基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)篩選神經(jīng)干細(xì)胞促分化作用和Dami細(xì)胞增殖抑制作用化合物的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-07-04 05:30
藥物篩選一般采用基于藥物作用機(jī)制和基于作用藥靶結(jié)構(gòu)的篩選方式,利用細(xì)胞與動(dòng)物模型,來(lái)確定作用效果和作用機(jī)制。隨著高通量測(cè)序技術(shù)及基因芯片技術(shù)的大規(guī)模應(yīng)用,以及合成化學(xué)高通量方法的普及,藥物篩選進(jìn)入了高通量時(shí)代,越來(lái)越多的新靶標(biāo)和潛在靶點(diǎn)被發(fā)現(xiàn),這些都得益于基因組數(shù)據(jù)庫(kù)的完善和生物信息學(xué)自動(dòng)化操作系統(tǒng)對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的分析。本研究利用不同細(xì)胞模型高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所得到的基因表達(dá)差異數(shù)據(jù),采用生物信息分析方法結(jié)合基因-藥物相互作用數(shù)據(jù)庫(kù)和基因表達(dá)表型注釋數(shù)據(jù)庫(kù),參照藥物化合物數(shù)據(jù)庫(kù),篩選細(xì)胞模型相對(duì)應(yīng)的基因特異性靶向化合物,利用細(xì)胞學(xué)方法對(duì)化合物干預(yù)細(xì)胞模型的效果進(jìn)行驗(yàn)證,從而建立基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)的目標(biāo)化合物篩選和活性驗(yàn)證研究體系。本研究按不同細(xì)胞模型分為以下兩部分。1.基于基因表達(dá)數(shù)據(jù)篩選具有促神經(jīng)干細(xì)胞分化作用化合物的研究干細(xì)胞是一類具有自我復(fù)制和多向分化特點(diǎn)的細(xì)胞。以骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(mesenchymal stem cells,MSCs)分化為神經(jīng)干細(xì)胞(neural stem cells,NSCs)的研究已經(jīng)成為干細(xì)胞研究的前沿領(lǐng)域。NSCs移植也是未來(lái)治療神經(jīng)系統(tǒng)疾病的重要方法。NSC...
【文章來(lái)源】:東北師范大學(xué)吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:266 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
DGIdb數(shù)據(jù)庫(kù)檢索差異表達(dá)基因Figure1.SearchingdifferentiallyexpressedgenesinDGIdbdatabase
24圖 2. TSPO 基因匹配化合物及評(píng)分Figure 2. TSPO gene matching compounds and their scoring values5. NSCs 培養(yǎng)和誘導(dǎo)分化(1)誘導(dǎo) NSCs 定向分化實(shí)驗(yàn)分組:1)依替福辛誘導(dǎo)組;2)依替福辛+ bFGF 誘導(dǎo)組;3)bFGF+Hepari誘導(dǎo)組;4)正常培養(yǎng)對(duì)照組。用分化培養(yǎng)基(DMEM:F12+1%FBS+B27)包被24 孔板,過(guò)夜。將 NSCs 接種于 25ml 培養(yǎng)瓶中。分別加入不同組分化培養(yǎng)基誘導(dǎo)分化 3 天及 7 天。換液后放置于 37℃5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每 3 天半量換液,40X 顯微鏡下觀察,誘導(dǎo)培養(yǎng) 14 天進(jìn)行免疫熒光細(xì)胞染色鑒定。(2)免疫熒光觀察誘導(dǎo)后神經(jīng)細(xì)胞1)取出誘導(dǎo)細(xì)胞培養(yǎng)板 PBS 洗 5 分鐘 2 次。
三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果(一) MSCs 分離培養(yǎng)及 NSCs 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)1. MSCs 培養(yǎng)MSCs 在低糖培養(yǎng)基中培養(yǎng) 24 小時(shí)后可見(jiàn)細(xì)胞貼壁生長(zhǎng),呈橢圓形,透亮。培養(yǎng) 3 天后可見(jiàn)多邊形細(xì)胞。培養(yǎng) 7 天后,細(xì)胞迅速增殖,細(xì)胞表現(xiàn)不均一,胞核大,貼壁生長(zhǎng)。培養(yǎng) 10 天后,細(xì)胞呈放射狀,形態(tài)不完全統(tǒng)一(圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小鼠胚胎腦源與脊髓源神經(jīng)干細(xì)胞增殖能力的比較[J]. 趙瑜,袁婧,劉建軍,魯琳. 昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(09)
