目的:基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法探討半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)抗胃癌的相關(guān)作用機(jī)制。方法:利用TCMSP數(shù)據(jù)庫獲得半邊蓮和半枝蓮的化學(xué)成分及對(duì)應(yīng)作用靶點(diǎn)基因,檢索Gene Cards和OMIM數(shù)據(jù)庫獲得疾病胃癌相關(guān)靶點(diǎn)基因,然后取兩者的交集,得到半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)作用于胃癌的預(yù)測靶基因。利用Cytoscape 3.7.1軟件構(gòu)建半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)化合物-作用靶點(diǎn)-疾病三者相互關(guān)系網(wǎng)絡(luò),采用STRING數(shù)據(jù)庫對(duì)半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)作用于胃癌的預(yù)測靶基因進(jìn)行蛋白互作網(wǎng)絡(luò)分析,利用Cytoscape 3.7.1軟件的插件Cytohubba篩選出關(guān)鍵基因（hub基因）,并利用ONCOMINE數(shù)據(jù)庫分析關(guān)鍵基因在胃癌中的表達(dá)情況。利用在線工具DAVID進(jìn)行GO功能富集分析和利用Cytoscape 3.7.1軟件的Clue GO插件進(jìn)行KEGG信號(hào)通路富集分析。結(jié)果:共篩選出半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)作用于胃癌的預(yù)測靶基因81個(gè),關(guān)鍵靶基因（hub基因）6個(gè),這些關(guān)鍵基因在ONCOMINE數(shù)據(jù)庫的胃癌樣本和正常樣本中存在顯著的表達(dá)差異。GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、凋亡過程的負(fù)調(diào)控等生物過程;K... 

【文章來源】：藥物分析雜志. 2020,40(07)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：11 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數(shù)據(jù)庫及軟件
    1.2 半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)的化學(xué)成分及作用靶點(diǎn)篩選
    1.3 疾病胃癌靶點(diǎn)篩選
    1.4 網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析
    1.5 基因本體（gene ontology,GO）功能富集分析
    1.6 京都基因和基因組百科全書（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析
2 結(jié)果
    2.1 半邊蓮-半枝蓮藥對(duì)化學(xué)成分及作用靶點(diǎn)篩選
    2.2 胃癌靶點(diǎn)篩選
    2.3 網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建及分析
    2.4靶點(diǎn)蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)（PPI網(wǎng)絡(luò)）構(gòu)建及關(guān)鍵基因（hub基因）篩選
    2.5 基因本體（GO）功能富集分析
    2.6 KEGG通路富集分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3184424