以腫瘤細胞Rac1蛋白為靶點的在黃酸衍生物的設計與合成策略研究
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【摘要】:[目的]選擇放射增敏節(jié)點蛋白Rac1為研究對象,通過分子對接技術,研究蒽醌化合物與Rac1蛋白的相互作用模式。并以分子對接結果為依據(jù),指導合成大黃酸衍生物,通過體外活性實驗驗證其靶向性,探索靶向Rac1蛋白化合物的設計與合成的新策略。[方法](1)采用計算機分子對接軟件AutoDock4.2等軟件,研究蒽醌化合物與Rac1蛋白的結合模式。(2)以大黃酸為先導化合物,利用有機合成反應,合成大黃酸含氮的脂肪胺和哌嗪類衍生物,利用波譜技術進行結構解析。(3)通過MTT實驗、WB實驗來檢測大黃酸衍生物對鼻咽癌、肝癌、肺癌、卵巢癌、骨肉瘤細胞的生長抑制作用和對Racl蛋白的影響。[結果](1)大黃酚、大黃素、大黃酸、大黃素甲醚、蘆薈大黃素等五種常見蒽醌化合物與Rac1蛋白兩個不同活性腔都能有效對接,大黃酸與Racl蛋白結合自由能最低。(2)大黃酸哌嗪衍生物和大黃酸含N的脂肪胺衍生物與Rac1蛋白親和力均高于大黃酸。(3)成功合成出脂肪胺大黃酸衍生物RN-2和哌嗪類大黃酸衍生物RP-3、RP-4,并經(jīng)波譜證實。(4)MTT實驗表明,大黃酸衍生物RX-1和RN-2對各種腫瘤細胞的抑制率較強,IC50值均低于大黃酸;HepG2 2.15細胞對大黃酸及各衍生物的敏感性最高。(5)WB實驗表明,四種大黃酸衍生物作用6種細胞后,除了卵巢癌SKOV3細胞外,其余5種細胞與空白組細胞相比, Rac1蛋白均高表達;對于鼻咽癌CNE-1和CNE-2細胞,RP-4化合物相對其他化合物對細胞的Rac1蛋白表現(xiàn)出較強的激活能力(P0.001)。RN-2化合物與空白細胞比較,對于肝癌HepG2 2.15和肺癌A549細胞具有較強的Rac1蛋白激活能力(P0.01)。(6)分子對接及WB實驗證實,激活Rac1蛋白的大黃酸衍生物,均與Rac1蛋白活性腔中氨基酸Ala59形成氫鍵。[結論]Rac1蛋白可能是大黃酸衍生物抗腫瘤作用的結合靶點,大黃酸8位羥基上連接含N脂肪胺和哌嗪結構片段,有利于提高與RAC1蛋白的結合能力,具有潛在的激活RAC1蛋白的活性。Rac1蛋白活性腔中氨基酸Asn39、Ala59有望成為篩選Rac1蛋白激活劑的重要指標。
【關鍵詞】:大黃酸 抗腫瘤 分子對接 Racl 蛋白靶點
【學位授予單位】:廣西醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2015
【分類號】:R914
【目錄】:
- 個人簡歷3-6
- 主要英漢縮略語名詞對照6-7
- 摘要7-9
- ABSTRACT9-12
- 前言12-17
- 參考文獻15-17
- 第一章 以腫瘤細胞Rac1為靶點的蒽醌衍生物的分子對接研究17-35
- 1 分子對接技術簡介17-18
- 2 五種蒽醌化合物與Rac1蛋白的分子對接研究18-24
- 3 五種蒽醌化合物與Rac1蛋白不同活性腔的分子對接24-25
- 4 大黃酸衍生物的結構設計25-29
- 5 討論29-32
- 參考文獻32-35
- 第二章 大黃酸衍生物的合成35-46
- 1 儀器設備與材料試劑35-36
- 2 大黃酸衍生物的合成36-44
- 3 討論44-45
- 參考文獻45-46
- 第三章 大黃酸衍生物對腫瘤細胞Rac1蛋白表達的影響46-63
- 1 儀器和試劑46-48
- 2 實驗方法48-51
- 3 實驗結果51-59
- 4 討論59-61
- 參考文獻61-63
- 全文總結63-64
- 附錄64-66
- 文獻綜述66-77
- 參考文獻74-77
- 致謝77-78
- 攻讀碩士學位期間發(fā)表的學術論文目錄78
- 攻讀碩士學位期間參與的項目78
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前7條
1 夏云飛,李滿枝,黃冰,陳劍經(jīng),李志強,汪惠民,William A.Brook;14株(亞株)人鼻咽癌細胞的放射生物特性(英文)[J];癌癥;2001年07期
2 趙芳;梁慧;程惠;王軍;;大黃酸金屬配合物的合成、表征及抗氧化活性研究[J];化學學報;2011年08期
3 黃文奇,黃勤波,石赫;求解蛋白質結構預測問題的二維連續(xù)模型及其相應的擬物算法[J];計算機研究與發(fā)展;2004年11期
4 喬園園,郭盛;分子模擬軟件MOE及其在藥物發(fā)現(xiàn)中的應用示例[J];計算機與應用化學;2005年02期
5 顧穎;韓素萍;張曄;;RhoA、RAC1在宮頸癌組織中的表達及其臨床意義[J];蘇州大學學報(醫(yī)學版);2008年01期
6 葉娟平;劉韜;戴昆怡;黃紅兵;;放射增敏劑的臨床研究進展[J];醫(yī)藥導報;2009年07期
7 Sobia Idrees;Usman Ali Ashfaq;;Discovery and design of cyclic peptides as dengue virus inhibitors through structure-based molecular docking[J];Asian Pacific Journal of Tropical Medicine;2014年07期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 王興坡;以基質金屬蛋白酶為靶點的大黃素類衍生物的設計、合成、生物活性及定量構效關系研究[D];山東大學;2006年
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 何穎;大黃酸和蘆薈大黃素的成酯拼合及其抗腫瘤研究[D];瀘州醫(yī)學院;2011年
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本文編號:342156
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