基于GC-MS與網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的青皮揮發(fā)油防治阿爾茨海默癥的活性成分及作用機制研究
發(fā)布時間:2021-04-01 03:27
目的:預(yù)測青皮揮發(fā)油防治阿爾茨海默。ˋD)的主要活性成分和潛在作用靶點。方法:采用氣質(zhì)聯(lián)用技術(shù)(GC-MS)分析青皮揮發(fā)油化學(xué)成分,并借助NIST 11.L數(shù)據(jù)庫和人工數(shù)據(jù)解析進行成分的結(jié)構(gòu)鑒定。借助中藥系統(tǒng)藥理學(xué)分析平臺(TCMSP)、PharmMapper數(shù)據(jù)庫等預(yù)測青皮揮發(fā)油活性成分及其對應(yīng)靶點,借助GeneCards數(shù)據(jù)庫、人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫等挖掘AD相關(guān)靶點;利用Venny 2.1.0軟件映射以獲取青皮揮發(fā)油防治AD的直接靶點;借助STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape 7.2.1軟件挖掘核心節(jié)點,利用Venny 2.1.0軟件映射并去重后獲取青皮揮發(fā)油防治AD的間接靶點;借助DAVID 6.7數(shù)據(jù)庫對上述直接和間接靶點(即作用靶點)進行基因本體(GO)功能富集和KEGG通路富集分析;采用Cytoscape 7.2.1軟件,以節(jié)點度值、介數(shù)中心度、緊密中心度為指標,對青皮揮發(fā)油"活性成分-作用靶點"網(wǎng)絡(luò)進行拓撲學(xué)分析,挖掘關(guān)鍵成分和關(guān)鍵靶點。結(jié)果與結(jié)論:GC-MS法共分離并鑒定出青皮揮發(fā)油化學(xué)成分40個,均為活性成分,包括右旋檸檬烯、γ-萜品烯等。共挖掘出活性成分對應(yīng)靶點...
【文章來源】:中國藥房. 2020,31(17)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
青皮揮發(fā)油GC-MS總離子流圖
GO功能富集結(jié)果顯示,89個作用靶點主要涉及GO功能過程564個(P<0.05)。其中,生物過程富集440個,以有機物的反應(yīng)(Response to organic substance)、對內(nèi)生刺激的反應(yīng)(Response to endogenous stimulus)、細胞內(nèi)信號級聯(lián)(Intracellular signaling cascade)等為主;細胞組分富集43個,以細胞分數(shù)(Cell fraction)、軸突(Axon)、胞漿(Cytosol)、不溶性組分(Insoluble fraction)等為主;分子功能富集81個,以胺受體活性(Amine receptor activity)、蛋白激酶活性(Protein kinase activity)、胺結(jié)合(Amine binding)、腎上腺素受體活性(Adrenoceptor activity)等為主,詳見圖3。圖3 青皮揮發(fā)油防治AD作用靶點的GO功能富集柱狀圖
圖2 青皮揮發(fā)油防治AD作用靶點KEGG通路富集結(jié)果顯示,89個作用靶點主要富集于19條通路上(P<0.05),以癌癥通路(Pathways in cancer)、局灶性粘連(Focal adhesion)、結(jié)直腸癌(Colorectal cancer)、鈣信號通路(Calcium signaling pathway)、神經(jīng)營養(yǎng)素信號通路(Neurotrophin signaling pathway)等為主,詳見圖4。
本文編號:3112607
【文章來源】:中國藥房. 2020,31(17)北大核心
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
青皮揮發(fā)油GC-MS總離子流圖
GO功能富集結(jié)果顯示,89個作用靶點主要涉及GO功能過程564個(P<0.05)。其中,生物過程富集440個,以有機物的反應(yīng)(Response to organic substance)、對內(nèi)生刺激的反應(yīng)(Response to endogenous stimulus)、細胞內(nèi)信號級聯(lián)(Intracellular signaling cascade)等為主;細胞組分富集43個,以細胞分數(shù)(Cell fraction)、軸突(Axon)、胞漿(Cytosol)、不溶性組分(Insoluble fraction)等為主;分子功能富集81個,以胺受體活性(Amine receptor activity)、蛋白激酶活性(Protein kinase activity)、胺結(jié)合(Amine binding)、腎上腺素受體活性(Adrenoceptor activity)等為主,詳見圖3。圖3 青皮揮發(fā)油防治AD作用靶點的GO功能富集柱狀圖
圖2 青皮揮發(fā)油防治AD作用靶點KEGG通路富集結(jié)果顯示,89個作用靶點主要富集于19條通路上(P<0.05),以癌癥通路(Pathways in cancer)、局灶性粘連(Focal adhesion)、結(jié)直腸癌(Colorectal cancer)、鈣信號通路(Calcium signaling pathway)、神經(jīng)營養(yǎng)素信號通路(Neurotrophin signaling pathway)等為主,詳見圖4。
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