異煙肼誘導(dǎo)家蠶脂肪體損傷及其轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析
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【摘要】:結(jié)核病是危害人類健康的三大疾病之一,由于其高發(fā)性和高死亡性,成為一個(gè)全球性的公共衛(wèi)生問(wèn)題。異煙肼(INH)是治療結(jié)核病的首選藥物,然而長(zhǎng)期和大量服用INH的患者會(huì)出現(xiàn)不同程度的肝損傷。為了深入探討INH類藥物的肝毒性機(jī)制,本文采用經(jīng)口暴露的方式,建立了INH對(duì)無(wú)脊椎動(dòng)物家蠶脂肪體組織損傷模型,利用RNA-Seq技術(shù)比較分析了該模型基因的轉(zhuǎn)錄水平變化,探討了對(duì)脂肪體代謝和功能的潛在影響。1 INH引起家蠶脂肪體出現(xiàn)類似哺乳動(dòng)物肝毒性的損傷5齡第3 d的家蠶大造,經(jīng)口暴露INH(1000 mg/kg)后15min,高效液相色譜HPLC即可檢測(cè)到INH原藥在血淋巴、中腸和脂肪體的存在,組織間原藥的累積符合家蠶開放式循環(huán)系統(tǒng)特點(diǎn)。超氧化物歧化物(ROS)檢測(cè)發(fā)現(xiàn),INH處理組脂肪體和血淋巴中ROS水平明顯高于水處理對(duì)照組;HE和DAPI組織切片染色鑒定結(jié)果顯示,INH處理組脂肪體細(xì)胞中出現(xiàn)大量空泡,周圍存在很多破碎的細(xì)胞和受損的細(xì)胞核。隨著INH劑量的增加和處理后時(shí)間延長(zhǎng),家蠶血淋巴中與哺乳動(dòng)物肝損傷相關(guān)的指標(biāo)性酶活性丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(ALT)和天冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(AST)的活性顯著升高。表明家蠶在INH的作用下出現(xiàn)的脂肪體損傷與INH誘導(dǎo)哺乳動(dòng)物的急性肝損傷具有相似性。2 INH誘導(dǎo)家蠶脂肪體細(xì)胞的基因轉(zhuǎn)錄水平改變經(jīng)口暴露1000 mg/kg(溶液體積100μL)INH后8 h,成功構(gòu)建兩個(gè)INH/CK家蠶脂肪體組織的RNA-Seq文庫(kù),共獲得了10113功能基因,其中差異性表達(dá)基因2211,包括1908僅在處理組或?qū)φ战M特異性表達(dá)的基因,還有303個(gè)基因表達(dá)水平在處理組與對(duì)照之間顯著性差異。其中INH處理后出現(xiàn)表達(dá)的特異性表達(dá)基因652個(gè),沉默的基因高達(dá)1264個(gè),上調(diào)表達(dá)的基因85個(gè),還有218個(gè)基因下調(diào)了表達(dá)水平。3 INH轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)中差異表達(dá)基因的GO功能和KEGG通路分析INH/CK兩個(gè)文庫(kù)相比,特異表達(dá)基因和差異表達(dá)基因的GO功能:生物過(guò)程(Biological Process)在三個(gè)GO功能分布中差異基因最多,主要存在與生物調(diào)節(jié)、細(xì)胞過(guò)程、定位、代謝過(guò)程、色素沉著等GO分支中;分子功能(Moleclur Function)中連接(binding)和催化(catalytic)兩個(gè)GO分支中差異基因占到該部分的差基因總數(shù)的90%;細(xì)胞成分(Cellular Component)中與細(xì)胞或生物膜有關(guān)的GO過(guò)程中也含有較多的差異基因。根據(jù)藥物代謝特點(diǎn),將差異表達(dá)基因所有的KEGG通路總結(jié)為10大通路,其中在核損傷通路(46個(gè))、細(xì)胞外信號(hào)通路(31個(gè))、蛋白代謝通路(27個(gè))、細(xì)胞過(guò)程(52個(gè))凋亡通路(29個(gè))等都含有較多的差異表達(dá)基因。在INH的藥物代謝KEGG通路中CYP4E3和GST的基因表達(dá)量發(fā)生變化,雌蠶和雄蠶脂肪體中GST活性顯著下調(diào)。