細(xì)胞色素酶P₄₅₀4（CYP4）家族是人類第二大CYP家族,除CYP4F8、CYP4F12、CYP4X1和CYP4Z1外,大多數(shù)CYP4酶都是ω-羥化酶。CYP4Z1是CYP4家族的一個新成員,是目前研究甚少的"孤兒"酶之一,它的過表達(dá)會促進(jìn)乳腺癌中的腫瘤血管生成和生長,并與某些高惡性腫瘤及愈后不良相關(guān),是癌癥治療的潛在藥物靶標(biāo)。月桂酸在各種癌癥的治療和術(shù)后康復(fù)的調(diào)節(jié)中發(fā)揮重要作用。據(jù)報(bào)道,月桂酸的鏈內(nèi)羥基化由細(xì)胞色素CYP4Z1催化,但其催化機(jī)制尚不清楚。在這項(xiàng)研究中,使用了量化計(jì)算、同源建模、分子對接、分子動力學(xué)模擬、自由能分析和主成分分析等方法,深入研究月桂酸羥基化的代謝特征�；谘t素和月桂酸模型的量化計(jì)算表明,潛在的羥基化位點(diǎn)的奪氫能壘范圍為56.2至85.1 kJ/mol,其中ω-4位點(diǎn)的能壘最低。分子對接的結(jié)果表明,活性位點(diǎn)附近的Ser383、Ser113在穩(wěn)定月桂酸的過程中發(fā)揮重要作用。分子動力學(xué)模擬結(jié)果表明,血紅素平面與π-π相互作用形成的共同相互作用,促使ω-4位點(diǎn)更靠近活性氧,這與研究觀察結(jié)果是一致的。當(dāng)參與形成π-π相互作用的Phe313突... 

【文章來源】：中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2020,36(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：10 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 量化計(jì)算
    1.2 同源建模和分子對接
    1.3 分子動力學(xué)模擬
    1.4 主成分分析
2 結(jié)果
    2.1 基于QM計(jì)算預(yù)測羥基化的區(qū)域選擇性
    2.2 人類CYP4Z1三維構(gòu)象的構(gòu)建與優(yōu)化
    2.3 月桂酸與 CYP4Z1 復(fù)合物的分子對接與分子動力學(xué)模擬
    2.4 結(jié)合自由能的分析
    2.5 模擬主成分的分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]4-甲酰苯基硼酸對蛋白酶MP的抑制作用及其抑制機(jī)制的分子動力學(xué)模擬[J]. 紀(jì)曉峰,鄭媛,王致鵬,盛軍,王海英.  中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(06)
[2]基于頻繁項(xiàng)集挖掘和連續(xù)幀間差分的脂肪酶時-空結(jié)構(gòu)模式與耐熱性的關(guān)系[J]. 李麗,丁彥蕊.  中國生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2018(03)



本文編號：3399151