抗菌肽LL-37序列分析與結構研究
發(fā)布時間:2017-08-21 08:41
本文關鍵詞:抗菌肽LL-37序列分析與結構研究
更多相關文章: 抗菌肽LL- 生物信息學 棕櫚酰轉移酶PagP
【摘要】:目的分析抗菌肽LL-37的序列和結構特征,模擬其與棕櫚酰轉移酶PagP三維結構的結合,為后續(xù)研究抗菌機制提供理論和實驗基礎。方法從PDB數據庫獲得抗菌肽LL-37、棕櫚酰轉移酶PagP的序列和結構信息,使用SWISS-MODEL、NCBI在線工具和ANTHEPROT6.6.6、AutoDock4.2等軟件對抗菌肽LL-37進行序列和結構分析。結果抗菌肽LL-37序列全長為37個氨基酸,含有75.7%α螺旋和24.3%無規(guī)則卷曲,抗菌肽LL-37片段與棕櫚酰轉移酶PagP形成8種對接模式,其配體效率在-2.2389~-1.6100Kcal/mol之間。結論對抗菌肽LL-37的序列和結構研究,為后續(xù)針對特異靶點設計多肽藥物,開展結構與活性的研究提供了新的方向。
【作者單位】: 鄂東醫(yī)療集團黃石市中心醫(yī)院湖北理工學院附屬醫(yī)院醫(yī)學檢驗科腎臟疾病發(fā)生與干預湖北省重點實驗室;
【關鍵詞】: 抗菌肽LL- 生物信息學 棕櫚酰轉移酶PagP
【基金】:湖北省自然科學基金項目(2015CFB627) 黃石市科技計劃項目(2013A077-4)
【分類號】:R915
【正文快照】: 抗菌肽LL-37廣泛分布于人體上皮細胞和血液細胞中,其具有廣譜抗菌活性,可以抗多種革蘭陽性菌、革蘭陰性菌和真菌,而且還可通過免疫調節(jié)、促進創(chuàng)傷修復、誘導血管生成等,是機體固有免疫防御系統(tǒng)的重要組成部分[1-2]。有報道指出革蘭陰性菌細胞外膜的棕櫚酰轉移酶PagP可以從磷脂
【相似文獻】
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1 具英花;于愛鳴;解智慧;孫秀華;;葡萄糖胺抑制LL-37誘導的人臍帶血管內皮細胞活化[J];解剖科學進展;2010年03期
2 張,
本文編號:711914
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