基于網(wǎng)絡(luò)藥理學聯(lián)合GEO芯片探析培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的分子機制
發(fā)布時間:2020-10-23 22:18
目的 基于網(wǎng)絡(luò)藥理學方法聯(lián)合GEO芯片差異基因分析,探析培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的分子機制。方法 檢索GEO數(shù)據(jù)庫,獲取特應(yīng)性皮炎的基因芯片,繪制差異基因火山圖與熱圖。運用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank數(shù)據(jù)庫,獲取培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的有效成分及基因,并利用cytoscape 3.7.2,構(gòu)建培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò),行拓撲網(wǎng)絡(luò)分析。運用R軟件,對基因進行GO功能與KEGG通路富集分析。結(jié)果 獲得培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的143個活性成分,治療特應(yīng)性皮炎的主要活性成分為槲皮素、豆甾醇、木犀草素。培土清心方對應(yīng)疾病的核心基因共42個,其中重要候選基因為PPARG等。拓撲網(wǎng)絡(luò)分析重要候選基因為TP53、NTRK1等。GO分析生物通路共516條,細胞成分8個,分子功能44個,主要涉及response to steroid hormone生物過程,nuclear receptor activity分子功能,condensed chromosome細胞過程。KEGG通路22條,主要涉及AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。結(jié)論 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎是通過多成分、多基因、多通路,發(fā)揮抗炎、調(diào)節(jié)細胞免疫、抑菌的作用,這將為進一步研究此方作用機制提供參考,也為培土清心方治療AD的基礎(chǔ)、臨床研究及新藥研制提供一定的理論依據(jù)。
【部分圖文】:
與特應(yīng)性皮炎相關(guān)的中藥活性成分共143個,其中燈芯草活性成分7個,茯苓8個,甘草72個,鉤藤27個,連翹9個,山藥7個,太子參4個,薏苡仁4個,淡竹葉3個,牡蠣2個。圖2 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因火山圖
圖1 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因熱圖培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個疾病基因。對應(yīng)疾病基因最多的前3個分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對應(yīng)多個藥物分子。
培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個疾病基因。對應(yīng)疾病基因最多的前3個分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對應(yīng)多個藥物分子。2.3 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎基因的拓撲網(wǎng)絡(luò)圖
本文編號:2853612
【部分圖文】:
與特應(yīng)性皮炎相關(guān)的中藥活性成分共143個,其中燈芯草活性成分7個,茯苓8個,甘草72個,鉤藤27個,連翹9個,山藥7個,太子參4個,薏苡仁4個,淡竹葉3個,牡蠣2個。圖2 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因火山圖
圖1 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因熱圖培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個疾病基因。對應(yīng)疾病基因最多的前3個分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對應(yīng)多個藥物分子。
培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個疾病基因。對應(yīng)疾病基因最多的前3個分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對應(yīng)多個藥物分子。2.3 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎基因的拓撲網(wǎng)絡(luò)圖
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