發(fā)布時(shí)間：2021-05-06 06:08

　　隨著癌癥控制成為全球性的衛(wèi)生戰(zhàn)略,癌癥藥物靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)正成為近年來(lái)的研究重點(diǎn)。本課題基于泛癌分析,旨在探究癌癥藥物靶點(diǎn)在人類蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中的結(jié)構(gòu)和功能特征,為癌癥藥物靶點(diǎn)的尋找提供幫助。我們首先基于Pub Med數(shù)據(jù)庫(kù)搜集已報(bào)道的藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)方法和模型。之后選擇急性髓系白血病、乳腺癌、卵巢癌、結(jié)直腸癌等9種癌癥作為研究對(duì)象,收集癌癥基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)以及每種癌癥的藥物靶點(diǎn)。通過(guò)構(gòu)建人類蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和癌癥特異的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),分析癌癥藥物靶點(diǎn)基因在這兩類網(wǎng)絡(luò)中的拓?fù)湫再|(zhì),并結(jié)合mi RNA-m RNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)對(duì)藥物靶點(diǎn)進(jìn)行跨組學(xué)分析。最后我們進(jìn)行癌癥藥物靶點(diǎn)基因的生物功能分析。研究結(jié)果表明,在選取的9種癌癥中藥物靶點(diǎn)基因平均有64%是非差異表達(dá)的,這說(shuō)明非差異表達(dá)基因也具有重要作用�；诎┌Y特異網(wǎng)絡(luò),我們發(fā)現(xiàn)大多數(shù)癌癥藥物靶點(diǎn)基因分布于差異基因的一階和二階鄰居位置上,這說(shuō)明很多癌癥藥物靶點(diǎn)基因雖然沒(méi)有顯著性的差異表達(dá),但與差異表達(dá)基因有著重要關(guān)系。癌癥藥物靶點(diǎn)基因在癌癥特異網(wǎng)絡(luò)上的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)特征是:有4種癌癥藥物靶點(diǎn)基因顯著地分布于度數(shù)最高的區(qū)間（p-value<0.05,... 

【文章來(lái)源】：蘇州大學(xué)江蘇省

【文章頁(yè)數(shù)】：109 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
abstract
第一章 引言
    1.1 研究背景
        1.1.1 藥物靶點(diǎn)
        1.1.2 癌癥概念與介紹
        1.1.3 基因芯片技術(shù)介紹
        1.1.4 人體內(nèi)的重要基因
        1.1.5 蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)
        1.1.6 藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)方法
    1.2 癌癥藥物靶點(diǎn)研究現(xiàn)狀
    1.3 研究意義及內(nèi)容
        1.3.1 研究?jī)?nèi)容
        1.3.2 研究目的及意義
        1.3.3 創(chuàng)新性分析
第二章 數(shù)據(jù)收集、處理與分析
    2.1 數(shù)據(jù)收集與處理
        2.1.1 癌癥藥物靶點(diǎn)數(shù)據(jù)收集
        2.1.2 基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)收集
    2.2 藥物靶點(diǎn)預(yù)測(cè)工具的對(duì)比
第三章 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與結(jié)構(gòu)分析
    3.1 癌癥蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建與分析
        3.1.1 背景網(wǎng)絡(luò)的選取
        3.1.2 癌癥特異性網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
    3.2 癌癥藥物靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)特征分析
        3.2.1 在特異癌癥中藥物靶點(diǎn)基因與差異表達(dá)基因的關(guān)系
        3.2.2 癌癥藥物靶點(diǎn)的網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)分析
    3.3 癌癥藥物靶點(diǎn)與miRNA-mRNA調(diào)控機(jī)制的跨組學(xué)分析
第四章 癌癥藥物靶點(diǎn)的生物功能分析
    4.1 藥物靶點(diǎn)與生物體內(nèi)關(guān)鍵基因的關(guān)系
        4.1.1 合成致死基因
        4.1.2 必需基因
        4.1.3 管家基因
        4.1.4 小結(jié)
    4.2 癌癥藥物靶點(diǎn)的功能富集分析
        4.2.1 功能注釋
        4.2.2 通路富集分析
    4.3 癌癥藥物靶點(diǎn)基因與癌癥特異網(wǎng)絡(luò)基因的功能驗(yàn)證對(duì)比
        4.3.1 癌癥特異網(wǎng)絡(luò)基因本體論驗(yàn)證
        4.3.2 癌癥特異網(wǎng)絡(luò)疾病與生物功能驗(yàn)證
        4.3.3 對(duì)比與小結(jié)
    4.4 癌癥藥物靶點(diǎn)基因與差異表達(dá)基因IPA信號(hào)通路比較
        4.4.1 各個(gè)癌癥藥物靶點(diǎn)基因與差異表達(dá)基因共同IPA信號(hào)通路的分析
        4.4.2 小結(jié)
第五章 總結(jié)與展望
    5.1 課題總結(jié)
    5.2 研究展望
參考文獻(xiàn)
附錄
讀碩士學(xué)位期間待發(fā)表的論文
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]肺癌相關(guān)基因與中心碳代謝[J]. 王曉燕,李衛(wèi)東,花寶金.  中華中醫(yī)藥學(xué)刊. 2018(01)
[2]Helicobacter pylori and interleukin-8 in gastric cancer[J]. Ko Eun Lee,Pham Ngoc Khoi,Yong Xia,Jung Sun Park,Young Eun Joo,Kyung Keun Kim,Seok Yong Choi,Young Do Jung.  World Journal of Gastroenterology. 2013(45)

碩士論文
[1]MicroRNA生物標(biāo)志物識(shí)別的模型構(gòu)建[D]. 林宇鑫.蘇州大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3171391