基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合GEO芯片探析培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的分子機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2020-10-23 22:18
目的 基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法聯(lián)合GEO芯片差異基因分析,探析培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的分子機(jī)制。方法 檢索GEO數(shù)據(jù)庫(kù),獲取特應(yīng)性皮炎的基因芯片,繪制差異基因火山圖與熱圖。運(yùn)用TCMSP、BATMAN-TCM、Drugbank數(shù)據(jù)庫(kù),獲取培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的有效成分及基因,并利用cytoscape 3.7.2,構(gòu)建培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò),行拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)分析。運(yùn)用R軟件,對(duì)基因進(jìn)行GO功能與KEGG通路富集分析。結(jié)果 獲得培土清心方治療特應(yīng)性皮炎的143個(gè)活性成分,治療特應(yīng)性皮炎的主要活性成分為槲皮素、豆甾醇、木犀草素。培土清心方對(duì)應(yīng)疾病的核心基因共42個(gè),其中重要候選基因?yàn)镻PARG等。拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)分析重要候選基因?yàn)門(mén)P53、NTRK1等。GO分析生物通路共516條,細(xì)胞成分8個(gè),分子功能44個(gè),主要涉及response to steroid hormone生物過(guò)程,nuclear receptor activity分子功能,condensed chromosome細(xì)胞過(guò)程。KEGG通路22條,主要涉及AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications。結(jié)論 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎是通過(guò)多成分、多基因、多通路,發(fā)揮抗炎、調(diào)節(jié)細(xì)胞免疫、抑菌的作用,這將為進(jìn)一步研究此方作用機(jī)制提供參考,也為培土清心方治療AD的基礎(chǔ)、臨床研究及新藥研制提供一定的理論依據(jù)。
【部分圖文】:
與特應(yīng)性皮炎相關(guān)的中藥活性成分共143個(gè),其中燈芯草活性成分7個(gè),茯苓8個(gè),甘草72個(gè),鉤藤27個(gè),連翹9個(gè),山藥7個(gè),太子參4個(gè),薏苡仁4個(gè),淡竹葉3個(gè),牡蠣2個(gè)。圖2 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因火山圖
圖1 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因熱圖培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見(jiàn)圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個(gè)疾病基因。對(duì)應(yīng)疾病基因最多的前3個(gè)分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對(duì)應(yīng)多個(gè)藥物分子。
培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見(jiàn)圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個(gè)疾病基因。對(duì)應(yīng)疾病基因最多的前3個(gè)分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對(duì)應(yīng)多個(gè)藥物分子。2.3 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎基因的拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)圖
本文編號(hào):2853612
【部分圖文】:
與特應(yīng)性皮炎相關(guān)的中藥活性成分共143個(gè),其中燈芯草活性成分7個(gè),茯苓8個(gè),甘草72個(gè),鉤藤27個(gè),連翹9個(gè),山藥7個(gè),太子參4個(gè),薏苡仁4個(gè),淡竹葉3個(gè),牡蠣2個(gè)。圖2 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因火山圖
圖1 正常組與特應(yīng)性皮炎患者差異基因熱圖培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見(jiàn)圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個(gè)疾病基因。對(duì)應(yīng)疾病基因最多的前3個(gè)分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對(duì)應(yīng)多個(gè)藥物分子。
培土清心方-特應(yīng)性皮炎-分子基因網(wǎng)絡(luò)圖中(見(jiàn)圖3),大多數(shù)藥物分子作用于多個(gè)疾病基因。對(duì)應(yīng)疾病基因最多的前3個(gè)分子分別是MOL000098、MOL000006、MOL000449,其代表的活性分別為槲皮素、豆甾醇和木犀草素。特應(yīng)性皮炎的基因中,PPARG對(duì)應(yīng)多個(gè)藥物分子。2.3 培土清心方治療特應(yīng)性皮炎基因的拓?fù)渚W(wǎng)絡(luò)圖
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