基于iTRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)分析積雪草酸抑制人肝癌SMMC-7721細(xì)胞增殖的潛在機制
發(fā)布時間:2020-05-04 23:36
【摘要】:目的:研究積雪草酸(AA)作用后對人肝癌SMMC-7721細(xì)胞蛋白質(zhì)表達譜的影響,并對差異蛋白進行生物信息學(xué)分析,通過GO功能注釋、KEGG通路富集分析和PPI差異蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)圖的構(gòu)建,結(jié)合相應(yīng)細(xì)胞功能學(xué)實驗的初步驗證,探討積雪草酸抑制人肝癌SMMC-7721細(xì)胞增殖的作用方式及潛在機制。方法:1.以人肝癌SMMC-7721細(xì)胞為研究對象,MTT實驗分析AA(20、30、40、50、60μM)作用24h后對細(xì)胞增殖的抑制作用,并計算IC_(50)值,以該濃度進行后續(xù)蛋白質(zhì)組學(xué)等相關(guān)實驗。2.采用體外i TRAQ標(biāo)記結(jié)合納升液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)獲得AA作用后的蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)。并利用Proteome Discoverer軟件篩選差異蛋白表達譜。差異表達蛋白進行GO功能注釋分析、KEGG通路富集分析,并利用Omicsbean在線軟件對差異富集通路中的差異蛋白進行PPI蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)圖的繪制。在此基礎(chǔ)上進行AA抑制人肝癌SMMC-7721細(xì)胞增殖的作用方式與作用機制的生物信息學(xué)分析。3.采用Western blot方法對生物信息學(xué)分析所得的關(guān)鍵差異蛋白富集通路中的線粒體凋亡相關(guān)差異蛋白(Bax、Cyt C、Caspase-3、Cleaved Caspase-3)的表達進行驗證,對m TOR-4EBP1自噬通路中相關(guān)差異蛋白(LC3-I/II、m TOR、p-m TOR、4EBP1、p-4EBP1)的表達進行驗證。4.結(jié)合AA誘導(dǎo)人肝癌SMMC-7721細(xì)胞凋亡相關(guān)蛋白及自噬標(biāo)志蛋白的表達發(fā)生差異的結(jié)論,通過Hoechst 33342/PI雙染法進行凋亡染色實驗和MDC法自噬囊泡染色實驗進一步明確AA誘導(dǎo)凋亡和自噬的產(chǎn)生,并聯(lián)用自噬抑制劑3-MA以明確AA誘導(dǎo)的自噬對人肝癌SMMC-7721細(xì)胞增殖的抑制作用。結(jié)果:1.AA作用24h后能夠劑量依賴性地抑制人肝癌SMMC-7721細(xì)胞的增殖,IC_(50)為37.31μM。綜合考慮后,本研究選用40μM的AA濃度進行后續(xù)蛋白質(zhì)組學(xué)分析等實驗。2.運用i TRAQ定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)篩選40μM的AA作用24h后人肝癌SMMC-7721細(xì)胞內(nèi)的差異蛋白結(jié)果顯示,AA干預(yù)后引起495個表達上調(diào)的蛋白及141個表達下調(diào)的差異蛋白。生物信息學(xué)分析表明這些差異蛋白主要參與到細(xì)胞能量代謝活動中,包括氧化磷酸化通路、糖酵解/糖異生通路和果糖及甘露糖代謝通路。深入分析后發(fā)現(xiàn),這些細(xì)胞代謝相關(guān)通路蛋白的表達變化可能主要是由AA誘導(dǎo)的線粒體凋亡和通過負(fù)調(diào)控m TOR-4EBP1通路誘導(dǎo)的細(xì)胞自噬而引起的,進而影響細(xì)胞的正常能量代謝活動并抑制其增殖。3.Western blot驗證實驗表明,40μM的AA干預(yù)后可以明顯上調(diào)Bax、Cyt C、Cleaved Caspase-3、4EBP1和LC3-II的蛋白表達,下調(diào)Caspase-3、p-m TOR、p-4EBP1的表達,與差異蛋白生物信息學(xué)分析結(jié)果一致。