自2000年基因本體問(wèn)世以來(lái),本體作為數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的一種手段,在生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)整合中扮演了日益重要的作用。國(guó)際上許多大型的生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),如UniProt、ENCODE DCC,都使用本體為其提供標(biāo)準(zhǔn)化的術(shù)語(yǔ)與語(yǔ)義支持。在本體迅猛發(fā)展的過(guò)程中,本體平臺(tái)的建立對(duì)本體的推廣起到了促進(jìn)作用。一方面,各平臺(tái)基于相應(yīng)的準(zhǔn)則收錄本體資源,為用戶提供了擁有不同規(guī)范標(biāo)準(zhǔn)的本體。另一方面,平臺(tái)還為用戶提供了不同的本體應(yīng)用工具,方便其使用本體進(jìn)行數(shù)據(jù)注釋、數(shù)據(jù)整合,乃至本體開(kāi)發(fā)等工作。本研究主要分兩部分工作:第一,建立國(guó)內(nèi)的生物醫(yī)學(xué)本體資源存儲(chǔ)與應(yīng)用平臺(tái),收錄以O(shè)BO Foundry本體為主的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)相關(guān)本體,為國(guó)內(nèi)用戶提供相關(guān)的本體應(yīng)用服務(wù);第二,在所建平臺(tái)的基礎(chǔ)上,針對(duì)國(guó)家人口與健康科學(xué)數(shù)據(jù)共享平臺(tái)中國(guó)國(guó)民體質(zhì)與健康數(shù)據(jù)庫(kù)中的橫斷面調(diào)查數(shù)據(jù),建立人群橫斷面調(diào)查應(yīng)用型本體,為數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)提供基于本體的語(yǔ)義支持。我們通過(guò)復(fù)用NCBOBioPortal技術(shù),搭建了本體資源平臺(tái)軟件框架,遴選精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)相關(guān)本體,構(gòu)建了 MedPotal本體資源存儲(chǔ)與應(yīng)用平臺(tái)。對(duì)原框架中的代碼和本體處理工具,我們進(jìn)行了修正和完善,使之... 

【文章來(lái)源】：北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：62 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
縮略語(yǔ)對(duì)照表
中文摘要
Abstract
引言
    參考文獻(xiàn)
第一部分 :生物醫(yī)學(xué)本體資源存儲(chǔ)和應(yīng)用平臺(tái)MedPortal的建設(shè)
    研究背景
    1. 材料和方法
        1.1 MedPortal系統(tǒng)平臺(tái)搭建
        1.2 本體的遴選、收集和數(shù)據(jù)庫(kù)的建設(shè)
        1.3 MedPortal網(wǎng)絡(luò)服務(wù)的Python實(shí)現(xiàn)
        1.4     MedPortal API支持生物倍患數(shù)據(jù)庫(kù)中應(yīng)用型本體建設(shè)的實(shí)例
    2. 結(jié)果
        2.1 MedPortal本體資源和網(wǎng)站基本功能
        2.2 MedPortal的高級(jí)功能
        2.3 尿蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)庫(kù)的應(yīng)用型本體
    3. 討論和結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
第二部分: 人群橫斷面調(diào)查本體的構(gòu)建
    研究背景
    1. 材料與方法
        1.1 語(yǔ)義建模
        1.2 人群橫斷面調(diào)查本體的構(gòu)建與校驗(yàn)
        1.3 人群橫斷面調(diào)查本體的應(yīng)用示例
    2. 結(jié)果
        2.1 人群橫斷面調(diào)查本體的語(yǔ)義模型
        2.2 人群橫斷面調(diào)查本體構(gòu)建與校驗(yàn)結(jié)果
        2.3 人群橫斷面調(diào)查本體的應(yīng)用
    3. 結(jié)論和討論
    參考文獻(xiàn)
第三部分: 綜述
    參考文獻(xiàn)
附錄1 數(shù)據(jù)庫(kù)詞匯的映射與富集情況
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]新醫(yī)學(xué)是解決人類(lèi)健康問(wèn)題的真正鑰匙——需“精準(zhǔn)”理解奧巴馬的“精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)計(jì)劃”[J]. 賀林.  遺傳. 2015(06)
[2]生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域本體的構(gòu)建、評(píng)估與應(yīng)用[J]. 楊春媛,李滿生,朱云平.  中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2013(03)
[3]觀測(cè)指標(biāo)標(biāo)識(shí)符邏輯命名與編碼系統(tǒng)（LOINC）數(shù)據(jù)庫(kù)介紹[J]. 張林,趙英杰,陳興.  河北省科學(xué)院學(xué)報(bào). 2004(04)



本文編號(hào)：3049899