應(yīng)用短擴(kuò)增子ASPCR技術(shù)對FFPET進(jìn)行SNP基因分型的研究
發(fā)布時間：2021-09-02 17:58
前言福爾馬林固定石蠟包埋組織（Formalin Fixed and Paraffin Embedded Tissues，F(xiàn)FPET）是病理學(xué)、法醫(yī)病理學(xué)等學(xué)科進(jìn)行疾病診斷和科學(xué)研究的常用檢材，多被長時期的保存而成為一種重要的個人實物檔案，為解決涉嫌保險欺詐、醫(yī)療糾紛、財產(chǎn)繼承等民事或刑事案件提供了一種極為重要的、可靠的法醫(yī)物證檢材�；贑ODIS系統(tǒng)13個STR位點的Plus和Cofiler等試劑盒，雖已廣泛應(yīng)用于血液、唾液、上皮組織、發(fā)根及骨組織的基因分型，但是對FFPET進(jìn)行基因分型時，常因組織固定過程中各種理化因素的影響致使DNA高度降解，從而難以獲得穩(wěn)定、可靠的分型結(jié)果。研究表明，福爾馬林固定時間、切片厚度以及不同的脫蠟方法均可影響FFPET提取DNA的質(zhì)量，從而影響其基因分型。通過優(yōu)化蛋白酶消化條件，精簡DNA提取步驟和純化DNA模板雖能提高DNA純度和減少DNA額外損傷，但并不能給FFPET的基因分型帶來本質(zhì)的改觀；通過增加循環(huán)次數(shù)或采用巢式PCR等對PCR方法進(jìn)行調(diào)整與改良，可以提高擴(kuò)增產(chǎn)物量或擴(kuò)增特異性，但并未明顯改善其檢出率。因此，越來越多的學(xué)者將研究的重點轉(zhuǎn)移到如何...
【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：42 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
FFPET提取DNA的AGE圖譜
3T3AA，一T八乙M1T1A圖2， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物PAGE圖譜T、A表示 rs1354361基因座兩等位基因;l、2、3為樣品號，其基因型分別為:AA，TT，TA;M為MarkerA， 1t.B圖3， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物測序結(jié)果A圖為F瓜，(T)引物對PcR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖B圖為F/RZ(A)引物對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖(二)群體分布調(diào)查應(yīng)用短擴(kuò)增子ASPCR技術(shù)調(diào)查rs1454361基因座在中國遼寧地區(qū)漢族人群(152例)中多態(tài)性分布的結(jié)果:TT型為40例(26.32%)
1t.B圖3， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物測序結(jié)果A圖為F瓜，(T)引物對PcR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖B圖為F/RZ(A)引物對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖(二)群體分布調(diào)查應(yīng)用短擴(kuò)增子ASPCR技術(shù)調(diào)查rs1454361基因座在中國遼寧地區(qū)漢族人群(152例)中多態(tài)性分布的結(jié)果:TT型為40例(26.32%)，TA型為71例(46.71%)，從.16.
