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RCCS模擬微重力對人角化細(xì)胞代謝組學(xué)的影響

發(fā)布時(shí)間:2021-11-22 22:53
  目的探討旋轉(zhuǎn)式細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)(RCCS)模擬微重力對人永生化角質(zhì)形成細(xì)胞系(HaCaT)細(xì)胞代謝組學(xué)的影響。方法應(yīng)用RCCS建立模擬微重力細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng),體外培養(yǎng)HaCaT細(xì)胞,隨機(jī)分為模擬微重力組(SMG組)和正常重力組(NG組),細(xì)胞培養(yǎng)1、2、3 d后收集樣本,進(jìn)行LC/MS代謝組學(xué)分析。結(jié)合正交偏最小二乘法(O-PLS-DA)和兩樣本獨(dú)立t檢驗(yàn)尋找兩組細(xì)胞的差異代謝物,將差異代謝物輸入KEGG數(shù)據(jù)庫,進(jìn)行代謝通路的構(gòu)建與功能分析。結(jié)果 LC/MS代謝組學(xué)分析結(jié)果顯示,與NG組比較,SMG組HaCaT細(xì)胞在RCCS模擬微重力環(huán)境中培養(yǎng)1 d后共有74種差異代謝物,其中16種表達(dá)上調(diào),58種表達(dá)下調(diào);2 d后共有89種差異代謝物,其中15種表達(dá)上調(diào),74種表達(dá)下調(diào);3 d后共有100種差異代謝物,其中23種表達(dá)上調(diào),77種表達(dá)下調(diào);以表達(dá)有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(VIP>1且P<0.05)的49種代謝物作為目標(biāo)代謝標(biāo)記物,其中鞘氨醇、谷氨酸、二十二碳五烯酸下調(diào),脫水山梨糖醇等物質(zhì)表達(dá)上調(diào)。KEGG分析顯示,其涉及的代謝通路有氨基酸代謝、脂質(zhì)代謝、細(xì)胞增殖和凋亡、物質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、分解代謝、信號... 

【文章來源】:解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2019,44(09)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 主要材料及儀器
    1.2 細(xì)胞培養(yǎng)及分組
    1.3 RCCS微載體培養(yǎng)
    1.4 樣本采集
    1.5 樣品處理
    1.6 U H P LC-LTQ-M S分析條件
    1.7 數(shù)據(jù)分析
    1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理
2 結(jié)果
    2.1 主成分分析
    2.2 偏最小二乘法判別分析
    2.3 差異代謝物的篩選與鑒定
3 討論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]旋轉(zhuǎn)細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)模擬微重力環(huán)境對小鼠成纖維細(xì)胞lncRNA表達(dá)的影響[J]. 王占宇,姜福全,徐冰心,宋向衛(wèi),司少艷,周金蓮,楊鶴鳴,李成林,崔彥.  解放軍醫(yī)學(xué)雜志. 2017(10)



本文編號:3512599

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