目的探索在模擬失重下巨噬細(xì)胞RAW264.7差異表達(dá)的長(zhǎng)鏈非編碼RNAs（Lnc RNA）及其生物學(xué)意義。方法巨噬細(xì)胞RAW264.7隨機(jī)分為對(duì)照組（C）和模擬失重組（Z）,Z組細(xì)胞回轉(zhuǎn)72小時(shí)模擬失重,采用Arraystar小鼠長(zhǎng)鏈非編碼RNA芯片鑒別對(duì)照和模擬失重組巨噬細(xì)胞Lnc RNAs表達(dá)譜的差異。通過(guò)volcano法鑒別（差異倍數(shù)≥2.0,P≤0.05）兩組間有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異的Lnc RNAs,對(duì)篩選的差異表達(dá)Lnc RNAs以熒光定量PCR技術(shù)進(jìn)行驗(yàn)證。采用GO和KEGG分析預(yù)測(cè)Lnc RNAs的潛在功能,以e Bioscience基于Luminex的多重免疫分析技術(shù)和流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)炎癥因子分泌及細(xì)胞凋亡,以Western blotting技術(shù)研究相關(guān)蛋白表達(dá)水平變化。結(jié)果Lnc RNA芯片結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,模擬失重組有693個(gè)差異表達(dá)的Lnc RNAs,其中328個(gè)Lnc RNAs表達(dá)上調(diào),365個(gè)Lnc RNAs表達(dá)下調(diào)的。q RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果表明,Lnc RNAs ENSMUST00000137470,uc009oqw.1,uc007wem.2,NR_0... 

【文章來(lái)源】：錦州醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：63 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

LncRNA芯片實(shí)驗(yàn)、數(shù)據(jù)操作分析流程圖

圖 2 LncRNA Z vs C 聚類分析圖4、LncRNA 散點(diǎn)圖較模擬失重組和對(duì)照組之間的全部lncRNA表達(dá)譜的散點(diǎn)圖(scatter紅線表示lncRNA表達(dá)在任一方向上的雙重差異。 散點(diǎn)圖表明樣本集中趨勢(shì)。紅色表示上調(diào)2倍lncRNA，綠色表示下調(diào)2倍lncRNA。獲得差異上調(diào)LncRNA398個(gè)，即為圖3中紅色點(diǎn)；差異下調(diào)LncRNA3中綠色點(diǎn)；沒(méi)有明顯差異的LncRNA 21231個(gè)，即為圖3中黑色點(diǎn)

圖 3 LncRNA Z vs C 散點(diǎn)圖RNA 火山圖olcano plot)，用于比較兩組樣品的顯著性差異。正負(fù)紅色的點(diǎn)表示P值小于0.05，差異倍數(shù)大于2的差異基P值小于0.05，差異倍數(shù)小于-2的差異基因（探針）。LncRNA325個(gè)（圖4中紅色點(diǎn)），差異下調(diào)LncRNA有明顯差異的LncRNA 21351個(gè)（圖4中黑色的點(diǎn)）

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：2916420