與細(xì)胞凋亡有關(guān)通路:內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白合成的信號(hào)通路中與蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)和結(jié)構(gòu)、糖基化修飾有關(guān)的基因發(fā)生了顯著性差異表達(dá),線粒體能量代謝通路中細(xì)胞色素C和AMPK基因也發(fā)生顯著性差異表達(dá)。INH影響線粒體呼吸鏈中復(fù)合物酶活性變化具有顯著地時(shí)間和劑量效應(yīng)。家蠶脂肪體中自噬基因Atg6和Atg8的表達(dá)量沒(méi)有上調(diào)表達(dá)。
【關(guān)鍵詞】:異煙肼 脂肪體損傷 差異表達(dá)基因 GO功能 KEGG通路
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R965
【目錄】:
- 中文摘要4-6
- Abstract6-12
- 第一章 文獻(xiàn)綜述12-27
- 1 結(jié)核病研究現(xiàn)狀12-13
- 2 主治藥物異煙肼的研究進(jìn)展13-14
- 3 藥物性肝損傷14-16
- 3.1 藥物性肝損傷機(jī)制14-15
- 3.2 肝損傷的酶指標(biāo)15-16
- 4 INH造成肝損傷的機(jī)制研究現(xiàn)狀16-22
- 4.1 INH抑制細(xì)胞內(nèi)的抗氧化反應(yīng)16
- 4.2 INH誘導(dǎo)肝細(xì)胞死亡的兩大方式16-17
- 4.3 胞外凋亡信號(hào)通路: NF-kB17-19
- 4.4 胞內(nèi)細(xì)胞凋亡通路:線粒體調(diào)節(jié)的凋亡通路19-22
- 5 藥物肝毒性替代動(dòng)物研究進(jìn)展22-24
- 5.1 肝損傷動(dòng)物模型及其替代研究發(fā)展趨勢(shì)22-23
- 5.2 以家蠶為模式動(dòng)物的研究23
- 5.3 家蠶脂肪體與哺乳動(dòng)物肝臟功能比較23-24
- 6 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)以及在毒理方面研究應(yīng)用24-27
- 6.1 轉(zhuǎn)錄組學(xué)測(cè)序技術(shù)的發(fā)展24-25
- 6.2 高通量測(cè)序技術(shù)有關(guān)毒理學(xué)研究的應(yīng)用25-27
- 第二章 研究?jī)?nèi)容與方法27-38
- 1 研究目的和意義27
- 2 研究?jī)?nèi)容27-28
- 3 技術(shù)路線28
- 4 試驗(yàn)動(dòng)物28-29
- 4.1 家蠶飼養(yǎng)方法28-29
- 4.2 供試實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的處理29
- 4.3 家蠶給藥方式29
- 5 主要試劑29-30
- 6 主要儀器30-31
- 7 試驗(yàn)方法31-38
- 7.1 高效液相色譜(HPLC)檢測(cè)INH條件31-32
- 7.2 家蠶脂肪體肝損傷指標(biāo)測(cè)定32
- 7.3 總RNA的抽提與反轉(zhuǎn)錄32-34
- 7.4 實(shí)時(shí)定量PCR(qRT-PCR)34-35
- 7.5 石蠟組織切片制備35-36
- 7.6 活性氧(ROS)檢測(cè)36
- 7.7 DAPI染色36-37
- 7.8 數(shù)字基因表達(dá)譜文庫(kù)構(gòu)建和測(cè)序數(shù)據(jù)分析37-38
- 第三章 結(jié)果與分析38-60
- 1 HPLC檢測(cè)INH經(jīng)口暴露后,在家蠶各組織中的分布38
- 2 INH經(jīng)口暴露誘導(dǎo)家蠶各組織活性氧水平提高38-39
- 3 INH對(duì)家蠶脂肪體組織造成的損傷39-40
- 4 肝損傷有關(guān)的酶活指標(biāo)的測(cè)定40-41
- 5 INH誘導(dǎo)家蠶脂肪體的轉(zhuǎn)錄組學(xué)文庫(kù)信息分析41-43
- 5.1 INH/CK兩個(gè)文庫(kù)質(zhì)量分析41-42
- 5.2 Clean reads注釋到NCBI的基因物種分布情況42-43
- 6 INH誘導(dǎo)家蠶脂肪體表達(dá)基因差異性分析43-48
