人腺病毒7型引起的呼吸道感染疫情病原分子生物學分析
發(fā)布時間:2022-02-10 12:21
目的對安慶市某部隊一起人腺病毒7型引起的急性呼吸道感染暴發(fā)疫情進行病原學鑒定,并對其六鄰體(Hexon)基因進行測序分析。方法采取Real-time PCR對采集的13份咽拭子標本進行腺病毒核酸檢測,陽性標本接種Hep-2細胞進行病毒分離培養(yǎng)。收集陽性分離培養(yǎng)物,采用RT-PCR擴增Hexon的核苷酸序列進行測序,獲得序列在NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫進行同源比對,MAGE6.0軟件進行進化分析、構(gòu)建進化樹。結(jié)果獲得10份陽性毒株培養(yǎng)物,Hexon基因序列與我國武漢7型腺病毒疫情株Z9/WH/CHN/2015(GenBank號為KX897164)100%同源,與2012AQHAdv7疫情株和2015AQHAdv7散發(fā)株100%同源性。結(jié)論該起疫情由人腺病毒7型感染引起,安慶地區(qū)流行的腺病毒疫情株基因型別穩(wěn)定,此次的疫情可能源于本地的流行株。
【文章來源】:安徽預(yù)防醫(yī)學雜志. 2019,25(02)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
圖1感染腺病毒7d后Hep-2細胞病變情況(×100)
拉絲現(xiàn)象,為典型腺病毒CPE病變特征,如圖1所示。圖1感染腺病毒7d后Hep-2細胞病變情況(×100)Figure1Hep-2celllesionsafter7daysofinfectionwithadenovirus(×100)2.2.3六鄰體基因PCR擴增利用AdHexSF和AdHexSR引物對10份分離成功的陽性標本進行六鄰體基因PCR擴增,擴增產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳,在約3000bp處出現(xiàn)一條清晰的目的基因條帶。見圖2。純化回收PCR產(chǎn)物,送至上海生物工程有限公司測序。圖2六鄰體蛋白全基因PCR擴增產(chǎn)物電泳圖譜Figure2ElectrophoresismapofproductsamplifiedbyHexonproteinwholegenePCR2.2.4同源分析及進化樹分析10份陽性毒株所測出的Hexon基因序列長度均符合預(yù)期。將該序列提交GenBank進行Blast同源性分析,10份毒株28安徽預(yù)防醫(yī)學雜志2019年4月20日第25卷第2期AnhuiJPrevMed,Apr.20,2019,Vol25,No.2
的Hexon基因序列完全相同,且與我國2015年武漢株Z9/WH/CHN/2015(GenBank號為KX897164)100%同源性,提示該疫情的病原株屬于人腺病毒7型。為分析方便,選取其中一株201801AQHAdv7為代表株做進化分析,人腺病毒不同血清型六鄰體基因系統(tǒng)進化樹見圖3。注:201801AQHAdv為本次疫情分離株的代表株,2012AQHAdv7為2012年安慶一小學的分離株,2015AQHAdv7sanfa為2015年安慶市ILI樣本的檢出株圖3人腺病毒不同血清型六鄰體基因系統(tǒng)進化樹Figure3EvolutionarytreeofhumanadenovirusHexongenesystemwithdifferentserotypes3討論目前,腺病毒感染暴發(fā)疫情世界各地均有報道,患者主要出現(xiàn)發(fā)熱與上呼吸道感染癥狀,在眾多的血清型中,引起呼吸道疾病的主要為3、7、14、1、2、5、6血清亞型[5-8],其中HAdv7常常與重癥的呼吸道感染相關(guān)[6-9]。HAdv7腺病毒有效的傳播需要一定的條件,例如人群密集的醫(yī)院、軍營等的環(huán)境,HAdv-7大范圍流行需也要相對較低水平的群體免疫力。流行病學調(diào)查發(fā)現(xiàn),該起疫情發(fā)生前,某武警部隊進行高強度的體能訓(xùn)練,過度疲勞,這可能使機體的免疫力下降,導(dǎo)致了此次的聚集性疫情發(fā)生的原因之一。人HAdv7可分為20個基因組型[7-10],我國流行株主要為HAdv7d型[8,11],與HAdv3,HAdv7d感染的臨床癥狀相比更為嚴重,病人
