六神丸干預(yù)新型冠狀肺炎的靶點(diǎn)挖掘及分子對(duì)接研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-23 12:23
目的運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)數(shù)據(jù)挖掘方法,探討六神丸干預(yù)新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)藥效的潛在分子機(jī)制。方法利用BATMAN、Drugbank和GeneCards等數(shù)據(jù)庫(kù)及相關(guān)文獻(xiàn)篩選六神丸活性成分和潛在活性靶點(diǎn)以及疾病相關(guān)作用靶點(diǎn)。通過(guò)STRING、Metascape構(gòu)建靶點(diǎn)的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)和功能注釋。采用SYBYL-X2.1.1進(jìn)行分子對(duì)接分析。結(jié)果共篩選出47個(gè)有效成分和877個(gè)對(duì)應(yīng)靶點(diǎn),在進(jìn)一步與435個(gè)疾病靶點(diǎn)交集后得出73個(gè)COVID-19相關(guān)基因(如EGFR、IL6、MAPK1、MAPK3、TNF等)。GO和KEGG通路分析表明這些基因功能與癌癥相關(guān)通路、百日咳通路、細(xì)胞因子活性、MAPK路徑以及皰疹病毒感染路徑相關(guān)。從與ACE2和3CL水解酶的分子對(duì)接分析中得出六神丸多組分能直接作用于病毒入侵和復(fù)制。結(jié)論六神丸干預(yù)COVID-19與其抗病毒、抑制炎癥反應(yīng)、抑制體液滲出、改善血液循環(huán)等路徑密切相關(guān)。
【文章來(lái)源】:南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
六神丸干預(yù)COVID-19成分-靶點(diǎn)圖
六神丸干預(yù)COVID-19相關(guān)靶點(diǎn)的功能注釋
GO通路分析(圖3B~D):分子功能(MF)涉及592條通路,主要富集條目為磷酸酶結(jié)合(Phosphatase binding);磷酸轉(zhuǎn)移酶活性,醇基受體(Phosphotransferase activity, Alcohol group as acceptor);磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸-5-激酶活性(Phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate5-kinase activity);病毒受體活性(Virus receptor activity);細(xì)胞因子受體結(jié)合(Cytokine receptor binding)等。在生物過(guò)程(BP)涉及3 689條通路,主要富集條目為類二十烷酸代謝過(guò)程(Icosanoid metabolic process);激素水平的調(diào)節(jié)(Regulation of hormone levels);白細(xì)胞遷移(Leukocyte migration);細(xì)胞因子介導(dǎo)的信號(hào)通路(Cytokine-mediated signaling pathway);調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附(Regulation of cell adhesion)等。在細(xì)胞組成(CC)涉及350條通路,主要富集條目在膜筏(Membrane raft)、膜面(Side membrane)和磷脂酰肌醇3-激酶復(fù)合物(Phosphatidylinositol3-kinase complex)中。這些路徑可能是六神丸活性成分干預(yù)COVID-19的抗病毒和抗炎的藥理學(xué)基礎(chǔ)。圖3 六神丸干預(yù)COVID-19相關(guān)靶點(diǎn)的功能注釋
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于新冠肺炎病理生理機(jī)制的治療策略[J]. 高鈺琪. 中國(guó)病理生理雜志. 2020(03)
[2]從“寒濕疫”角度探討新型冠狀病毒肺炎的中醫(yī)藥防治策略[J]. 仝小林,李修洋,趙林華,李青偉,楊映映,林軼群,丁齊又,雷燁,王強(qiáng),宋斌,劉文科,沈仕偉,朱向東,黃飛劍,周毅德. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[3]1-磷酸鞘氨醇與相關(guān)疾病的研究進(jìn)展[J]. 張婧瑤,劉衛(wèi)東,劉函曄,李良昌,延光海,劉恒辰,崔弘. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2019(03)
