目的運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對接方法研究復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療口腔扁平苔蘚的物質(zhì)基礎(chǔ)與潛在的分子機(jī)制。方法從TCMSP數(shù)據(jù)庫中得出復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療口腔扁平苔蘚的作用靶標(biāo),對共有基因構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)。構(gòu)建"疾病-活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)"圖,并通過基于R語言的clusterprofiler進(jìn)行GO和KEGG通路富集分析。將篩選出的復(fù)方絞股藍(lán)膠囊活性成分與主要靶點(diǎn)進(jìn)行分子對接。結(jié)果從復(fù)方絞股藍(lán)膠囊中篩選出15個活性成分,包括絞股藍(lán)皂苷類成分、燈盞乙素、槲皮素和鼠李素等,這些活性成分可與口腔扁平苔蘚相關(guān)的54個潛在靶點(diǎn)發(fā)生相互作用,可能通過調(diào)節(jié)內(nèi)分泌抵抗、絲裂原活化蛋白激酶信號通路、低氧誘導(dǎo)因子1信號通路、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用等信號通路來發(fā)揮治療作用。結(jié)論應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接方法可揭示復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療口腔扁平苔蘚的潛在作用機(jī)制,為進(jìn)一步深入研究提供了理論參考。 

【文章來源】：廣東藥科大學(xué)學(xué)報. 2020,36(04)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療OLP疾病-活性成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖

通過KEGG分析復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療OLP預(yù)測靶點(diǎn)的通路分布，結(jié)果共有14條KEGG代謝通路參與其中，如圖3b所示，主要涉及內(nèi)分泌抵抗(endocrine resistance)、絲裂原活化蛋白激酶信號通路(MAPK signaling pathway)、低氧誘導(dǎo)因子1信號通路(HIF-1 signaling pathway)、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)和EGFR酪氨酸激酶抑制劑耐藥(EGFR tyrosine kinase inhibitor resistance)等。由此可見，復(fù)方絞股藍(lán)膠囊通過調(diào)節(jié)多條代謝通路共同發(fā)揮治療OLP的作用。2.6 復(fù)方絞股藍(lán)膠囊活性成分與靶蛋白分子對接結(jié)果

將篩選出的復(fù)方絞股藍(lán)膠囊中的15個活性成分與排名前4的靶點(diǎn)VEGFA、IL6、AKT1和EGF進(jìn)行分子對接，選取打分最高(affinity數(shù)值最低)的構(gòu)象作為對接構(gòu)象，并利用pymol程序?qū)ζ溥M(jìn)行可視化分析[10]。每種活性成分產(chǎn)生10種對接結(jié)果，結(jié)合能越小說明受體與配體之間的親和力越大，因而選取結(jié)合能較低且構(gòu)象較好的結(jié)果作為分子對接結(jié)果。所有成分與靶點(diǎn)的結(jié)合能均小于-5 kcal/mol，如表3所示。Scutellarin、Gypenoside XII、ginsenoside f2和Gypentonoside A＿qt與4種靶蛋白對接的平均結(jié)合能值最低，其典型對接結(jié)果如圖4所示。圖4 復(fù)方絞股藍(lán)膠囊治療OLP的4個重要靶點(diǎn)的對接分析

【參考文獻(xiàn)】：
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