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基于微流控芯片的72重單核苷酸多態(tài)性族群推斷系統(tǒng)的構(gòu)建

發(fā)布時間:2020-05-25 18:50
【摘要】:建立了常染色體單核苷酸多態(tài)性(SNPs)復(fù)合檢測芯片體系,用于未知個體的族群來源推斷;谇捌诤Y選的74-SNPs組合,采用競爭性等位基因特異性聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)的原理構(gòu)建SNPs的擴增體系,在微流控芯片的每個反應(yīng)孔內(nèi)完成一個SNP的檢測,通過高通量PCR微流控芯片實現(xiàn)了其中72個SNPs的同步檢測。芯片的擴增由平板PCR儀完成,反應(yīng)孔的熒光信號通過激光共聚焦掃描儀檢測,最終通過提取的熒光值進(jìn)行結(jié)果分析。使用該芯片檢測獲得52份樣本的SNPs分型,分型結(jié)果的準(zhǔn)確率為100%。以57個人群的3 628個樣本為參考人群數(shù)據(jù)庫,進(jìn)行20份樣本的族群來源推斷,推斷結(jié)果與樣本的實際來源一致。本研究建立的常染色體72個SNPs微流控芯片體系可以有效地進(jìn)行SNP多態(tài)性分析檢測,基于參考數(shù)據(jù)庫,20份檢測樣本族群推斷的準(zhǔn)確性為100%。

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本文編號:2680588

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