基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接技術(shù)探討兒童回春顆粒治療呼吸道病毒感染疾病的作用機制
發(fā)布時間:2021-01-02 19:10
目的利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)及分子對接技術(shù)探索兒童回春顆粒治療呼吸道病毒感染疾病的作用機制。方法通過TCMIP、TCMSP、BATMAN-TCM數(shù)據(jù)庫,結(jié)合文獻檢索匯總兒童回春顆粒的藥材歸經(jīng)及其成分信息;在PubChem、Swiss target prediction、GeneCards等數(shù)據(jù)庫查詢呼吸道病毒感染相關(guān)靶點及藥物成分對應(yīng)的靶點;利用DAVID數(shù)據(jù)庫對共有靶點進行KEGG通路和GO生物過程富集分析;用Cytoscape構(gòu)建相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖,根據(jù)網(wǎng)絡(luò)圖分析結(jié)果選取成分、靶點進行分子對接。結(jié)果中藥-歸經(jīng)網(wǎng)絡(luò)分析發(fā)現(xiàn)兒童回春顆粒組方藥材大多歸經(jīng)于肺、胃、肝經(jīng),針對兒童回春顆粒中的126個中藥成分和55個潛在靶點構(gòu)建網(wǎng)絡(luò),KEGG通路分析和GO功能分析表明兒童回春顆粒治療呼吸道病毒感染主要包括癌癥、肝炎相關(guān)通路、PI3K-Akt信號通路、TNF信號通路和HIF-1信號通路等關(guān)鍵通路,主要涉及炎癥反應(yīng)、跨膜受體蛋白酪氨酸激酶信號通路、缺氧反應(yīng)等生物過程。分子對接結(jié)果顯示升麻中的7,8-二羥基升麻醇、升麻素苷、升麻醇與關(guān)鍵靶點PTGS2、MAPK、ACE2和3CL水解酶(3CLpro)的結(jié)合能力較強,...
【文章來源】:中草藥. 2020年19期 北大核心
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
中藥-歸經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
將共有靶點列表導(dǎo)入“DAVID”數(shù)據(jù)庫后得到富集分析結(jié)果,根據(jù)P值大小篩選出前10條KEGG通路(圖3)和前10條GO生物過程條目(表3)。KEGG通路圖中,縱坐標(biāo)代表富集的通路名稱,橫坐標(biāo)為每條通路上的基因數(shù)占共有靶點的比例。圖3 KEGG通路分析氣泡圖
圖2 兒童回春顆粒成分靶點與呼吸道病毒靶點的共有靶點由圖3可知,55個共同靶點主要富集在癌癥相關(guān)通路、乙型肝炎及丙型肝炎相關(guān)通路、PI3K-Akt信號、TNF信號通路以及HIF-1信號通路等;由表3可知,涉及到的主要生物過程包括炎癥反應(yīng)、跨膜受體蛋白酪氨酸激酶信號通路、肽基絲氨酸酸磷酸化、脂多糖介導(dǎo)信號通路、缺氧反應(yīng)、伯格曼膠質(zhì)細胞分化、骨化調(diào)節(jié)、失巢凋亡負性調(diào)節(jié)等生物過程。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]普通型新型冠狀病毒肺炎的中醫(yī)證治探討[J]. 佘茁萃,呂俊,徐玉琪. 湖北中醫(yī)雜志. 2020(05)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接法探尋達原飲治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 宗陽,丁美林,賈可可,馬世堂,居文政. 中草藥. 2020(04)
[3]新型冠狀病毒肺炎中醫(yī)診療/防治方案對中醫(yī)臨床指南制定的思考[J]. 馮雪,段笑嬌,張冰,薩日娜,蘇祥飛,馬思遠,李袁,郭宇博. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2020(14)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接法探索藿香正氣口服液預(yù)防新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物研究[J]. 鄧燕君,劉博文,賀楨翔,劉濤,鄭榮蕾,楊安迪,黃澳,李玉婷,徐玉玲. 中草藥. 2020(05)
[5]苦參多路徑抗冠狀病毒的機制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[6]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2020(01)
