抗癌藥物敏感性數(shù)據(jù)的缺失會(huì)對(duì)后續(xù)癌癥數(shù)據(jù)分析產(chǎn)生重要影響.高通量測序技術(shù)為構(gòu)建計(jì)算模型,有效預(yù)測抗癌藥物敏感性提供了可能.依據(jù)已有的合理性假設(shè):相似的細(xì)胞系對(duì)于目標(biāo)藥物具有相似的反應(yīng);相似的藥物對(duì)于目標(biāo)細(xì)胞系具有相似的反應(yīng),本文綜合考慮了細(xì)胞系的基因表達(dá)和基因突變特征,給出細(xì)胞系相似性新的定義形式,結(jié)合藥物相似性度量方法,提出了"細(xì)胞系-藥物K近鄰"計(jì)算模型,并將其成功應(yīng)用于癌癥細(xì)胞系百科全書(CCLE),得到的抗癌藥物敏感性預(yù)測結(jié)果明顯優(yōu)于已有的經(jīng)典模型.

【文章頁數(shù)】：6 頁

【文章目錄】：
1 引言
2 數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)處理
3 細(xì)胞系(藥物)相似性度量方法
4 細(xì)胞系-藥物K近鄰(KNN)預(yù)測模型
5 預(yù)測結(jié)果分析與比較
    5.1 模型參數(shù)優(yōu)化
    5.2 模型預(yù)測結(jié)果分析
    5.3 模型預(yù)測結(jié)果比較
6 結(jié)論



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