藥物開發(fā)過(guò)程存在資本密度高、風(fēng)險(xiǎn)大、周期長(zhǎng)的特點(diǎn),需要投入大量的資金、人力與物力。傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法雖然可以在一定程度上輔助藥物開發(fā),但需要分子描述符作為特征輸入,而不同的分子描述符的選擇對(duì)機(jī)器學(xué)習(xí)模型的性能影響較大,因此傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)方法大多需要進(jìn)行繁復(fù)、耗時(shí)的特征工程。近年新興的深度學(xué)習(xí)方法,能夠從藥物的"原始"結(jié)構(gòu)中直接提取特征,從而繞開特征工程,縮短開發(fā)周期。該文將現(xiàn)有的藥物表示學(xué)習(xí)方法劃分為2類:基于簡(jiǎn)化分子線性輸入規(guī)范（SMILES）表達(dá)式的藥物表示學(xué)習(xí)和基于分子圖的藥物表示學(xué)習(xí),報(bào)告了這兩類藥物表示學(xué)習(xí)方法的最新研究進(jìn)展,闡述了各種方法的創(chuàng)新點(diǎn)與局限性。最后,指出了當(dāng)前藥物表示學(xué)習(xí)研究中存在的重大挑戰(zhàn),并討論了可能的解決方案。 

【文章來(lái)源】：清華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,60(02)北大核心EICSCD

【文章頁(yè)數(shù)】：10 頁(yè)

【文章目錄】：
1 基于SMILES表達(dá)式的表示學(xué)習(xí)
    1.1 藥物類比文本
    1.2 精確重構(gòu)即合理
2 基于分子圖的表示學(xué)習(xí)
    2.1 性質(zhì)預(yù)測(cè)任務(wù)
    2.2 相互作用預(yù)測(cè)任務(wù)
    2.3 藥物設(shè)計(jì)任務(wù)
3 重要挑戰(zhàn)
4 結(jié) 論



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