[7]中藥整合藥理學(xué)計算平臺的開發(fā)與應(yīng)用[J]. 許海玉,劉振明,付巖,張彥瓊,于建軍,郭非非,唐仕歡,呂傳宇,蘇瑾,崔如意,楊洪軍. 中國中藥雜志. 2017(18)
[8]病毒性肺炎的診治進展[J]. 林秀慧,張根生,崔巍. 中國現(xiàn)代醫(yī)生. 2017(05)
[9]糖皮質(zhì)激素治療病毒性肺炎利與弊[J]. 楊加偉,徐金富. 中國實用內(nèi)科雜志. 2016(02)
[10]升麻屬植物有效成分抗病毒作用研究進展[J]. 張麗蓉,鄢連和. 山東中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2015(04)
碩士論文
[1]荊防散正丁醇部位抗炎作用的NF-κB信號通路機制研究[D]. 桑文濤.成都中醫(yī)藥大學(xué) 2017
本文編號:2953473
【文章來源】:中草藥. 2020年19期 北大核心
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
中藥-歸經(jīng)網(wǎng)絡(luò)
將共有靶點列表導(dǎo)入“DAVID”數(shù)據(jù)庫后得到富集分析結(jié)果,根據(jù)P值大小篩選出前10條KEGG通路(圖3)和前10條GO生物過程條目(表3)。KEGG通路圖中,縱坐標(biāo)代表富集的通路名稱,橫坐標(biāo)為每條通路上的基因數(shù)占共有靶點的比例。圖3 KEGG通路分析氣泡圖
圖2 兒童回春顆粒成分靶點與呼吸道病毒靶點的共有靶點由圖3可知,55個共同靶點主要富集在癌癥相關(guān)通路、乙型肝炎及丙型肝炎相關(guān)通路、PI3K-Akt信號、TNF信號通路以及HIF-1信號通路等;由表3可知,涉及到的主要生物過程包括炎癥反應(yīng)、跨膜受體蛋白酪氨酸激酶信號通路、肽基絲氨酸酸磷酸化、脂多糖介導(dǎo)信號通路、缺氧反應(yīng)、伯格曼膠質(zhì)細胞分化、骨化調(diào)節(jié)、失巢凋亡負性調(diào)節(jié)等生物過程。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]普通型新型冠狀病毒肺炎的中醫(yī)證治探討[J]. 佘茁萃,呂俊,徐玉琪. 湖北中醫(yī)雜志. 2020(05)
[2]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接法探尋達原飲治療新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物的研究[J]. 宗陽,丁美林,賈可可,馬世堂,居文政. 中草藥. 2020(04)
[3]新型冠狀病毒肺炎中醫(yī)診療/防治方案對中醫(yī)臨床指南制定的思考[J]. 馮雪,段笑嬌,張冰,薩日娜,蘇祥飛,馬思遠,李袁,郭宇博. 中國實驗方劑學(xué)雜志. 2020(14)
[4]基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對接法探索藿香正氣口服液預(yù)防新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)活性化合物研究[J]. 鄧燕君,劉博文,賀楨翔,劉濤,鄭榮蕾,楊安迪,黃澳,李玉婷,徐玉玲. 中草藥. 2020(05)
[5]苦參多路徑抗冠狀病毒的機制探究[J]. 李振,俞科賢. 中草藥. 2020(04)
[6]新型冠狀病毒肺炎死亡尸體系統(tǒng)解剖大體觀察報告[J]. 劉茜,王榮帥,屈國強,王云云,劉盼,朱英芝,費耿,任亮,周亦武,劉良. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2020(01)
[7]中藥整合藥理學(xué)計算平臺的開發(fā)與應(yīng)用[J]. 許海玉,劉振明,付巖,張彥瓊,于建軍,郭非非,唐仕歡,呂傳宇,蘇瑾,崔如意,楊洪軍. 中國中藥雜志. 2017(18)
[8]病毒性肺炎的診治進展[J]. 林秀慧,張根生,崔巍. 中國現(xiàn)代醫(yī)生. 2017(05)
[9]糖皮質(zhì)激素治療病毒性肺炎利與弊[J]. 楊加偉,徐金富. 中國實用內(nèi)科雜志. 2016(02)
[10]升麻屬植物有效成分抗病毒作用研究進展[J]. 張麗蓉,鄢連和. 山東中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2015(04)
碩士論文
[1]荊防散正丁醇部位抗炎作用的NF-κB信號通路機制研究[D]. 桑文濤.成都中醫(yī)藥大學(xué) 2017
本文編號:2953473
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