發(fā)布時間：2018-07-22 15:05

【摘要】：目的研究旋轉(zhuǎn)細(xì)胞培養(yǎng)系統(tǒng)(RCCS)模擬微重力環(huán)境對小鼠成纖維細(xì)胞株L929 lncRNA表達(dá)的影響。方法體外培養(yǎng)L929細(xì)胞,隨機分為模擬微重力組(SMG組)和正常重力組(NG組),每組3個樣本。SMG組回轉(zhuǎn)器軸心與地面平行旋轉(zhuǎn),NG組回轉(zhuǎn)器軸心與地面垂直旋轉(zhuǎn),兩組轉(zhuǎn)速一致。RCCS培養(yǎng)7d,收集樣本,提取樣本總RNA,進(jìn)行熒光標(biāo)記和芯片雜交。利用Agilent Mouse lncRNA芯片分別檢測SMG組和NG組L929細(xì)胞的lncRNA和mRNA表達(dá),篩選差異表達(dá)顯著的lncRNA,RT-q PCR驗證芯片結(jié)果;利用GO和Pathway分析差異表達(dá)lncRNA的功能分布,結(jié)合mRNA差異表達(dá)譜,進(jìn)行l(wèi)ncRNA-mRNA聯(lián)合分析。結(jié)果 lncRNA芯片檢測分析發(fā)現(xiàn),RCCS模擬微重力環(huán)境下小鼠成纖維細(xì)胞L929共有238條差異表達(dá)的lncRNA,其中134條表達(dá)上調(diào),104條表達(dá)下調(diào);差異表達(dá)的mRNA共有237條,其中53條表達(dá)上調(diào),184條表達(dá)下調(diào)。獲取差異表達(dá)lncRNA的聚類分析圖,對差異表達(dá)顯著的4條lncRNA芯片結(jié)果進(jìn)行RT-q PCR驗證,結(jié)果相吻合。GO分析結(jié)果顯示差異表達(dá)的lncRNA與巨噬細(xì)胞分化、傷口愈合的負(fù)性調(diào)節(jié)等生物學(xué)過程相關(guān),Pathway分析結(jié)果顯示差異表達(dá)的lncRNA與系統(tǒng)性紅斑狼瘡、TGF-β等信號通路相關(guān)。同時成功構(gòu)建了lncRNA-mRNA-TF可視化網(wǎng)絡(luò)圖。結(jié)論 RCCS模擬微重力環(huán)境顯著影響L929細(xì)胞的lncRNA及mRNA表達(dá)譜,基于芯片技術(shù)的lncRNA靶基因預(yù)測和功能富集分析可為失重應(yīng)激損傷機制探討和修復(fù)措施建立提供理論依據(jù)。
[Abstract]:Objective to study the effect of rotating cell culture system (RCCS) on the expression of L929 lncRNA in mouse fibroblasts. Methods L929 cells were cultured in vitro and randomly divided into simulated microgravity group (SMG group) and normal gravity group (NG group). The two groups were cultured at the same speed for 7 days. The samples were collected, the total RNAs were extracted, and the fluorescence labeling and chip hybridization were performed. Agilent mouse lncRNA chip was used to detect the expression of L929 cells in SMG group and NG group, to screen the differentially expressed L929 cells to verify the microarray results, to analyze the functional distribution of differentially expressed L929 cells by go and Pathway, and to combine the differential expression profiles of L929 cells. Combined analysis of lncRNA-mRNA was performed. Results L929 mouse fibroblasts under simulated microgravity environment had 238 differentially expressed lncRNAs, 134 of which up-regulated and 104 down-regulated, and 237 differentially expressed mRNA. Among them, 53 were up-regulated and 184 were down-regulated. Cluster analysis of differentially expressed lncRNA was obtained, and the results of four differentially expressed lncRNA microarrays were verified by RT-q PCR. The results of .go analysis showed that the differentially expressed lncRNA differentiated from macrophages. The differential expression of lncRNA was associated with signal pathways such as TGF- 尾 in systemic lupus erythematosus. At the same time, the visual network diagram of lncRNA-mRNA-TF was constructed successfully. Conclusion RCCS simulated microgravity environment significantly affects L929 cell L929 mRNA expression profile. The prediction of L929 L929 cell line target gene and functional enrichment analysis based on microarray technology can provide a theoretical basis for the study of weightlessness stress injury mechanism and the establishment of repair measures.
【作者單位】： 安徽醫(yī)科大學(xué)解放軍306醫(yī)院臨床學(xué)院普通外科;解放軍306醫(yī)院普通外科;解放軍306醫(yī)院特種醫(yī)學(xué)實驗研究中心;解放軍306醫(yī)院病理科;
【基金】：全軍醫(yī)學(xué)科研十二五重點項目(BWS11J051) 全軍試驗技術(shù)研究計劃重點項目(SYFD1500128)~~
【分類號】：R852.22

