本文關(guān)鍵詞：某醫(yī)院船不同艙室微生物多樣性初步研究

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【摘要】：目的應(yīng)用16S rDNA測序技術(shù)分析海軍某醫(yī)院船不同艙室細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其多樣性,為醫(yī)院船潛在感染的監(jiān)測和控制提供科學(xué)依據(jù)。方法采用拭子涂抹方法在醫(yī)院船的12個(gè)艙室(A~L位)共采集樣本31份,采用Illumina Hiseq2500高通量測序平臺PE250測序策略對樣品16S r DNA擴(kuò)增的V3~V4區(qū)域進(jìn)行測序,并進(jìn)行物種分類、豐度及多樣性等生物信息分析。結(jié)果 31份樣品共產(chǎn)生原始測序數(shù)據(jù)為1860.64 Mbp,每份樣品平均產(chǎn)生54.86 Mbp的clean data序列,各樣品檢測的Tags數(shù)量平均為60 000,Unique tags序列數(shù)量均值為58 364;操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)數(shù)量181~2239。在醫(yī)院船12個(gè)艙室中共檢測到26個(gè)細(xì)菌門綱目等類,216個(gè)細(xì)菌科,414個(gè)細(xì)菌屬。其中在各級水平分布的優(yōu)勢菌群分別為厚壁菌門(Firmicutes)、葡萄球菌科(Staphylococcaceae)和葡萄球菌屬(Staphylococcus)。在屬水平,葡萄球菌屬在L位和J位分布最多,微球菌屬在B位分布最多(27.15%),不動(dòng)桿菌屬在K位占優(yōu)勢(23.83%),棲水菌屬則主要見于C位。12個(gè)艙室兩間共有的OTU數(shù)量占檢測到OTU總數(shù)的比例均22.3%,其中K位有著最高的Chao指數(shù)(4711.55)和Shannon-Wiener指數(shù)(8.58),及最高的Simpson優(yōu)勢度指數(shù)(0.9905)。結(jié)論醫(yī)院船菌群構(gòu)成復(fù)雜、多樣,以革蘭陽性葡萄球菌為優(yōu)勢菌屬,并有水生環(huán)境中的菌屬分布,與陸地醫(yī)院常見細(xì)菌分布存在明顯差異,而且各艙室細(xì)菌物種豐度及分類也存在明顯不同。
【作者單位】： 海軍總醫(yī)院中心實(shí)驗(yàn)科;海軍總醫(yī)院科研科;海軍總醫(yī)院感染控制辦公室;
【關(guān)鍵詞】： 海軍醫(yī)學(xué) 醫(yī)院船 微生物多樣性 Illumina測序 S rDNA
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31400107) 軍隊(duì)重點(diǎn)課題資助項(xiàng)目(BHJ14J004) 全軍醫(yī)藥衛(wèi)生科研資助項(xiàng)目(06Z007)
【分類號】：R821.89
【正文快照】： 醫(yī)院船是海軍衛(wèi)勤保障的重要支援力量和海上立體救治的關(guān)鍵環(huán)節(jié),承擔(dān)著戰(zhàn)時(shí)傷病員救治和平時(shí)海上突發(fā)事件衛(wèi)勤支援、重大災(zāi)害人道主義救援及海上醫(yī)療救護(hù)訓(xùn)練等多樣化軍事任務(wù)[1,2]。作為海上流動(dòng)的醫(yī)療救護(hù)平臺,醫(yī)院船既有相應(yīng)級別的綜合性醫(yī)院的特點(diǎn),又兼有平戰(zhàn)時(shí)多樣化軍事

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本文編號：966335