利用與急性呼吸綜合征冠狀病毒2型（SARS-CoV-2）具有高度同源性的人冠狀病毒類木瓜蛋白酶（human coronavirus papain-like protease）晶體,對(duì)木瓜樣蛋白酶（PLpro）進(jìn)行同源模建,再通過該模建的蛋白對(duì)已上市或已進(jìn)入臨床試驗(yàn)的藥物運(yùn)用分子對(duì)接的方法進(jìn)行虛擬篩選和動(dòng)力學(xué)模擬研究,以找到對(duì)SARS-CoV-2引起的新冠肺炎疾�。–OVID-19）可能具有治療作用的藥物。經(jīng)過篩選,共確定了11種與SARS-CoV-2 PLpro結(jié)合較好的候選藥物。分子動(dòng)力學(xué)模擬和結(jié)合自由能分析結(jié)果表明:疏水性相互作用在候選藥物與PLpro的結(jié)合過程中具有重要作用,并且發(fā)現(xiàn)替諾福韋艾拉酚胺（Tenofovir alafenamide）具有對(duì)COVID-19治療的潛力。虛擬篩選是一種快速且經(jīng)濟(jì)的藥物篩選的方法,用此方法篩選得到的替諾福韋艾拉酚胺可能可以作為候選藥物對(duì)COVID-19進(jìn)行治療。 

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【文章目錄】：
1 SARS-CoV的靶標(biāo)及PLpro在病毒中的作用
2 方法
    2.1 PLpro蛋白同源模建
    2.2 虛擬篩選和分子對(duì)接
    2.3 分子動(dòng)力學(xué)模擬
    2.4 結(jié)合自由計(jì)算(MM/GBSA)計(jì)算
3 結(jié)果與結(jié)論
    3.1 同源模建結(jié)果分析
    3.2 基于分子對(duì)接的虛擬篩選
        3.2.1 對(duì)接方法可靠性的驗(yàn)證結(jié)果
        3.2.2 分子對(duì)接結(jié)果分析與討論
    3.3 分子動(dòng)力學(xué)模擬和結(jié)合自由能分析
    3.4 替諾福韋艾拉酚胺與PLpro的結(jié)合模式分析
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission[J]. Xintian Xu,Ping Chen,Jingfang Wang,Jiannan Feng,Hui Zhou,Xuan Li,Wu Zhong,Pei Hao.  Science China（Life Sciences）. 2020(03)
[2]SARS冠狀病毒PLpro蛋白酶對(duì)泛素樣分子的DUB活性[J]. 陳曉娟,楊宇東,孫莉,胡日查,邢雅玲,陳忠斌.  中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(07)
[3]SARS冠狀病毒PLpro蛋白酶的結(jié)構(gòu)與功能[J]. 楊宇東,孫莉,陳忠斌.  中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2010(01)

碩士論文
[1]SARS冠狀病毒RNA依賴的RNA聚合酶原核和真核表達(dá)及純化[D]. 張蕾.中國(guó)協(xié)和醫(yī)科大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3699608