利用與急性呼吸綜合征冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）具有高度同源性的人冠狀病毒類木瓜蛋白酶（human coronavirus papain-like protease）晶體,對木瓜樣蛋白酶（PLpro）進行同源模建,再通過該模建的蛋白對已上市或已進入臨床試驗的藥物運用分子對接的方法進行虛擬篩選和動力學模擬研究,以找到對SARS-CoV-2引起的新冠肺炎疾�。–OVID-19）可能具有治療作用的藥物。經過篩選,共確定了11種與SARS-CoV-2 PLpro結合較好的候選藥物。分子動力學模擬和結合自由能分析結果表明:疏水性相互作用在候選藥物與PLpro的結合過程中具有重要作用,并且發(fā)現(xiàn)替諾福韋艾拉酚胺（Tenofovir alafenamide）具有對COVID-19治療的潛力。虛擬篩選是一種快速且經濟的藥物篩選的方法,用此方法篩選得到的替諾福韋艾拉酚胺可能可以作為候選藥物對COVID-19進行治療。 

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【文章目錄】：
1 SARS-CoV的靶標及PLpro在病毒中的作用
2 方法
    2.1 PLpro蛋白同源模建
    2.2 虛擬篩選和分子對接
    2.3 分子動力學模擬
    2.4 結合自由計算(MM/GBSA)計算
3 結果與結論
    3.1 同源模建結果分析
    3.2 基于分子對接的虛擬篩選
        3.2.1 對接方法可靠性的驗證結果
        3.2.2 分子對接結果分析與討論
    3.3 分子動力學模擬和結合自由能分析
    3.4 替諾福韋艾拉酚胺與PLpro的結合模式分析
4 結論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao.  Science China（Life Sciences）. 2020(03)
[2]SARS冠狀病毒PLpro蛋白酶對泛素樣分子的DUB活性[J]. 陳曉娟,楊宇東,孫莉,胡日查,邢雅玲,陳忠斌.  中國生物化學與分子生物學報. 2011(07)
[3]SARS冠狀病毒PLpro蛋白酶的結構與功能[J]. 楊宇東,孫莉,陳忠斌.  中國生物化學與分子生物學報. 2010(01)

碩士論文
[1]SARS冠狀病毒RNA依賴的RNA聚合酶原核和真核表達及純化[D]. 張蕾.中國協(xié)和醫(yī)科大學 2009



本文編號：3699608