常熟地區(qū)人群Y染色體STR和SNP遺傳結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-21 23:17
目的通過對(duì)常熟地區(qū)家系特異性核心單倍群和區(qū)域特異性遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行分析,為構(gòu)建特定地區(qū)的Y染色體數(shù)據(jù)庫提供理論基礎(chǔ)。方法采集常熟地區(qū)1 702名漢族男性無關(guān)個(gè)體的血樣,使用YfilerTM Plus PCR擴(kuò)增試劑盒對(duì)27個(gè)Y-STR進(jìn)行基因分型,再用Y-Predictor軟件推測(cè)各樣本的Y-SNP單倍群,并選取部分樣本通過擴(kuò)增受阻突變系統(tǒng)聚合酶鏈反應(yīng)(amplification refractory mutation system-polymerasechain reaction,ARMS-PCR)進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果 1 702例樣本的27個(gè)Y-STR遺傳標(biāo)記共檢出1 556種單倍型,單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)值為0.999 827,基因多樣性(gene diversity,GD)值最高的是DYS385(0.933),最低的是DYS438(0.409)。通過Y-Predictor軟件確定全部樣本來自C、D、N、O、Q和R下游162種細(xì)支單倍群。隨機(jī)選擇樣本對(duì)軟件預(yù)測(cè)結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證,預(yù)測(cè)正確率達(dá)95.74%。結(jié)論本研究發(fā)現(xiàn)27個(gè)Y-STR遺傳標(biāo)記在常熟地區(qū)人群中...
【文章來源】:法醫(yī)學(xué)雜志. 2020,36(04)CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
常熟地區(qū)O1a1a1a1a*單倍群27個(gè)Y-STR的網(wǎng)絡(luò)圖
本文編號(hào):3295959
【文章來源】:法醫(yī)學(xué)雜志. 2020,36(04)CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
常熟地區(qū)O1a1a1a1a*單倍群27個(gè)Y-STR的網(wǎng)絡(luò)圖
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