隨著高通量測(cè)序的發(fā)展,我們現(xiàn)在已掌握了大量生物學(xué)數(shù)據(jù),而且基因和抗癌藥物以及蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)方面的數(shù)據(jù)也在不斷地更新及豐富�！懊鎸�(duì)生物大數(shù)據(jù),如何建立數(shù)學(xué)模型進(jìn)行大數(shù)據(jù)的快速處理與有效分析,從而最大程度地發(fā)現(xiàn)隱藏在數(shù)據(jù)中的重要信息”是當(dāng)今生物數(shù)學(xué)領(lǐng)域的重要研究課題。通過(guò)數(shù)學(xué)模型來(lái)研究預(yù)測(cè)抗癌藥物的敏感性是癌癥研究中一項(xiàng)基本工作,更是預(yù)測(cè)抗癌藥物敏感性的重要方法,對(duì)基因組學(xué)和醫(yī)學(xué)也具有現(xiàn)實(shí)意義。眾所周知,個(gè)性化醫(yī)療的一個(gè)持久的挑戰(zhàn)是選擇每一個(gè)患者自己適合的抗癌藥物。患者在大型臨床試驗(yàn)測(cè)試藥物是評(píng)估其功效和毒性的一種方法,但是測(cè)試數(shù)百個(gè)目前正在開(kāi)發(fā)的藥物這是不切實(shí)際的。因此,臨床前預(yù)測(cè)模型是被高度期望的,因?yàn)樗苁顾幬锿瑫r(shí)響應(yīng)于數(shù)百細(xì)胞系的預(yù)測(cè)。目前用基因表達(dá)數(shù)據(jù)來(lái)預(yù)測(cè)藥物敏感性的方法,都是假設(shè)基因與基因之間彼此是相互獨(dú)立的,他們沒(méi)有考慮基因之間的相互作用,我們稱(chēng)這種預(yù)測(cè)方法為一元抗癌藥物敏感性預(yù)測(cè)。我們構(gòu)造了三種方法來(lái)研究基因與基因之間的相互作用,找到每個(gè)抗癌藥物的基因作用關(guān)系,并將之應(yīng)用于藥物敏感性的預(yù)測(cè)中,稱(chēng)之為二元抗癌藥物敏感性預(yù)測(cè)。這三種方法分別是DGCor Net、D... 

【文章來(lái)源】：河北科技大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：47 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

藥物敏感性測(cè)量指標(biāo)6）10倍交叉驗(yàn)證

第 2 章 抗癌藥物研究的基礎(chǔ) 絡(luò)算法簡(jiǎn)介及其數(shù)據(jù)來(lái)源絡(luò)簡(jiǎn)介意義上來(lái)講，蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間相互作用是指兩個(gè)或多個(gè)生蛋白質(zhì)復(fù)合物的過(guò)程。從圖論知識(shí)來(lái)說(shuō)，蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間連接的網(wǎng)絡(luò)，就稱(chēng)之為 PPI 網(wǎng)絡(luò)。由此可知，PPI 網(wǎng)絡(luò)所觀地展現(xiàn)生物組織中的蛋白質(zhì)和蛋白質(zhì)之間的相互作用，同、計(jì)算機(jī)科學(xué)和分析模型來(lái)處理 PPI 網(wǎng)絡(luò)相關(guān)的問(wèn)題[32]。圖網(wǎng)絡(luò)。

DGPPINet算法中藥物Nilotinib在GO:0005667~transcriptionfactorcomplex上的全局網(wǎng)絡(luò)圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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本文編號(hào)：3220492