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模擬失重下小鼠成骨細(xì)胞功能相關(guān)miRNA生物信息學(xué)預(yù)測(cè)

發(fā)布時(shí)間:2017-12-14 19:40

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【摘要】:目的應(yīng)用生物信息學(xué)方法預(yù)測(cè)模擬失重環(huán)境下與小鼠成骨細(xì)胞功能變化相關(guān)的miRNAs。方法收集并整理已報(bào)道的針對(duì)模擬失重環(huán)境下小鼠成骨細(xì)胞內(nèi)mRNAs表達(dá)變化的基因芯片檢測(cè)數(shù)據(jù),分析差異表達(dá)顯著的mRNAs,搜集其基因組定位信息;在miRBase數(shù)據(jù)庫(kù)中查找處于這些基因組位置上的內(nèi)含子miRNAs,并應(yīng)用靶基因預(yù)測(cè)、GO富集分析和KEGG pathway富集分析進(jìn)行后續(xù)miRNA功能預(yù)測(cè)。結(jié)果鑒定出5種與宿主mRNA共處同一轉(zhuǎn)錄單元的潛在內(nèi)含子miRNAs。結(jié)論預(yù)測(cè)出的5種內(nèi)含子miRNAs在模擬失重環(huán)境所致成骨細(xì)胞功能變化中具有潛在調(diào)控作用,為進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)研究提供數(shù)據(jù)支持和理論指導(dǎo)。
【作者單位】: 第四軍醫(yī)大學(xué)航空航天生物動(dòng)力學(xué)教研室航空航天醫(yī)學(xué)國(guó)家教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31170889,30870595)
【分類(lèi)號(hào)】:R85
【正文快照】: MicroRNAs(miRNAs)是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的一類(lèi)長(zhǎng)約19~24 nt的內(nèi)源性單鏈非編碼小RNA,它主要通過(guò)與靶mRNA的3’非轉(zhuǎn)錄區(qū)(3’UTR)上特異性堿基序列互補(bǔ)配對(duì),從而抑制靶mRNA的翻譯或?qū)е缕浣到?在基因轉(zhuǎn)錄后水平以“微調(diào)”的形式精細(xì)調(diào)控功能蛋白的表達(dá),參與到細(xì)胞增殖、分化、代謝及

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):1289136

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