復(fù)雜疾病是在眾多因素共同作用下發(fā)生的,遺傳模式相對復(fù)雜。其中部分復(fù)雜疾病會出現(xiàn)突然惡化現(xiàn)象,我們稱為臨界狀態(tài)。在臨界狀態(tài)出現(xiàn)之前,病情變化緩慢;在該狀態(tài)之后,病情短時間內(nèi)迅速惡化,使得治療難度增大,生存時間變短,危害性極大。因此,及時地診斷出臨界狀態(tài),識別疾病突然惡化前的預(yù)警信號尤為重要。本文以甲型流感為研究重點,將動態(tài)網(wǎng)絡(luò)生物標(biāo)志物（DNB）應(yīng)用于蛋白質(zhì)序列,構(gòu)建預(yù)警指標(biāo),對十個國家甲流疫情暴發(fā)前的臨界狀態(tài)進行識別。通過預(yù)警指標(biāo)捕捉到與疫情暴發(fā)相關(guān)的流感亞型,并從甲型H1N1、H3N2疾病的基因表達數(shù)據(jù)入手,改進DNB方法篩選主導(dǎo)基因網(wǎng)絡(luò),識別不同甲流亞型疾病的臨界狀態(tài)。本文工作如下:（1）選取不同國家已報道的甲流病毒的十種蛋白質(zhì)序列數(shù)據(jù),按順序提取出第y年所有序列中首次出現(xiàn)次數(shù)最多的氨基酸,組成新的序列。將第y+1年原始序列與第y年的新序列進行比對,得到第y+1年蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)的0-1序列。進一步提取0-1序列的23維數(shù)字特征,構(gòu)建十種蛋白質(zhì)相互作用的動態(tài)網(wǎng)絡(luò),找出DNB構(gòu)造早期預(yù)警指標(biāo)來量化甲流疫情的暴發(fā)信號,從而有效識別疫情的暴發(fā)臨界點。并根據(jù)指標(biāo)捕捉到甲流亞型出現(xiàn)時的顯著信號變化... 

【文章來源】：江南大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：47 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

疾病演變的三個生物過程

圖 3-1 關(guān)于中國的早期預(yù)警指標(biāo)趨勢圖國的甲流疫情早期預(yù)警分析選取了美國從 1931 年到 2016 年報道的甲流病毒的十種蛋白質(zhì)的氨基酸序32、1933、1934、1936、1937、1938、1939、1940、1941、1944、1946、1953、1954、1955、1956、1962、1964、1972、1973 和 1974 年的數(shù)據(jù)缺失

關(guān)于美國的早期預(yù)警指標(biāo)趨勢圖

【參考文獻】：
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本文編號：3358674