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復(fù)方紫草油治療唇炎機(jī)制的網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-23 22:06
   目的:利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的技術(shù)探索復(fù)方紫草油治療唇炎的機(jī)制,為后續(xù)實(shí)驗(yàn)研究及擴(kuò)大復(fù)方紫草油的適應(yīng)證提供理論基礎(chǔ)。方法:依托中藥系統(tǒng)藥理學(xué)平臺(tái)(TCMSP)、中藥綜合數(shù)據(jù)庫(kù)(TCMID)篩選復(fù)方紫草油的有效化合物和作用靶點(diǎn);通過(guò)檢索人類基因信息數(shù)據(jù)庫(kù)(GeneCards)及人類孟德爾遺傳研究平臺(tái)(OMIM)選取唇炎的疾病靶點(diǎn),并利用R語(yǔ)言取疾病與藥物靶點(diǎn)交集;應(yīng)用Cytoscape軟件構(gòu)建藥物-化合物-靶點(diǎn)-疾病互作網(wǎng)絡(luò);運(yùn)用STRING平臺(tái)搭建蛋白質(zhì)間相互作用網(wǎng)絡(luò)(PPI);使用Bioconductor生物信息軟件包進(jìn)行GO功能富集和KEGG通路分析。結(jié)果:篩選得103個(gè)化合物和相應(yīng)115個(gè)靶點(diǎn),其中有21個(gè)與疾病相關(guān)。GO功能富集分析得到22個(gè)條目,KEGG通路富集分析篩選得到91條信號(hào)通路。結(jié)論:復(fù)方紫草油治療唇炎具有生物學(xué)支撐。不同的蛋白存在協(xié)同作用,其中IL-6、STAT3和TNF等靶點(diǎn)起著關(guān)鍵作用。生物過(guò)程主要涉及細(xì)胞因子受體結(jié)合、金屬內(nèi)肽酶活性等,并主要富集在AGE-RAGE、FssAs和TNF等多條信號(hào)通路上,發(fā)揮抗炎及調(diào)控細(xì)胞增殖和凋亡等作用。
【部分圖文】:

唇炎,紫草,療效


中醫(yī)運(yùn)用中藥外治法悠久歷史,療效確切,現(xiàn)代醫(yī)家也逐漸將唇炎治療的焦點(diǎn)轉(zhuǎn)移到中藥外用上,如沈漪等[5]采用芥柏軟膏加紫色消腫膏治療慢性唇炎,其治療的總有效率為92.5%;封帥等[6]采用自制的濕敷藥液治療慢性唇炎,其治療的總有效率為93.2%。中藥外用治療唇炎療效顯著,但均需臨床調(diào)配,保存時(shí)間短,操作要求高,部分患者依從性差,筆者曾在臨床中嘗試單純用中成藥復(fù)方紫草油[健民集團(tuán)葉開泰國(guó)藥(隨州)有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字Z20044385]治療唇炎,取得一定療效。見圖1。復(fù)方紫草油[健民集團(tuán)葉開泰國(guó)藥(隨州)有限公司,國(guó)藥準(zhǔn)字Z20044385]是根據(jù)明代著名的兒科專著《幼科金針》(秦景明撰)的紫草潤(rùn)肌膏化裁而來(lái),藥物組成為紫草、冰片、忍冬藤、白芷,輔料為麻油,采用葉開泰傳統(tǒng)工藝制備而成。唇炎的主要癥狀為脫屑、灼熱、疼痛、腫脹等,大多醫(yī)家以濕熱論治[4],復(fù)方紫草油可以清熱、涼血、祛濕、解毒、生肌、止痛,從中醫(yī)理論角度符合辨證論治思想,但是作為其起效的確切效應(yīng)有待進(jìn)一步明確。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是通過(guò)構(gòu)建疾病-表型-靶蛋白-藥物的互作關(guān)系網(wǎng)絡(luò),并通過(guò)GO和KEGG富集分析實(shí)現(xiàn)預(yù)測(cè)藥物有效成分在疾病效應(yīng)靶點(diǎn)中的可能作用機(jī)制[7]。因此筆者對(duì)復(fù)方紫草油進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究,以期在分子層面上能夠初步揭示復(fù)方紫草油治療唇炎的可能機(jī)制,旨在為本病后續(xù)的實(shí)驗(yàn)研究及擴(kuò)大復(fù)方紫草油的適應(yīng)證提供理論基礎(chǔ)。

條形圖,靶點(diǎn),疾病,藥物


應(yīng)用Venn圖篩選得到復(fù)方紫草油和唇炎共同作用靶點(diǎn)共21個(gè),見圖2,并得到靶點(diǎn)具體信息,見表1。將藥物和疾病相映射得到的21個(gè)交集基因,以置信度>0.70,在STRING平臺(tái)進(jìn)行復(fù)方紫草油的靶標(biāo)PPI網(wǎng)絡(luò)分析,見圖3,得到21個(gè)節(jié)點(diǎn),91條邊,平均Degree為8.67。統(tǒng)計(jì)出現(xiàn)頻次并繪制條形圖,見圖4,可以發(fā)現(xiàn)蛋白互作頻次較高的IL-6、STAT3、TNF等,可以說(shuō)明復(fù)方紫草油的不同作用靶點(diǎn)存在協(xié)同作用。表1 藥物與疾病共同靶點(diǎn) EntrezID 靶點(diǎn) 蛋白名稱 中文名稱 5743 PTGS2 Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2 前列腺素-內(nèi)過(guò)氧化物合酶2 3383 ICAM1 Intercellular Adhesion Molecule 1 細(xì)胞間黏附分子1 6774 STAT3 Signal Transducer And Activator of Transcription 3 信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活子3 7422 VEGFA Vascular Endothelial Growth Factor A 血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子A 596 BCL2 BCL2 Apoptosis Regulator BCL2凋亡調(diào)節(jié)劑 1026 CDKN1A Cyclin Dependent Kinase Inhibitor 1A 細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶抑制劑1A 4313 MMP2 Matrix Metallopeptidase 2 基質(zhì)金屬肽酶2 4318 MMP9 Matrix Metallopeptidase 9 基質(zhì)金屬肽酶9 7124 TNF Tumor Necrosis Factor 腫瘤壞死因子 3569 IL6 Interleukin 6 白細(xì)胞介素6 7157 TP53 Tumor Protein P53 腫瘤蛋白P53 4312 MMP1 Matrix Metallopeptidase 1 基質(zhì)金屬肽酶1 4314 MMP3 Matrix Metallopeptidase 3 基質(zhì)金屬肽酶3 4319 MMP10 Matrix Metallopeptidase 10 基質(zhì)金屬肽酶10 3553 IL1B Interleukin 1 Beta 白細(xì)胞介素1β 6401 SELE Selectin E 選擇素E 1437 CSF2 Colony Stimulating Factor 2 集落刺激因子2 3791 KDR Kinase Insert Domain Receptor 激酶插入域受體 6256 RXRA Retinoid X Receptor Alpha 維甲酸X受體α 1294 COL7A1 Collagen Type VII Alpha 1 Chain VII型膠原α1鏈 1277 COL1A1 Collagen Type I Alpha 1 Chain Ⅰ型膠原α1鏈

靶點(diǎn),蛋白,疾病,藥物


共同靶點(diǎn)蛋白出現(xiàn)頻次
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