[4]五味消毒飲治療肺癌患者表皮生長(zhǎng)因子受體酪氨酸激酶抑制劑相關(guān)皮疹30例臨床觀察[J]. 陳學(xué)武,姜靖雯,林海峰. 中醫(yī)雜志. 2016(10)
[5]右美托咪定對(duì)內(nèi)毒素誘導(dǎo)的急性肺損傷大鼠p38絲裂原激活的蛋白激酶的活化及炎癥反應(yīng)的影響[J]. 楊穎,王鵬,封光,劉功儉. 國(guó)際麻醉學(xué)與復(fù)蘇雜志. 2014 (03)
[6]六神丸抗炎鎮(zhèn)痛活性的主藥分析研究[J]. 馬宏躍,寇俊萍,余伯陽(yáng). 江蘇中醫(yī)藥. 2010(02)
博士論文
[1]小腸缺血再灌注后TNF-α誘導(dǎo)的Caspase-8與NF-κB在肺損傷中的作用[D]. 陳玉強(qiáng).吉林大學(xué) 2011
本文編號(hào):3244933
【文章來(lái)源】:南京中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2020,36(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
六神丸干預(yù)COVID-19成分-靶點(diǎn)圖
六神丸干預(yù)COVID-19相關(guān)靶點(diǎn)的功能注釋
GO通路分析(圖3B~D):分子功能(MF)涉及592條通路,主要富集條目為磷酸酶結(jié)合(Phosphatase binding);磷酸轉(zhuǎn)移酶活性,醇基受體(Phosphotransferase activity, Alcohol group as acceptor);磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸-5-激酶活性(Phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate5-kinase activity);病毒受體活性(Virus receptor activity);細(xì)胞因子受體結(jié)合(Cytokine receptor binding)等。在生物過(guò)程(BP)涉及3 689條通路,主要富集條目為類二十烷酸代謝過(guò)程(Icosanoid metabolic process);激素水平的調(diào)節(jié)(Regulation of hormone levels);白細(xì)胞遷移(Leukocyte migration);細(xì)胞因子介導(dǎo)的信號(hào)通路(Cytokine-mediated signaling pathway);調(diào)節(jié)細(xì)胞粘附(Regulation of cell adhesion)等。在細(xì)胞組成(CC)涉及350條通路,主要富集條目在膜筏(Membrane raft)、膜面(Side membrane)和磷脂酰肌醇3-激酶復(fù)合物(Phosphatidylinositol3-kinase complex)中。這些路徑可能是六神丸活性成分干預(yù)COVID-19的抗病毒和抗炎的藥理學(xué)基礎(chǔ)。圖3 六神丸干預(yù)COVID-19相關(guān)靶點(diǎn)的功能注釋
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于新冠肺炎病理生理機(jī)制的治療策略[J]. 高鈺琪. 中國(guó)病理生理雜志. 2020(03)
[2]從“寒濕疫”角度探討新型冠狀病毒肺炎的中醫(yī)藥防治策略[J]. 仝小林,李修洋,趙林華,李青偉,楊映映,林軼群,丁齊又,雷燁,王強(qiáng),宋斌,劉文科,沈仕偉,朱向東,黃飛劍,周毅德. 中醫(yī)雜志. 2020(06)
[3]1-磷酸鞘氨醇與相關(guān)疾病的研究進(jìn)展[J]. 張婧瑤,劉衛(wèi)東,劉函曄,李良昌,延光海,劉恒辰,崔弘. 生理科學(xué)進(jìn)展. 2019(03)
[4]五味消毒飲治療肺癌患者表皮生長(zhǎng)因子受體酪氨酸激酶抑制劑相關(guān)皮疹30例臨床觀察[J]. 陳學(xué)武,姜靖雯,林海峰. 中醫(yī)雜志. 2016(10)
[5]右美托咪定對(duì)內(nèi)毒素誘導(dǎo)的急性肺損傷大鼠p38絲裂原激活的蛋白激酶的活化及炎癥反應(yīng)的影響[J]. 楊穎,王鵬,封光,劉功儉. 國(guó)際麻醉學(xué)與復(fù)蘇雜志. 2014 (03)
[6]六神丸抗炎鎮(zhèn)痛活性的主藥分析研究[J]. 馬宏躍,寇俊萍,余伯陽(yáng). 江蘇中醫(yī)藥. 2010(02)
博士論文
[1]小腸缺血再灌注后TNF-α誘導(dǎo)的Caspase-8與NF-κB在肺損傷中的作用[D]. 陳玉強(qiáng).吉林大學(xué) 2011
本文編號(hào):3244933
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