[2]表皮干細(xì)胞的生物學(xué)特性及其潛在應(yīng)用[J]. 劉雪婷,白春雨,關(guān)偉軍,馬月輝. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(01)
[3]Acupuncture inhibits Notch1 and Hes1 protein expression in the basal ganglia of rats with cerebral hemorrhage[J]. Wei Zou,Qiu-xin Chen,Xiao-wei Sun,Qing-bin Chi,Hong-yu Kuang,Xue-ping Yu,Xiao-hong Dai. Neural Regeneration Research. 2015(03)
[4]2011年中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病和死亡分析[J]. 陳萬(wàn)青,鄭榮壽,曾紅梅,鄒小農(nóng),張思維,赫捷. 中國(guó)腫瘤. 2015(01)
[5]測(cè)序技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 郝甜甜,李強(qiáng)飛,李國(guó)治,陳禹翰,鄧衛(wèi)東. 畜牧與飼料科學(xué). 2014(03)
[6]脂肪干細(xì)胞研究進(jìn)展與應(yīng)用前景[J]. 周紫微,趙宇. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(07)
[7]基于神經(jīng)氨酸酶結(jié)構(gòu)的流感病毒抑制劑的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)[J]. 劉磊,馬英,王潤(rùn)玲,王樹(shù)青,徐為人. 天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]藥物基因組學(xué)的機(jī)遇與挑戰(zhàn)[J]. 孫忠實(shí). 中國(guó)醫(yī)院用藥評(píng)價(jià)與分析. 2012(05)
[9]小議2010國(guó)內(nèi)外生命科學(xué)重要進(jìn)展[J]. 孫明偉,高福. 遺傳. 2011(02)
[10]Effects of cotransplantated Schwann cells and neural stem cells in a rat model of Alzheimer’s disease[J]. Yan Zhan1, 2, Dihui Ma2, Yu Zhang2 1Department of Neurology, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding 071000, Hebei Province, China 2Department of Neurology, First Clinical Hospital of Jilin University, Changchun 130021, Jilin Province, China. Neural Regeneration Research. 2011(04)
碩士論文
[1]依硫磷酸通過(guò)抑制細(xì)胞周期進(jìn)程抗白血病作用的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 張文英.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2012
[2]依硫磷酸抑制白血病細(xì)胞生物學(xué)活性、保護(hù)骨髓基質(zhì)細(xì)胞及對(duì)化療藥物抗白血病作用影響的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉璇.河北醫(yī)科大學(xué) 2011
[3]ABCA1及MTP基因多態(tài)性對(duì)辛伐他汀調(diào)脂效應(yīng)的影響[D]. 李穎.天津醫(yī)科大學(xué) 2006
本文編號(hào):3264138
【文章來(lái)源】:東北師范大學(xué)吉林省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:266 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
DGIdb數(shù)據(jù)庫(kù)檢索差異表達(dá)基因Figure1.SearchingdifferentiallyexpressedgenesinDGIdbdatabase
24圖 2. TSPO 基因匹配化合物及評(píng)分Figure 2. TSPO gene matching compounds and their scoring values5. NSCs 培養(yǎng)和誘導(dǎo)分化(1)誘導(dǎo) NSCs 定向分化實(shí)驗(yàn)分組:1)依替福辛誘導(dǎo)組;2)依替福辛+ bFGF 誘導(dǎo)組;3)bFGF+Hepari誘導(dǎo)組;4)正常培養(yǎng)對(duì)照組。用分化培養(yǎng)基(DMEM:F12+1%FBS+B27)包被24 孔板,過(guò)夜。將 NSCs 接種于 25ml 培養(yǎng)瓶中。分別加入不同組分化培養(yǎng)基誘導(dǎo)分化 3 天及 7 天。換液后放置于 37℃5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每 3 天半量換液,40X 顯微鏡下觀察,誘導(dǎo)培養(yǎng) 14 天進(jìn)行免疫熒光細(xì)胞染色鑒定。(2)免疫熒光觀察誘導(dǎo)后神經(jīng)細(xì)胞1)取出誘導(dǎo)細(xì)胞培養(yǎng)板 PBS 洗 5 分鐘 2 次。
