目的:在人類的23對染色體中,有22對為常染色體,另1對為性染色體。在不同性別中,男性性染色體組成為XY,女性為XX。Y染色體僅存在于男性細胞中,屬于近端著絲粒染色體。在人類Y染色體上有五類多態(tài)性遺傳標記,包括衛(wèi)星DNA、小衛(wèi)星DNA、微衛(wèi)星DNA、InDel及SNP。而對Y染色體進行分析的意義在于Y染色體僅存在于男性個體中,且Y染色體STR穩(wěn)定的由父代男性遺傳給子代男性。Y染色體STR基因座呈單倍體父系伴性遺傳的特性,與常染色體STR基因座相比較而言在法醫(yī)學鑒定中具有其獨特性。隨著科技的發(fā)展進步,測序技術的進步也是日新月異。目前使用的測序技術主要有Sanger測序、焦磷酸測序以及正在迅速發(fā)展的新一代測序技術。新一代測序技術一次可對多個樣本的幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定,測序準確度可達99%以上,其單次測序所產(chǎn)生的高質(zhì)量數(shù)據(jù)在平均水平下已經(jīng)足以覆蓋人類基因組30倍以上,為DNA分析提供了一種全新的技術手段。DYF155S1基因座是被報道的第一個Y染色體上的小衛(wèi)星多態(tài)性位點,同時具有長度多態(tài)性和序列多態(tài)性,而且不同民族間存在重復序列排列差異。因此本研究擬在以下三方面做探索:1、... 

【文章頁數(shù)】：114 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分 :運用NGS檢測Y-STR位點的法醫(yī)學意義
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 實驗樣品
            2.1.2 主要試劑與耗材
            2.1.3 主要儀器
            2.1.4 主要軟件、計算機語言及網(wǎng)絡工具
        2.2 實驗方法
            2.2.1 DNA提取及質(zhì)量檢測
            2.2.2 目的片段擴增及質(zhì)量檢測
            2.2.3 文庫構建及質(zhì)量檢測
            2.2.4 序列測定及數(shù)據(jù)處理
    3 結(jié)果
        3.1 瓊脂糖檢測結(jié)果
            3.1.1 目的片段擴增及質(zhì)量檢測結(jié)果
            3.1.2 文庫質(zhì)量檢測結(jié)果
        3.2 捕獲區(qū)域序列
        3.3 測序結(jié)果質(zhì)量分析
            3.3.1 測序數(shù)據(jù)統(tǒng)計
            3.3.2 參考基因組比對結(jié)果
        3.4 STR位點測序及試劑盒分型結(jié)果
            3.4.1 全基因組測序結(jié)果
            3.4.2 區(qū)域捕獲測序結(jié)果
            3.4.3 區(qū)域捕獲測序?qū)o關個體測序結(jié)果及試劑盒分型結(jié)果
            3.4.4 區(qū)域捕獲測序?qū)Ω缸訕悠窚y序結(jié)果
            3.4.5 混合樣品測序結(jié)果及試劑盒分型結(jié)果
        3.5 SNP位點測序結(jié)果
    4 討論
        4.1 文庫構建
        4.2 STR位點測序結(jié)果分析
            4.2.1 無關樣品測序結(jié)果分析
            4.2.2 父子樣品測序結(jié)果分析
            4.2.3 混合樣品測序結(jié)果分析
        4.3 SNP分析
    5 結(jié)論
第二部分 :DYF155S1位點重復序列排列的種族與個體差異
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 實驗樣品
            2.1.2 主要試劑與耗材
            2.1.3 主要儀器設備及分析軟件
        2.2 實驗方法
            2.2.1 DNA提取
            2.2.2 PCR擴增
            2.2.3 PCR產(chǎn)物序列測定
    3 結(jié)果
        3.1 樣品的PCR分型
        3.2 重復序列測序結(jié)果
        3.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計結(jié)果
    4 討論
    5 結(jié)論
第三部分 :延邊朝鮮族19個Y-STR的多態(tài)性分布
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 實驗樣品
            2.1.2 主要試劑及材料
            2.1.3 主要儀器及分析軟件
        2.2 實驗方法
            2.2.1 DNA的提取
            2.2.2 模板DNA的質(zhì)量控制
            2.2.3 PCR擴增
            2.2.4 PCR反應循環(huán)參數(shù)
            2.2.5 擴增產(chǎn)物的檢測
            2.2.6 擴增產(chǎn)物分型
            2.2.7 統(tǒng)計分析
    3 結(jié)果
        3.1 Y染色體STR分型結(jié)果
        3.2 Y染色體STR基因座的等位基因頻率分布
            3.2.1 19個Y染色體STR基因座的GD值
            3.2.2 遼寧漢族群體與YHRD數(shù)據(jù)庫中其他群體間的遺傳距離
    4 討論
    5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷


【參考文獻】：
期刊論文
[1]基于Ion Torrent PGMTM測序平臺的CSF1PO和D18S51基因座分析[J]. 楊儀尊,平原.  法醫(yī)學雜志. 2018(05)
[2]內(nèi)蒙古鄂溫克族人群30個InDel位點遺傳多態(tài)性[J]. 靳小業(yè),魏媛媛,賀永鋒,郭瑜鑫,梅婷,孟昊天,張玉黨,孔婷婷,朱波峰.  法醫(yī)學雜志. 2017(03)
[3]用于中國人群個體識別的InDel多重PCR系統(tǒng)的構建[J]. 王瑋,趙蕾,江麗,劉京,黃美莎,李冉冉,劉佳佳,馬泉,王英元,李彩霞.  刑事技術. 2017(01)
[4]30個InDel在河南漢族人群中的法醫(yī)學應用[J]. 劉亞舉,張俊濤,岳俊濤,郭利紅,劉海,張毅,李效陽.  法醫(yī)學雜志. 2015(01)
[5]30個InDel位點在華東漢族和畬族人群的法醫(yī)學應用[J]. 胡真,王正,張素華,趙書民,朱如心,孫寬,李成濤.  法醫(yī)學雜志. 2014(05)
[6]北京漢族群體30個常染色體InDel位點群體遺傳學及法醫(yī)學研究[J]. 百茹峰,姜立喆,張中,石美森.  遺傳. 2013(12)



本文編號：3647056