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]福爾馬林固定石蠟包埋組織中DNA提取[J]. 譚卓毅,丁梅,王保捷. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2006(06)
[2]降解生物檢材遺傳標(biāo)記檢測的研究進(jìn)展[J]. 何柏芳,樓迪棟. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2006(02)
[3]不同溫度下離體人脾細(xì)胞DNA降解的差異性研究[J]. 何方剛,劉亞玲,舒細(xì)記,任亮,朱方成,王琦瑋,王樹發(fā),黃知軍,劉良. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2005(06)
[4]降解檢材STR分型Ladder-Like條帶形成原因的探討[J]. 樓迪棟,余純應(yīng),黃代新,趙貴森,任文,楊慶恩. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2005(06)
[5]普通甲醛固定石蠟包埋組織DNA提取方法的探討[J]. 田子強(qiáng),劉俊峰,張少為,李保慶,王福順,張月峰. 癌癥. 2004(03)
[6]Triton X-100快速提取甲醛固定、石蠟包埋組織內(nèi)DNA的方法[J]. 賈怡,周斌,呂梅勵,梁偉波,胡羽,張林. 刑事技術(shù). 2003(06)
[7]石蠟包埋人體組織DNA分型的研究[J]. 周毅,嚴(yán)紅,李萬水,張大安,李俊濤. 刑事技術(shù). 2003(04)
[8]提高石蠟包埋組織中提取DNA質(zhì)量的實驗研究[J]. 蓋寶東,房學(xué)東,金仲田,張德恒,鄭澤霖. 吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2003(01)
[9]福爾馬林固定石蠟包埋組織的PCR-STR分型[J]. 王劍,顧明波,杜慶新,李曉平,陳弄潮. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2002(03)
[10]兩種提取石蠟包埋組織DNA方法的比較[J]. 張金生,劉鴻瑞. 診斷病理學(xué)雜志. 2000(02)
本文編號：3379466
【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】：42 頁
【學(xué)位級別】：碩士
【部分圖文】：
FFPET提取DNA的AGE圖譜
3T3AA，一T八乙M1T1A圖2， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物PAGE圖譜T、A表示 rs1354361基因座兩等位基因;l、2、3為樣品號，其基因型分別為:AA，TT，TA;M為MarkerA， 1t.B圖3， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物測序結(jié)果A圖為F瓜，(T)引物對PcR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖B圖為F/RZ(A)引物對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖(二)群體分布調(diào)查應(yīng)用短擴(kuò)增子ASPCR技術(shù)調(diào)查rs1454361基因座在中國遼寧地區(qū)漢族人群(152例)中多態(tài)性分布的結(jié)果:TT型為40例(26.32%)
1t.B圖3， rs1454361基因座擴(kuò)增產(chǎn)物測序結(jié)果A圖為F瓜，(T)引物對PcR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖B圖為F/RZ(A)引物對PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測序圖(二)群體分布調(diào)查應(yīng)用短擴(kuò)增子ASPCR技術(shù)調(diào)查rs1454361基因座在中國遼寧地區(qū)漢族人群(152例)中多態(tài)性分布的結(jié)果:TT型為40例(26.32%)，TA型為71例(46.71%)，從.16.
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]福爾馬林固定石蠟包埋組織中DNA提取[J]. 譚卓毅,丁梅,王保捷. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2006(06)
[2]降解生物檢材遺傳標(biāo)記檢測的研究進(jìn)展[J]. 何柏芳,樓迪棟. 法醫(yī)學(xué)雜志. 2006(02)
[3]不同溫度下離體人脾細(xì)胞DNA降解的差異性研究[J]. 何方剛,劉亞玲,舒細(xì)記,任亮,朱方成,王琦瑋,王樹發(fā),黃知軍,劉良. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2005(06)
[4]降解檢材STR分型Ladder-Like條帶形成原因的探討[J]. 樓迪棟,余純應(yīng),黃代新,趙貴森,任文,楊慶恩. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2005(06)
[5]普通甲醛固定石蠟包埋組織DNA提取方法的探討[J]. 田子強(qiáng),劉俊峰,張少為,李保慶,王福順,張月峰. 癌癥. 2004(03)
[6]Triton X-100快速提取甲醛固定、石蠟包埋組織內(nèi)DNA的方法[J]. 賈怡,周斌,呂梅勵,梁偉波,胡羽,張林. 刑事技術(shù). 2003(06)
[7]石蠟包埋人體組織DNA分型的研究[J]. 周毅,嚴(yán)紅,李萬水,張大安,李俊濤. 刑事技術(shù). 2003(04)
[8]提高石蠟包埋組織中提取DNA質(zhì)量的實驗研究[J]. 蓋寶東,房學(xué)東,金仲田,張德恒,鄭澤霖. 吉林大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2003(01)
[9]福爾馬林固定石蠟包埋組織的PCR-STR分型[J]. 王劍,顧明波,杜慶新,李曉平,陳弄潮. 中國法醫(yī)學(xué)雜志. 2002(03)
[10]兩種提取石蠟包埋組織DNA方法的比較[J]. 張金生,劉鴻瑞. 診斷病理學(xué)雜志. 2000(02)
本文編號：3379466
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