基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的鴉膽子治療食管癌的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-07 12:36
目的基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探究鴉膽子治療食管癌可能的作用機(jī)制。方法使用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)分析平臺(tái)(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)獲取鴉膽子有效成分及相關(guān)靶點(diǎn),使用GeneCards、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)獲取食管癌相關(guān)靶基因,使用Cytoscape 3.7.1軟件做出"有效成分-靶點(diǎn)"網(wǎng)絡(luò)圖,使用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建靶蛋白的蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)圖,利用R軟件進(jìn)行基因功能及通路富集分析。結(jié)果本研究共篩選出15個(gè)鴉膽子的有效成分,并找到了40個(gè)與其對(duì)應(yīng)的有效成分靶基因,其中有38個(gè)靶基因同時(shí)與食管癌相關(guān)。通過(guò)PPI網(wǎng)絡(luò)分析最終發(fā)現(xiàn)了EGFR、CASP3、CCND1、VEGFA、ERBB2、IL6六個(gè)核心基因,其主要富集到與調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞周期、細(xì)胞凋亡、腫瘤內(nèi)血管生成有關(guān)的通路。結(jié)論本文初步篩選了鴉膽子治療食管癌的核心基因,發(fā)現(xiàn)了...
【文章來(lái)源】:中醫(yī)腫瘤學(xué)雜志. 2020,2(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
鴉膽子與食管癌相關(guān)的“有效成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖
把我們獲得的38個(gè)同時(shí)與鴉膽子和食管癌相關(guān)的靶基因利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)(圖2)。圖3展示的是靶基因蛋白之間的交互次數(shù)情況,其中次數(shù)越多,意味著靶基因在PPI網(wǎng)絡(luò)中起到更加關(guān)鍵的作用。由圖可知,PPI網(wǎng)絡(luò)圖中的核心基因?yàn)镋GFR、CASP3、CCND1、VEGFA、ERBB2、IL6。圖3 靶基因蛋白交互情況圖
靶基因蛋白交互情況圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鴉膽子油乳抗膀胱癌的分子機(jī)制及治療的研究進(jìn)展[J]. 宋莉平,王宇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2020(10)
[2]鴉膽子油乳注射液聯(lián)合放化療對(duì)中晚期食管癌患者淋巴細(xì)胞CD4+、CD8+的影響[J]. 賴奕靜,廖澤飛,王耿杰. 世界中醫(yī)藥. 2019(11)
[3]鴉膽子油聯(lián)合放療治療食管癌的有效性和安全性的Meta分析[J]. 楊澤,李陽(yáng),萬(wàn)小亞,周建國(guó),柏玉舉,馬虎,石磊,李寧. 重慶醫(yī)學(xué). 2016(14)
[4]鴉膽子油乳注射液治療晚期肝癌的臨床療效[J]. 盧藝濤,董穎,高承志. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2005(07)
[5]鴉膽子油乳具有多藥耐藥逆轉(zhuǎn)和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ抑制作用[J]. 湯濤,蒙凌華,陳陵際,丁健. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2001(05)
[6]鴉膽子的研究概況[J]. 楊峰,于紅,王鳳禮,田玉峰. 黑龍江醫(yī)藥. 1998(02)
本文編號(hào):3216586
【文章來(lái)源】:中醫(yī)腫瘤學(xué)雜志. 2020,2(03)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
鴉膽子與食管癌相關(guān)的“有效成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò)圖
把我們獲得的38個(gè)同時(shí)與鴉膽子和食管癌相關(guān)的靶基因利用STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)(圖2)。圖3展示的是靶基因蛋白之間的交互次數(shù)情況,其中次數(shù)越多,意味著靶基因在PPI網(wǎng)絡(luò)中起到更加關(guān)鍵的作用。由圖可知,PPI網(wǎng)絡(luò)圖中的核心基因?yàn)镋GFR、CASP3、CCND1、VEGFA、ERBB2、IL6。圖3 靶基因蛋白交互情況圖
靶基因蛋白交互情況圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鴉膽子油乳抗膀胱癌的分子機(jī)制及治療的研究進(jìn)展[J]. 宋莉平,王宇. 現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2020(10)
[2]鴉膽子油乳注射液聯(lián)合放化療對(duì)中晚期食管癌患者淋巴細(xì)胞CD4+、CD8+的影響[J]. 賴奕靜,廖澤飛,王耿杰. 世界中醫(yī)藥. 2019(11)
[3]鴉膽子油聯(lián)合放療治療食管癌的有效性和安全性的Meta分析[J]. 楊澤,李陽(yáng),萬(wàn)小亞,周建國(guó),柏玉舉,馬虎,石磊,李寧. 重慶醫(yī)學(xué). 2016(14)
[4]鴉膽子油乳注射液治療晚期肝癌的臨床療效[J]. 盧藝濤,董穎,高承志. 現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2005(07)
[5]鴉膽子油乳具有多藥耐藥逆轉(zhuǎn)和拓?fù)洚悩?gòu)酶Ⅱ抑制作用[J]. 湯濤,蒙凌華,陳陵際,丁健. 中國(guó)藥理學(xué)通報(bào). 2001(05)
[6]鴉膽子的研究概況[J]. 楊峰,于紅,王鳳禮,田玉峰. 黑龍江醫(yī)藥. 1998(02)
本文編號(hào):3216586
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