為探討DNA條形碼在陜西關中野生商陸資源中的鑒定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH對29份商陸樣品DNA進行PCR擴增和測序,用Codon CodeA-ligner V3.0進行序列拼接和校對,隨后進行BLAST比對鑒定分析;同時運用MEGA 6.0分析序列特征、K2P遺傳距離及種內或種間變異,并構建系統(tǒng)進化樹,評價兩對引物對該區(qū)域商陸及其混偽品的鑒別能力。研究結果表明, ITS2和psbA-trnH序列的PCR擴增和測序成功率均為100%; NJ系統(tǒng)進化樹顯示ITS2和psbA-trnH序列均可明顯將所有樣本分別聚為商陸、垂序商陸并與其同屬近源種鄂西商陸、日本商陸及兩種混偽品各自聚為不同分支; ITS2序列在種間遺傳距離上較psbA-trnH有一定優(yōu)勢。ITS2和psbA-trnH序列均可作為DNA條形碼對商陸及其混偽品進行識別和鑒定,為商陸資源品種現(xiàn)狀與分布研究及合理開發(fā)利用提供理論依據。
【文章目錄】：
材料與方法
結果與分析
    1 DNA擴增及測序
    2 NCBI數據庫和中藥材DNA條形碼鑒定系統(tǒng)比對分析
    3序列特征及遺傳距離分析
    4系統(tǒng)進化樹構建分析
討論

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本文編號：2846411