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基于Hadoop平臺(tái)的醫(yī)院數(shù)據(jù)集成中心設(shè)計(jì)與實(shí)施

發(fā)布時(shí)間:2021-01-08 22:03
  目的:建立全院統(tǒng)一的高質(zhì)量數(shù)據(jù)存儲(chǔ)中心,為醫(yī)療服務(wù)、數(shù)據(jù)分析及醫(yī)院運(yùn)營管理等提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。方法:搭建Hadoop平臺(tái),利用Hadoop的Sqoop組件實(shí)時(shí)采集醫(yī)療數(shù)據(jù),并將醫(yī)療數(shù)據(jù)集中存儲(chǔ)在HBase數(shù)據(jù)庫中,之后通過并行計(jì)算框架加速數(shù)據(jù)讀取、修改。結(jié)果:基于Hadoop的醫(yī)院生態(tài)系統(tǒng),提供了強(qiáng)大的數(shù)據(jù)統(tǒng)一存儲(chǔ)和計(jì)算力,采用高效的并行計(jì)算框架,滿足全量數(shù)據(jù)在線高效使用,將醫(yī)療數(shù)據(jù)進(jìn)行了整合及標(biāo)準(zhǔn)化。結(jié)論:數(shù)據(jù)存儲(chǔ)中心能夠?qū)崿F(xiàn)醫(yī)院精益化運(yùn)營分析,支持實(shí)時(shí)統(tǒng)計(jì)分析的管理輔助決策、基于大數(shù)據(jù)的疾病分析決策以及臨床輔助診斷決策等;可滿足醫(yī)院的數(shù)據(jù)利用、醫(yī)療質(zhì)量管理、醫(yī)院運(yùn)營及績效管理等需求。 

【文章來源】:中國醫(yī)學(xué)裝備. 2020,17(09)

【文章頁數(shù)】:4 頁

【部分圖文】:

基于Hadoop平臺(tái)的醫(yī)院數(shù)據(jù)集成中心設(shè)計(jì)與實(shí)施


科研數(shù)據(jù)中心流程圖

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時(shí)滿足醫(yī)院運(yùn)營及績效管理等需求,推動(dòng)醫(yī)院實(shí)現(xiàn)患者精細(xì)化管理、加速醫(yī)院學(xué)術(shù)研究產(chǎn)出、提升醫(yī)院影響力等。3.1臨床數(shù)據(jù)中心臨床數(shù)據(jù)中心是在醫(yī)院信息平臺(tái)信息資源層的核心構(gòu)件,是醫(yī)院為支持臨床診療,以患者為中心重新構(gòu)建的新的一層數(shù)據(jù)存儲(chǔ)結(jié)構(gòu)。基于標(biāo)準(zhǔn)結(jié)構(gòu),將不同的協(xié)議傳輸數(shù)據(jù)、不同的格式存儲(chǔ)信息進(jìn)行結(jié)構(gòu)性的優(yōu)化處理以達(dá)到快速提取的目的,更可以高效的把任意來源的任何數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換成為廣泛應(yīng)用的標(biāo)準(zhǔn)醫(yī)療行業(yè)格式來進(jìn)行臨床診療活動(dòng)的操作、存儲(chǔ)、排檔、瀏覽以及統(tǒng)計(jì)匯報(bào)。臨床數(shù)據(jù)中心流程見圖3。圖3臨床數(shù)據(jù)中心流程圖3.2運(yùn)營數(shù)據(jù)中心運(yùn)營數(shù)據(jù)中心是醫(yī)院信息平臺(tái)建設(shè)中的重要部分,其數(shù)據(jù)主要來源于醫(yī)院各業(yè)務(wù)領(lǐng)域中實(shí)際產(chǎn)生的業(yè)務(wù)及管理數(shù)據(jù),同時(shí)對(duì)管理業(yè)務(wù)提供數(shù)據(jù)服務(wù)與支持。醫(yī)院運(yùn)營數(shù)據(jù)中心是整合醫(yī)院運(yùn)營管理活動(dòng)的數(shù)據(jù)集,包括與醫(yī)院運(yùn)營活動(dòng)相關(guān)的人、財(cái)、物所有數(shù)據(jù),將原來分散在人事系統(tǒng)、財(cái)務(wù)系統(tǒng)以及物資設(shè)備系統(tǒng)中心的數(shù)據(jù)進(jìn)行重新組織整合,并圍繞著管理活動(dòng)所關(guān)心的人次、均次費(fèi)用及平均住院日等指標(biāo),形成運(yùn)營數(shù)據(jù)倉庫及多維數(shù)據(jù)集,為醫(yī)院的運(yùn)營決策提供數(shù)據(jù)支持,提高醫(yī)院管理效率、降低患者診療費(fèi)用。運(yùn)營數(shù)據(jù)中心流程見圖4。圖4運(yùn)營數(shù)據(jù)中心流程圖3.3科研數(shù)據(jù)中心科研數(shù)據(jù)中心是嚴(yán)格遵循臨床科研業(yè)務(wù)要求,對(duì)結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)進(jìn)行規(guī)范化、標(biāo)準(zhǔn)化和有效性校驗(yàn),同時(shí)對(duì)大量非結(jié)構(gòu)化文本數(shù)據(jù),如既往史、現(xiàn)病史、病程錄、出院小結(jié)、超聲報(bào)告、病理報(bào)告及放射報(bào)告等進(jìn)行醫(yī)學(xué)自然語言處理,實(shí)現(xiàn)臨床概念的歸一化和后結(jié)構(gòu)化。以專病數(shù)據(jù)模型為基礎(chǔ)匯聚形成具有極大臨床及科研價(jià)值的單病種數(shù)據(jù)庫。科研數(shù)據(jù)中心流程見圖5。圖5科研數(shù)據(jù)中心流程圖中國醫(yī)學(xué)裝備2020年9月第

傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)并行,數(shù)據(jù)庫


學(xué)術(shù)論著ZHONGGUOYIXUEZHUANGBEI1314創(chuàng)新型成果4.1Hadoop列式存儲(chǔ)傳統(tǒng)的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫主要以表(table)的形式來存儲(chǔ)數(shù)據(jù),無法應(yīng)對(duì)非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的挑戰(zhàn),而且在進(jìn)行數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的過程中,關(guān)系型數(shù)據(jù)庫性能遭遇了瓶頸。醫(yī)院數(shù)據(jù)中心采用基于Hadoop的列式數(shù)據(jù)庫Hbase進(jìn)行數(shù)據(jù)集中存儲(chǔ):HBase是基于GoogleBigTable模型開發(fā),通過行和列,構(gòu)成典型的key/value系統(tǒng),HBase是建立在hadoop的hdfs之上,提供高可靠性、高性能、列存儲(chǔ)、可伸縮和實(shí)時(shí)讀寫的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫存儲(chǔ)與列式存儲(chǔ)對(duì)比見圖6。圖6傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫與列式數(shù)據(jù)庫對(duì)比4.2醫(yī)療數(shù)據(jù)并行計(jì)算臨床業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)具有超大規(guī)模和多來源等特點(diǎn),可能來源于多種格式:即多媒體數(shù)據(jù)、圖像數(shù)據(jù)、文本數(shù)據(jù)、實(shí)時(shí)數(shù)據(jù)以及傳感器數(shù)據(jù)等。當(dāng)有新的數(shù)據(jù)來源時(shí),可能會(huì)有新的數(shù)據(jù)格式的出現(xiàn),本研究項(xiàng)目基于Hadoop平臺(tái)引入Map-Reduce并行計(jì)算框架,Map-Reduce可以存放和分析各種原始數(shù)據(jù)格式[20]。HDR構(gòu)建于分布式網(wǎng)格計(jì)算架構(gòu),多個(gè)節(jié)點(diǎn)通過Map-Reduce歸并算法,在處理海量數(shù)據(jù)的分析計(jì)算中具有明顯優(yōu)勢(shì)。4.3醫(yī)療數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)采集數(shù)據(jù)中心采用基于Hadoop的Sqoop組件,封裝數(shù)據(jù)采集界面,并內(nèi)置多種醫(yī)療行業(yè)特有的處理邏輯,方便醫(yī)院信息科和實(shí)施人員通過圖形化界面進(jìn)行數(shù)據(jù)采集和轉(zhuǎn)換。將醫(yī)院各業(yè)務(wù)系統(tǒng)的歷史數(shù)據(jù)抽取并清洗轉(zhuǎn)換后,按照統(tǒng)一的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)存儲(chǔ)在hive倉庫及hbase數(shù)據(jù)庫中,支持半結(jié)構(gòu)化和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的采集處理。5結(jié)論本研究系統(tǒng)通過搭建Hadoop平臺(tái)建立全院集成數(shù)據(jù)中心,利用Sqoop組件采集醫(yī)療數(shù)據(jù),加速了數(shù)據(jù)采集速度,將結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)和非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)統(tǒng)一采集并存儲(chǔ)在HBase中,按照分表的方式進(jìn)行存儲(chǔ),有效降低了醫(yī)院互聯(lián)網(wǎng)技術(shù)運(yùn)營成本,并且極大地提高了

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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