提示AA可誘導(dǎo)人肝癌SMMC-7721細(xì)胞產(chǎn)生線粒體凋亡和自噬。4.對AA作用后的人肝癌SMMC-7721細(xì)胞使用Hoechst 33342/PI雙染法進行凋亡染色和MDC法進行自噬囊泡染色后發(fā)現(xiàn),40μM的AA可明顯引起凋亡細(xì)胞數(shù)和自噬囊泡數(shù)的增加,進一步證實了AA可誘導(dǎo)凋亡和自噬。當(dāng)40μM的AA聯(lián)用自噬抑制劑3-MA時,AA對人肝癌SMMC-7721細(xì)胞的增殖抑制作用可部分消失,提示AA誘導(dǎo)的自噬和線粒體凋亡共同引起了肝癌細(xì)胞的增殖抑制。結(jié)論:1.積雪草酸作用于人肝癌SMMC-7721細(xì)胞24h后可以劑量依賴性的抑制細(xì)胞的體外增殖,主要表現(xiàn)為細(xì)胞正常能量代謝相關(guān)通路受到影響,與受到細(xì)胞凋亡和自噬相關(guān)通路差異蛋白的調(diào)控有關(guān)。2.積雪草酸可影響線粒體凋亡途徑的關(guān)鍵蛋白的表達,誘導(dǎo)人肝癌SMMC-7721細(xì)胞產(chǎn)生凋亡,同時影響m TOR-4EBP1通路自噬相關(guān)蛋白的表達,誘導(dǎo)自噬抑制細(xì)胞的體外增殖。
【圖文】:
圖 1 積雪草酸(Asiatic acid,,AA)0H48O5,2α, 3β, 23-三羥基-烏蘇烷型-12-烯-28在天然活性產(chǎn)物的研究中具有明顯細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)表達變化[11]。同位合納升液相色譜和串聯(lián)質(zhì)譜(Na公司研發(fā)的一種基于體外等重同位最準(zhǔn)確的一種高通量定量蛋白質(zhì)位素試劑標(biāo)記多肽末端氨基或賴氨分析,使得帶不同同位素標(biāo)簽的同子,根據(jù)報告離子的豐度可獲得樣處理得到蛋白質(zhì)的定量信息可同時
學(xué)技術(shù)分析積雪草酸抑制人肝癌 SMMC-7721 細(xì)胞增殖的潛在機制 肝癌 SMMC-7721 細(xì)胞體外增殖活性的影示,MTT 結(jié)果顯示積雪草酸(20、30、4依賴性地抑制人肝癌SMMC-7721細(xì)胞的積雪草酸抑制人肝癌 SMMC-7721 細(xì)胞胞活力下降 50%左右,積雪草酸對 SMM,同時也仍存有足夠數(shù)量的細(xì)胞可以進行提取。根據(jù) IC50值綜合考慮后,本實驗選 SMMC-7721 細(xì)胞 24h 進行后續(xù)的蛋白質(zhì)
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號】:R285
【圖文】:
圖 1 積雪草酸(Asiatic acid,,AA)0H48O5,2α, 3β, 23-三羥基-烏蘇烷型-12-烯-28在天然活性產(chǎn)物的研究中具有明顯細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)表達變化[11]。同位合納升液相色譜和串聯(lián)質(zhì)譜(Na公司研發(fā)的一種基于體外等重同位最準(zhǔn)確的一種高通量定量蛋白質(zhì)位素試劑標(biāo)記多肽末端氨基或賴氨分析,使得帶不同同位素標(biāo)簽的同子,根據(jù)報告離子的豐度可獲得樣處理得到蛋白質(zhì)的定量信息可同時
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【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
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【分類號】:R285
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本文編號:2649156
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