高尿酸血癥及痛風疾病主要是由人體內尿酸含量增高所引起,尿酸鹽轉運蛋白（hURAT1）位于腎小管上皮細胞基頂膜上,對尿酸的重吸收起著決定性的作用,抑制其尿酸轉運能力可有效地降低人體內血尿酸濃度。為篩選尿酸轉運蛋白（hURAT1）抑制劑,本研究首先利用蛋白三維結構預測方法與分子對接技術構建計算機虛擬藥物篩選模型,在HK-2細胞中過表達hURAT1蛋白構建體外細胞尿酸吸收模型并通過雙熒光素酶報告基因檢測方法構建尿酸轉運蛋白（hURAT1）啟動子藥物篩選模型。從生物信息學,分子和細胞水平構建三個藥物篩選模型,并進行初步的應用。主要研究結果如下:1.構建hURAT1計算機虛擬藥物篩選模型。通過同源建模法、穿線法和綜合法分別對hURAT1蛋白進行三維結構預測,預測蛋白結構分別進行相關參數評分和比對。通過Verify-3D分析和Ramachandran圖評估結果,以確定綜合法ROBETTA預測的結構作為后續(xù)分子對接的最佳受體蛋白。為尋找受體蛋白的活性口袋,實驗通過Leinuard、Verinuard、Benzbromarone三種陽性藥物分別進行對接,根據氨基酸殘基對接位點,最后初步確定其活性口袋的... 

【文章來源】：貴州大學貴州省 211工程院校

【文章頁數】：77 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

SWISS-MODEL預測的蛋白結構

I-TASSER預測的蛋白結構

16圖 2-3 ROBETTA 預測的蛋白結構Fig.2-3 Protein structure predicted by ROBETTA證VES(http://servicesn.mbi.ucla.edu/SAVES/)對 I-TASSER 和 ROB估，以 Verify-3D 分析和 Ramachandran 圖評估、比對其立體化析 I-TASSER 預測結構的 3D-1D score >= 0.2 氨基酸殘基數占測結構的 3D-1D score >= 0.2 氨基酸殘基數占 89.51%；RamaR 預測的結構在有利區(qū)域僅占 72.7%，其中 ROBETTA 預測的RAT1 氨基酸殘基占 91.3％，其中不允許區(qū)域中殘基比例為 0 2-5。經比對，ROBETTA 所預測的蛋白結構明顯優(yōu)于 I-TASS

【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3240661