì)應(yīng)的靶點(diǎn);運(yùn)用GeneCards數(shù)據(jù)庫,TTD數(shù)據(jù)庫,GAD數(shù)據(jù)庫和TCMSP數(shù)據(jù)庫篩選肝癌的相關(guān)靶點(diǎn);通過Cytoscape軟件建立利用"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)模型; DAVID數(shù)據(jù)庫對(duì)"薏苡仁有效活性成分-肝癌疾病靶點(diǎn)"進(jìn)行GO注釋分析和KEGG通路分析。通過Discovery Studio軟件對(duì)薏苡仁有效活性成分與作用靶點(diǎn)進(jìn)行分子對(duì)接驗(yàn)證。該研究篩選得到薏苡仁15個(gè)有效成分,與肝癌相關(guān)的靶點(diǎn)有13個(gè)及相關(guān)信號(hào)通路7條。網(wǎng)絡(luò)分析結(jié)果表明薏苡仁可能通過作用于TERT,CYP3A4,NR1H3,ALDH1A1,ESR1,SLCO1B3,SRD5A2,CYP1A2,CYP2D6,FABP1等關(guān)鍵靶點(diǎn)發(fā)揮抗肝癌作用。分子對(duì)接結(jié)果顯示SRD5A2蛋白與薏苡仁成分對(duì)接評(píng)分最高,而薏苡仁成分中以sitosterol,stigmasterol,oleic acid 3個(gè)成分與SRD5A2蛋白結(jié)合作用最強(qiáng)。該研究初步揭示了薏苡仁治... 

【文章來源】：中國新藥雜志. 2020,29(16)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

薏苡仁有效活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖

在Gene Card中與肝癌有關(guān)的靶點(diǎn)共737個(gè)，在TCMSP中與肝癌相關(guān)的靶點(diǎn)有1個(gè)，在TTD中與肝癌有關(guān)的靶點(diǎn)共11個(gè)，在GAD中與肝癌有關(guān)的靶點(diǎn)共76個(gè)，將4種方法得到的靶點(diǎn)取并集，即確定為肝癌相關(guān)的靶點(diǎn)。采用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建AD蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖(見圖2)。4薏苡仁有效活性成分-肝癌靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖構(gòu)建與分析

利用GAD,TCMSP,TTD和Gene Cards數(shù)據(jù)庫檢索肝癌相關(guān)靶點(diǎn)，并與ChEMBL數(shù)據(jù)庫篩選靶點(diǎn)結(jié)果進(jìn)行篩選比對(duì)，其中油酸甲酯(methyl oleate)并無肝癌相關(guān)靶點(diǎn)，整理剩余6個(gè)活性成分調(diào)控結(jié)果，可知共調(diào)控13個(gè)肝癌相關(guān)靶點(diǎn)。運(yùn)用Cytoscape3.5.1構(gòu)建“成分-靶點(diǎn)-疾病”網(wǎng)絡(luò)，其中橢圓形節(jié)點(diǎn)是薏苡仁抗肝癌的有效活性成分共6個(gè)，菱形節(jié)點(diǎn)是薏苡仁有效活性成分抗肝癌的靶點(diǎn)共13個(gè)，紅色節(jié)點(diǎn)為肝癌疾病(見表2和圖3)。對(duì)網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治�，�?jié)點(diǎn)的大小是依據(jù)網(wǎng)絡(luò)中的dgree而設(shè)定，即節(jié)點(diǎn)越大對(duì)應(yīng)的靶基因的dgree值越大(見表3)。5通路富集分析

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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本文編號(hào)：3341946