【參考文獻】:
期刊論文
[1]安慶市呼吸道感染疫情人腺病毒的病原分析[J]. 曹孟嬋,劉敏鴻,汪金生,李賢相,徐四清,張其威. 安徽預(yù)防醫(yī)學雜志. 2015(01)
本文編號:3618879
【文章來源】:安徽預(yù)防醫(yī)學雜志. 2019,25(02)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
圖1感染腺病毒7d后Hep-2細胞病變情況(×100)
拉絲現(xiàn)象,為典型腺病毒CPE病變特征,如圖1所示。圖1感染腺病毒7d后Hep-2細胞病變情況(×100)Figure1Hep-2celllesionsafter7daysofinfectionwithadenovirus(×100)2.2.3六鄰體基因PCR擴增利用AdHexSF和AdHexSR引物對10份分離成功的陽性標本進行六鄰體基因PCR擴增,擴增產(chǎn)物進行1%瓊脂糖凝膠電泳,在約3000bp處出現(xiàn)一條清晰的目的基因條帶。見圖2。純化回收PCR產(chǎn)物,送至上海生物工程有限公司測序。圖2六鄰體蛋白全基因PCR擴增產(chǎn)物電泳圖譜Figure2ElectrophoresismapofproductsamplifiedbyHexonproteinwholegenePCR2.2.4同源分析及進化樹分析10份陽性毒株所測出的Hexon基因序列長度均符合預(yù)期。將該序列提交GenBank進行Blast同源性分析,10份毒株28安徽預(yù)防醫(yī)學雜志2019年4月20日第25卷第2期AnhuiJPrevMed,Apr.20,2019,Vol25,No.2
的Hexon基因序列完全相同,且與我國2015年武漢株Z9/WH/CHN/2015(GenBank號為KX897164)100%同源性,提示該疫情的病原株屬于人腺病毒7型。為分析方便,選取其中一株201801AQHAdv7為代表株做進化分析,人腺病毒不同血清型六鄰體基因系統(tǒng)進化樹見圖3。注:201801AQHAdv為本次疫情分離株的代表株,2012AQHAdv7為2012年安慶一小學的分離株,2015AQHAdv7sanfa為2015年安慶市ILI樣本的檢出株圖3人腺病毒不同血清型六鄰體基因系統(tǒng)進化樹Figure3EvolutionarytreeofhumanadenovirusHexongenesystemwithdifferentserotypes3討論目前,腺病毒感染暴發(fā)疫情世界各地均有報道,患者主要出現(xiàn)發(fā)熱與上呼吸道感染癥狀,在眾多的血清型中,引起呼吸道疾病的主要為3、7、14、1、2、5、6血清亞型[5-8],其中HAdv7常常與重癥的呼吸道感染相關(guān)[6-9]。HAdv7腺病毒有效的傳播需要一定的條件,例如人群密集的醫(yī)院、軍營等的環(huán)境,HAdv-7大范圍流行需也要相對較低水平的群體免疫力。流行病學調(diào)查發(fā)現(xiàn),該起疫情發(fā)生前,某武警部隊進行高強度的體能訓(xùn)練,過度疲勞,這可能使機體的免疫力下降,導(dǎo)致了此次的聚集性疫情發(fā)生的原因之一。人HAdv7可分為20個基因組型[7-10],我國流行株主要為HAdv7d型[8,11],與HAdv3,HAdv7d感染的臨床癥狀相比更為嚴重,病人
【參考文獻】:
期刊論文
[1]安慶市呼吸道感染疫情人腺病毒的病原分析[J]. 曹孟嬋,劉敏鴻,汪金生,李賢相,徐四清,張其威. 安徽預(yù)防醫(yī)學雜志. 2015(01)
本文編號:3618879
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