- 6.1 INH/CK兩個(gè)DGE文庫(kù)中所有基因表達(dá)分析和Venn圖43-44
- 6.2 INH/CK兩個(gè)DGE文庫(kù)中特異性基因的GO功能分析44-46
- 6.3 INH/CK兩個(gè)DGE文庫(kù)中顯著性差異表達(dá)基因的GO功能分析46-47
- 6.4 INH/CK的差異表達(dá)基因的GO功能的量化分析47-48
- 7 差異表達(dá)基因的KEGG通路分析48-57
- 7.1 歸類統(tǒng)計(jì)差異基因的KEGG通路48-51
- 7.2 基于DGE文庫(kù)篩選INH在家蠶脂肪體的藥物代謝通路51-52
- 7.3 基于DGE文庫(kù)篩選INH誘導(dǎo)家蠶脂肪體損傷的的信號(hào)通路52-57
- 8 差異基因的QRT-PCR驗(yàn)證57-58
- 9 討論58-60
- 第四章 結(jié)論與展望60-62
- 1 綜合結(jié)論60-61
- 1.1 INH作用下家蠶脂肪體發(fā)生類似哺乳動(dòng)物肝損傷的組織損傷60
- 1.2 INH干擾家蠶脂肪體基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá)水平60
- 1.3 INH作用下內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激通路和線粒體能量代謝通路調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡60-61
- 2 后續(xù)研究展望與建議61-62
- 參考文獻(xiàn)62-75
- 附錄75-76
- 發(fā)表論文與參與項(xiàng)目76-78
- 致謝78-80
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條
1 黃志君;曾文年;陳佩琳;鐘仰進(jìn);;家蠶變態(tài)期脂肪體形態(tài)結(jié)構(gòu)特征[A];中國(guó)蠶學(xué)會(huì)第六屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(2)[C];2009年
2 劉艷艷;池旭娟;闞雪芹;方向明;王海玲;劉文倩;蘇媚;談建中;;家蠶幼蟲期與蛹期脂肪體雌雄差異蛋白質(zhì)組的分析[A];中國(guó)蠶學(xué)會(huì)第六屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(2)[C];2009年
3 劉敏;潘敏慧;吳克軍;魯成;;家蠶脂肪體原代培養(yǎng)中各種形態(tài)細(xì)胞的觀察[A];中國(guó)蠶學(xué)會(huì)第六屆青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(3)[C];2009年
4 _5清R[;劉芳;櫘慧;;蓖麻蠶在變態(tài)期脂肪體和血淋巴主要成分的變化[A];中國(guó)昆蟲學(xué)會(huì)1962年學(xué)術(shù)討論會(huì)會(huì)刊[C];1962年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條
1 王海英;異煙肼誘導(dǎo)家蠶脂肪體損傷及其轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析[D];蘇州大學(xué);2016年
2 葛君;有機(jī)磷農(nóng)藥誘導(dǎo)后家蠶脂肪體特征蛋白及其基因的表達(dá)分析[D];蘇州大學(xué);2010年
3 程道軍;家蠶大規(guī)模EST測(cè)序及脂肪體基因表達(dá)譜分析[D];西南農(nóng)業(yè)大學(xué);2003年
4 郭旭;兩種新型家蠶凝集素基因的克隆及表達(dá)[D];華中師范大學(xué);2010年
5 李艷梅;重金屬鉛對(duì)家蠶的抗氧化和生殖發(fā)育相關(guān)基因表達(dá)以及酶活性的影響[D];蘇州大學(xué);2011年
6 魯秀麗;沉默兩個(gè)基因?qū)煞N藥劑處理的褐飛虱生殖及脂肪體生化影響[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年
,本文編號(hào):990976
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