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基于GPU數(shù)據(jù)并行處理的血管內(nèi)OCT成像研究

發(fā)布時(shí)間:2020-10-11 20:09
   目前,心血管疾病已成為世界疾病的首位死因。為了早預(yù)防心血管疾病的發(fā)生,光學(xué)相干斷層的影像技術(shù)(OCT)可以對(duì)心血管疾病精準(zhǔn)判斷,但是血管內(nèi)OCT成像時(shí)需要處理大量的數(shù)據(jù)。根據(jù)現(xiàn)有采用CPU的串行方式處理導(dǎo)致數(shù)據(jù)處理時(shí)間長(zhǎng)。因此,將CPU串行的運(yùn)算算法移植到圖像處理單元(GPU)中解決數(shù)據(jù)并行處理的問題,并且實(shí)現(xiàn)血管三維OCT的圖像重構(gòu)。本論文闡述GPU在CUDA軟件體系中對(duì)GPU的和內(nèi)核配置和線程管理,解決血管內(nèi)OCT影像2D和3D數(shù)據(jù)的并行處理問題。本文主要內(nèi)容包括以下幾方面:1.提出了血管內(nèi)OCT成像數(shù)據(jù)并行處理方法:血管內(nèi)OCT成像技術(shù)在血管檢測(cè)的成像需要對(duì)大量的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,并且實(shí)現(xiàn)血管OCT系統(tǒng)實(shí)時(shí)的處理2D和3D的數(shù)據(jù)。對(duì)比FPGA、DSP、GPU和CPU對(duì)數(shù)據(jù)處理的效率驗(yàn)證,確認(rèn)血管內(nèi)OCT系統(tǒng)采用GPU的設(shè)計(jì)方案。將數(shù)據(jù)處理的串行算法移植到GPU中實(shí)現(xiàn)血管OCT的數(shù)據(jù)并行處理。驗(yàn)證各個(gè)GPU函數(shù)接口的運(yùn)行效率。2.提出了GPU并行算法內(nèi)核配置和線程管理優(yōu)化方法:在CUAD軟件體系下實(shí)現(xiàn)GPU的內(nèi)核和線程資源配置的算法接口。將GPU算法的控制接口輸出動(dòng)態(tài)鏈接庫(DLL),在Lab VIEW軟件平臺(tái)上調(diào)研GPU算法接口進(jìn)行仿真,對(duì)比血管OCT成像各算法實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)并行的效率。3.研發(fā)基于GPU數(shù)據(jù)并行處理方法的心血管OCT影像系統(tǒng)和3D建模:搭建血管內(nèi)OCT技術(shù)成像的硬件系統(tǒng),在Lab VIEW軟件平臺(tái)調(diào)用CUDA的算法實(shí)現(xiàn)血管內(nèi)OCT成像系統(tǒng)的2D實(shí)時(shí)成像。在該平臺(tái)上驗(yàn)證GPU極坐標(biāo)運(yùn)算和動(dòng)態(tài)線程管理的運(yùn)算結(jié)果,實(shí)現(xiàn)較大的加速比。最后實(shí)現(xiàn)血管內(nèi)OCT成像的3D重構(gòu),通過GPU加速實(shí)現(xiàn)血管內(nèi)OCT的成像系統(tǒng)回拉300幀的圖像進(jìn)行3D模型。因此,通過低成本的GPU的方案實(shí)現(xiàn)血管內(nèi)OCT系統(tǒng)實(shí)時(shí)圖像顯示3D血管內(nèi)的組織可視化,該系統(tǒng)滿足了心血管疾病精準(zhǔn)診斷的需求。
【學(xué)位單位】:中國(guó)科學(xué)院大學(xué)(中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2019
【中圖分類】:R54;R816.2;TP391.41
【部分圖文】:

架構(gòu)圖,多級(jí)緩存,架構(gòu),并行處理


圖 2.2CPU 多級(jí)緩存架構(gòu)[36]據(jù)并行處理的架構(gòu)ic Processing Unit中文意思為“圖形處理器”,簡(jiǎn)稱為GPU。(算術(shù)運(yùn)算單元),它可以在很少的時(shí)鐘周期內(nèi)完成算術(shù)力與CPU相比優(yōu)勢(shì)顯而易見,通過GPU并行處理可以大規(guī)在圖像處理領(lǐng)域中的運(yùn)算也越來越廣泛[37]。CPU與GPU圖2.3所示。圖 2.3CPU 與 GPU 內(nèi)部邏輯架構(gòu)對(duì)比[36]

架構(gòu)圖,內(nèi)部邏輯,架構(gòu),多級(jí)緩存


圖 2.2CPU 多級(jí)緩存架構(gòu)[36]數(shù)據(jù)并行處理的架構(gòu)aphic Processing Unit中文意思為“圖形處理器”,簡(jiǎn)稱為GPU。CPALU(算術(shù)運(yùn)算單元),它可以在很少的時(shí)鐘周期內(nèi)完成算術(shù)計(jì)算據(jù)能力與CPU相比優(yōu)勢(shì)顯而易見,通過GPU并行處理可以大規(guī)模因此在圖像處理領(lǐng)域中的運(yùn)算也越來越廣泛[37]。CPU與GPU中邏比如圖2.3所示。

軟件體系,架構(gòu)


理器只負(fù)責(zé)執(zhí)行線程,結(jié)構(gòu)相對(duì)簡(jiǎn)單。程的軟件體系ompute Unified Device Architecture)的編程接口由英偉進(jìn)行 GPU 編程的接口[40]。CUDA C 語言是 NVIDI類 C 的編程語言,它主要包括擴(kuò) C 語言的最小擴(kuò)展。NVIDIA 還提供一個(gè)專門編譯 CUDA C 語言編寫的譯器。CUDA C 語言只編譯 GPU 端的代碼,因此要 與 GPU 數(shù)據(jù)的傳輸、內(nèi)核函數(shù)的啟動(dòng)、計(jì)算資源的PI 不能同時(shí)混合使用,只能使用其中的一種[41,42]。軟件體系由高到低共有三層組成,分別是 CUDA 庫 CUDA 驅(qū)動(dòng) API,如圖 2.4 所示。開發(fā)人員編寫 CU三層中的庫函數(shù)或者接口函數(shù),越接近底層的函數(shù)對(duì)接近 GPU 底層硬件程序,操作難度越大。
【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):2837059

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