人體腦組織RNA表達水平與早期PMI的相關(guān)性
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【摘要】:目的探討人體腦組織多種RNA指標(biāo)的表達水平與早期死亡時間(PMI)的相關(guān)性。方法選取12例已知PMI(4.3~22.5 h)的個體,提取腦組織總RNA。選取8種常用RNA指標(biāo)(β-actin、GAPDH、RPS29、18S rRNA、5S rRNA、U6 snRNA、miRNA-9、miRNA-125b),通過實時熒光定量PCR技術(shù)檢測其在腦組織中的表達水平。運用geNorm軟件篩選早期PMI表達穩(wěn)定的內(nèi)參指標(biāo),并分析其表達水平與相關(guān)因素(年齡、性別、死亡原因)的關(guān)系。運用R軟件將內(nèi)參標(biāo)準(zhǔn)化的RNA指標(biāo)代入前期研究建立的數(shù)學(xué)模型推斷PMI,計算推斷PMI的誤差率以驗證模型精確性。結(jié)果 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b表達穩(wěn)定,其表達水平與年齡、性別、死亡原因無關(guān)。利用β-actin推斷PMI的誤差率為24.6%,GAPDH為41.0%。結(jié)論 5S rRNA、miRNA-9和miRNA-125b在死亡早期表達穩(wěn)定,適合作為人體腦組織的內(nèi)參指標(biāo)。β-actin表達水平與PMI相關(guān)性良好,有望成為推測早期PMI的輔助指標(biāo)。
【作者單位】: 上海健康醫(yī)學(xué)院;上海市公安局物證鑒定中心法醫(yī)物證學(xué)現(xiàn)場應(yīng)用技術(shù)公安部重點實驗室上海市現(xiàn)場物證重點實驗室;復(fù)旦大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院法醫(yī)學(xué)系;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上資助項目(81373242、81671863) 上海健康醫(yī)學(xué)院種子基金項目 上海高校青年教師培養(yǎng)資助計劃
【分類號】:D919
【正文快照】: 隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,運用RNA時序性降解規(guī)律推斷PMI逐漸成為研究熱點。國內(nèi)外學(xué)者在研究中發(fā)現(xiàn)RNA并非想象中那樣脆弱,可以通過測定某些管家基因m RNA含量變化推斷PMI,如β-肌動蛋白(β-actin)、甘油醛-3-磷酸脫氫酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)等
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,本文編號:1176834
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