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 賈秀志;張鳳蘊;張華;任歡;郭蓉嬌;孫野青;;模擬微重力對人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞血管生成素產(chǎn)生的影響[J];國際免疫學(xué)雜志;2007年06期

2 康春燕;劉長庭;鄒琳;袁明;章燁;李天志;王洋;王德龍;劉巖;;模擬微重力對人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡的影響[J];解放軍醫(yī)學(xué)雜志;2010年11期

3 康春燕;袁明;鄒琳;章燁;李天志;王俊鋒;劉長庭;;模擬微重力對肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞窖蛋白-1和內(nèi)皮型一氧化氮合酶表達(dá)的影響[J];解放軍醫(yī)學(xué)雜志;2010年11期

4 張翠;李亮;王金福;;空間微重力環(huán)境及其地基模擬微重力條件對干細(xì)胞影響的研究[J];中華細(xì)胞與干細(xì)胞雜志(電子版);2013年04期

5 孫磊,向求魯,汪德生,任維;微重力與模擬微重力條件下的肺循環(huán)變化[J];航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程;2000年04期

6 趙琦,李軍 ,劉敏;模擬微重力對植物幼苗光合特性的影響(英文)[J];航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程;2002年02期

7 姚宇華,嚴(yán)洪,熊江輝,李瑩輝,馬永生;模擬微重力條件下心肌細(xì)胞骨架的灰度統(tǒng)計特征分析[J];中國生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)報;2005年03期

8 戢玉環(huán);李呼倫;王丹丹;孫博;穆莉莉;呂桂香;金連弘;王菁華;;模擬微重力對神經(jīng)細(xì)胞形態(tài)及其生長的影響[J];航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程;2007年05期

9 周藝;朱寶安;郭愛娟;譚信;;模擬微重力對大鼠睪丸中睪酮合成相關(guān)基因表達(dá)的影響[J];航天醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)工程;2008年06期

10 張錄衛(wèi);劉陽;張紅;王振華;武振華;趙衛(wèi)平;;模擬微重力條件下C離子輻射對小鼠生殖器官的影響[J];原子核物理評論;2011年03期

相關(guān)會議論文 前10條

1 鄭紅霞;田維明;魏力軍;岳磊;李鈺;;模擬微重力效應(yīng)對小鼠成纖維細(xì)胞和大鼠嗜鉻瘤細(xì)胞形態(tài)和生物學(xué)特征的影響[A];中國空間科學(xué)學(xué)會第七次學(xué)術(shù)年會會議手冊及文集[C];2009年

2 陳海龍;曲麗娜;李瑩輝;;模擬微重力下黃酮類化合物對神經(jīng)細(xì)胞的保護作用[A];中國空間科學(xué)學(xué)會第七次學(xué)術(shù)年會會議手冊及文集[C];2009年

3 劉桂蘭;劉寧;阮繼生;黃英;;模擬微重力對鏈霉菌生長和代謝的影響[A];中國空間科學(xué)學(xué)會第七次學(xué)術(shù)年會會議手冊及文集[C];2009年