三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果(一) MSCs 分離培養(yǎng)及 NSCs 細(xì)胞實(shí)驗(yàn)1. MSCs 培養(yǎng)MSCs 在低糖培養(yǎng)基中培養(yǎng) 24 小時(shí)后可見(jiàn)細(xì)胞貼壁生長(zhǎng),呈橢圓形,透亮。培養(yǎng) 3 天后可見(jiàn)多邊形細(xì)胞。培養(yǎng) 7 天后,細(xì)胞迅速增殖,細(xì)胞表現(xiàn)不均一,胞核大,貼壁生長(zhǎng)。培養(yǎng) 10 天后,細(xì)胞呈放射狀,形態(tài)不完全統(tǒng)一(圖 3)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]小鼠胚胎腦源與脊髓源神經(jīng)干細(xì)胞增殖能力的比較[J]. 趙瑜,袁婧,劉建軍,魯琳. 昆明醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2017(09)
[2]表皮干細(xì)胞的生物學(xué)特性及其潛在應(yīng)用[J]. 劉雪婷,白春雨,關(guān)偉軍,馬月輝. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(01)
[3]Acupuncture inhibits Notch1 and Hes1 protein expression in the basal ganglia of rats with cerebral hemorrhage[J]. Wei Zou,Qiu-xin Chen,Xiao-wei Sun,Qing-bin Chi,Hong-yu Kuang,Xue-ping Yu,Xiao-hong Dai. Neural Regeneration Research. 2015(03)
[4]2011年中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病和死亡分析[J]. 陳萬(wàn)青,鄭榮壽,曾紅梅,鄒小農(nóng),張思維,赫捷. 中國(guó)腫瘤. 2015(01)
[5]測(cè)序技術(shù)的研究進(jìn)展[J]. 郝甜甜,李強(qiáng)飛,李國(guó)治,陳禹翰,鄧衛(wèi)東. 畜牧與飼料科學(xué). 2014(03)
[6]脂肪干細(xì)胞研究進(jìn)展與應(yīng)用前景[J]. 周紫微,趙宇. 安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(07)
[7]基于神經(jīng)氨酸酶結(jié)構(gòu)的流感病毒抑制劑的計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)[J]. 劉磊,馬英,王潤(rùn)玲,王樹(shù)青,徐為人. 天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(03)
[8]藥物基因組學(xué)的機(jī)遇與挑戰(zhàn)[J]. 孫忠實(shí). 中國(guó)醫(yī)院用藥評(píng)價(jià)與分析. 2012(05)
[9]小議2010國(guó)內(nèi)外生命科學(xué)重要進(jìn)展[J]. 孫明偉,高福. 遺傳. 2011(02)
[10]Effects of cotransplantated Schwann cells and neural stem cells in a rat model of Alzheimer’s disease[J]. Yan Zhan1, 2, Dihui Ma2, Yu Zhang2 1Department of Neurology, Affiliated Hospital of Hebei University, Baoding 071000, Hebei Province, China 2Department of Neurology, First Clinical Hospital of Jilin University, Changchun 130021, Jilin Province, China. Neural Regeneration Research. 2011(04)
碩士論文
[1]依硫磷酸通過(guò)抑制細(xì)胞周期進(jìn)程抗白血病作用的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 張文英.中國(guó)人民解放軍醫(yī)學(xué)院 2012
[2]依硫磷酸抑制白血病細(xì)胞生物學(xué)活性、保護(hù)骨髓基質(zhì)細(xì)胞及對(duì)化療藥物抗白血病作用影響的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 劉璇.河北醫(yī)科大學(xué) 2011
[3]ABCA1及MTP基因多態(tài)性對(duì)辛伐他汀調(diào)脂效應(yīng)的影響[D]. 李穎.天津醫(yī)科大學(xué) 2006
本文編號(hào):3264138
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