潰結口服方治療濕熱內蘊型潰瘍性結腸炎的藥效及機制研究
【圖文】:
4 MOL000006 luteolin 36.16 0.25 MOL000098 quercetin 46.43 0.21.2 虛擬預測潰結口服方中的潛在的藥效分子靶標,構建“C-T”network運用藥效團模型,基于支持向量機(SVM)算法和隨機森林(RF)算法計算出各分跟其相對應的靶點間的相互作用強度,以 SVM≥0.8,RF≥0.7 為作篩選條件,虛擬測丁氏潰結口服方中的各種活性成分的潛在作用靶點。在篩選的 175 種活性成分中有種成分沒有找到相應的靶點;其余成分都通過有效方法預測出了各自的潛在作用靶盡管組方中藥各自具有不同的靶點,,但其中有很多靶點是多種組方中藥所共有的,這在一定程度上提示了丁氏潰結口服方中各中藥之間的協(xié)同整合效應。進一步構建成靶點相互作用網絡,即“C-T” network,課題組及本人經過初步篩選,結果如下圖“C-T” network(圖 2-1)。其中成分的 degrees 大于平均值,提示了組方中藥中大數(shù)成分可以通過“多靶點”的作用模式來實現(xiàn)復方整合作用的最終效應。
Cytoscape 軟件的插件 Bisogenet,并選擇 InAct(www.ebi.ac.uk/inotein Reference Database(http://www.hprd.org/)、Molecular ine (http://mint.bio.uniroma2.it/mint/download.do)等 6 個 PPI結口服方的潛在作用靶點和已知的 UC 相關靶點分別做 PPI,構建相互作用網絡中“degree”值大于平均值的節(jié)點定義為有顯著性意義的靶ytoscape 軟件的插件 CytoNAC,計算顯著性作用靶點相互作用網絡每entrality (DC)、Betweenness centrality (BC)、Closeness centralictor centrality (EC)、Network centrality (NC)、和 Local avertivity (LAC)六大拓撲參數(shù),從而分析其在相互作用網絡中的拓撲重撲參數(shù)值大于2倍平均值的靶點作為丁氏潰結口服方治療UC的潛在IL-17 以及 TNF-α蛋白及相關信號通路密切相關(圖 2-2)。
【學位授予單位】:遼寧中醫(yī)藥大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R285.5
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1 衛(wèi)s釗
本文編號:2708451
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