4 杭曉明;劉聰;馬雯雯;孫野青;;模擬微重力對斑馬魚胚胎骨形成影響的分析[A];“基因、進(jìn)化與生理功能多樣性”海內(nèi)外學(xué)術(shù)研討會暨中國生理學(xué)會第七屆比較生理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要[C];2009年

5 于建茹;譚映軍;聶捷琳;;雙向多樣本模擬微重力效應(yīng)實驗平臺的研制[A];第二十三屆中國（天津）2009IT、網(wǎng)絡(luò)、信息技術(shù)、電子、儀器儀表創(chuàng)新學(xué)術(shù)會議論文集[C];2009年

6 楊芬;李瑩輝;聶捷琳;畢蕾;黃增明;劉淑芳;熊江輝;;模擬微重力條件下新生大鼠心肌細(xì)胞三維培養(yǎng)體系的構(gòu)建[A];全面建設(shè)小康社會：中國科技工作者的歷史責(zé)任——中國科協(xié)2003年學(xué)術(shù)年會論文集（上）[C];2003年

7 宮喜魁;趙琦;;模擬微重力條件下擬南芥基因表達(dá)變化的研究[A];2011年空間生命與生命起源暨航天醫(yī)學(xué)工程學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2011年

8 劉桂蘭;劉寧;阮繼生;黃英;;微重力對鏈霉菌的生物學(xué)效應(yīng)初探[A];2008年中國微生物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2008年

9 劉競爭;王前;鄭磊;;模擬微重力影響CD34+造血細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子GATA-1mRNA表達(dá)的實驗研究[A];2008年全國生物流變學(xué)與生物力學(xué)學(xué)術(shù)會議論文摘要集[C];2008年

10 張宇;桑晨;趙子彥;莊逢源;;模擬微重力對人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞ICAM-1及VCAM-1的影響[A];中國空間科學(xué)學(xué)會第七次學(xué)術(shù)年會會議手冊及文集[C];2009年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前2條

1 王海立;模擬微重力環(huán)境中肺炎克雷伯菌重要生理表型變化及其潛在機制研究[D];中國人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2016年

2 康春燕;模擬微重力下人肺微血管內(nèi)皮細(xì)胞凋亡信號通路及藥物干預(yù)[D];中國人民解放軍軍醫(yī)進(jìn)修學(xué)院;2011年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 張敏;模擬微重力恢復(fù)培養(yǎng)對HUVEC-C細(xì)胞增殖抑制的研究[D];大連海事大學(xué);2015年

2 吳彬;模擬微重力對K562細(xì)胞紅系分化及細(xì)胞骨架的影響研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2015年

3 曾凡;模擬微重力對哺乳動物不同腦區(qū)神經(jīng)組織細(xì)胞的影響研究[D];北京理工大學(xué);2016年

4 許崇玉;模擬微重力對獼猴肺組織結(jié)構(gòu)及基質(zhì)金屬蛋白酶表達(dá)的影響[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2016年

5 田西朋;RCCS模擬微重力對小鼠肝Kupffer細(xì)胞影響的實驗研究[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2016年

6 曲航;黑木耳肽鈣螯合物對模擬微重力誘導(dǎo)骨流失防護作用研究[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2016年

7 馬雯雯;模擬微重力下脊椎動物胚胎發(fā)育研究模型建立[D];大連海事大學(xué);2010年

8 毛新建;模擬微重力對骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞增殖和遷移的影響及相關(guān)分子機理研究[D];重慶大學(xué);2014年

9 譚雄進(jìn);模擬微重力對大鼠負(fù)重骨骨代謝及骨折愈合影響的實驗研究[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2002年

10 王香寒;模擬微重力對人腦神經(jīng)組織形態(tài)學(xué)影響的研究[D];北京理工大學(xué);2015年

，

本文編號：2137851