本文關(guān)鍵詞：模擬失重下小鼠成骨細胞功能相關(guān)miRNA生物信息學預測

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【摘要】：目的應用生物信息學方法預測模擬失重環(huán)境下與小鼠成骨細胞功能變化相關(guān)的miRNAs。方法收集并整理已報道的針對模擬失重環(huán)境下小鼠成骨細胞內(nèi)mRNAs表達變化的基因芯片檢測數(shù)據(jù),分析差異表達顯著的mRNAs,搜集其基因組定位信息;在miRBase數(shù)據(jù)庫中查找處于這些基因組位置上的內(nèi)含子miRNAs,并應用靶基因預測、GO富集分析和KEGG pathway富集分析進行后續(xù)miRNA功能預測。結(jié)果鑒定出5種與宿主mRNA共處同一轉(zhuǎn)錄單元的潛在內(nèi)含子miRNAs。結(jié)論預測出的5種內(nèi)含子miRNAs在模擬失重環(huán)境所致成骨細胞功能變化中具有潛在調(diào)控作用,為進一步實驗研究提供數(shù)據(jù)支持和理論指導。
【作者單位】： 第四軍醫(yī)大學航空航天生物動力學教研室航空航天醫(yī)學國家教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然科學基金項目(31170889,30870595)
【分類號】：R85
【正文快照】： MicroRNAs(miRNAs)是近年來發(fā)現(xiàn)的一類長約19～24 nt的內(nèi)源性單鏈非編碼小RNA,它主要通過與靶mRNA的3’非轉(zhuǎn)錄區(qū)(3’UTR)上特異性堿基序列互補配對,從而抑制靶mRNA的翻譯或?qū)е缕浣到?在基因轉(zhuǎn)錄后水平以“微調(diào)”的形式精細調(diào)控功能蛋白的表達,參與到細胞增殖、分化、代謝及

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本文編號：1289136