炭樣小單孢菌JXNU-1中抗生素生物合成相關(guān)基因簇P450的功能分析
發(fā)布時間:2021-04-01 07:48
炭樣小單孢菌JXNU-1(M.carbonacea JXNU-1)是實驗室前期由瑤湖農(nóng)田土壤樣品中分離出的一株稀有放線菌,它可以產(chǎn)生一種核苷類的廣譜抗生素JX,其基因簇P450為抗生素JX合成相關(guān)基因簇,但它的具體功能仍不清楚基因敲除是常用的基因功能研究手段,它通過移除目的基因構(gòu)建基因缺失菌株,通過比較基因缺失菌株與野生型菌株的表現(xiàn)型差異研究目的基因的功能。本文通過構(gòu)建基因簇P450缺失突變株炭樣小單孢菌JXNU-ΔP450以及回復(fù)突變株炭樣小單孢菌JXNU-re,研究基因簇P450在炭樣小單孢菌JXNU-1產(chǎn)抗生素JX的生物合成中的作用,具體過程和結(jié)果如下:1.以溫敏型質(zhì)粒pKC1139作為模板,導(dǎo)入炭樣小單孢菌JXNU-1目的基因上下游片段作為同源交換臂以及質(zhì)粒pIJ790上氯霉素抗性標(biāo)記基因cat,成功構(gòu)建炭樣小單孢菌JXNU-1基因敲除載體pFD306,經(jīng)測序驗證后,通過電轉(zhuǎn)化導(dǎo)入野生型炭樣小單孢菌JXNU-1受體菌,再通過抗性篩選、目的基因PCR擴增及擴增產(chǎn)物測序驗證,成功構(gòu)建基因缺失株炭樣小單孢菌JXNU-ΔP450,并通過PCR產(chǎn)物驗證以及測序驗證確定了目的基因簇的缺失。...
【文章來源】:江西師范大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
同源重組技術(shù)替換目的基因Fig.1-1Replacedesirablegenebyhomologousrecombination
圖 1-2 鋅指蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-2 Structure of the zinc finger proteinNA、RNA 這類核酸結(jié)合,還能結(jié)合 DNA白或自身,在轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上調(diào)控基因
圖 1-4TALE蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-4 Structure of the TALE proteinTALE 識別 DNA 的機制在于不同的 RVD 能夠相對特異地分別識別 A、TC、G 4 種堿基中的一種。通過對天然 TALE 的研究發(fā)現(xiàn),有 20 多種不同的 RVD
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制性消減雜交法篩選炭樣小單孢菌JXNU-1中抗生素合成相關(guān)基因[J]. 江云,黃運紅,李非,龍中兒. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(10)
[2]CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)最新研究進展[J]. 謝亞磊,劉千琪,劉戟. 生命的化學(xué). 2016(01)
[3]Red/ET同源重組技術(shù)在載體構(gòu)建中的應(yīng)用[J]. 曾吉祥. 生物技術(shù)世界. 2015(07)
[4]一株具有廣譜抗菌活性炭樣小單孢菌的全基因組序列測定[J]. 江云,黃運紅,李非,龍中兒. 微生物學(xué)通報. 2015(11)
[5]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)研究進展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學(xué)報. 2015(11)
[6]靶向核酸酶介導(dǎo)基因編輯技術(shù)的發(fā)展[J]. 項光海,王皓毅. 生命科學(xué). 2015(01)
[7]基因組挖掘技術(shù)在海洋放線菌天然產(chǎn)物研究開發(fā)中的應(yīng)用及展望[J]. 陳亮宇,王玉梅,趙心清. 微生物學(xué)通報. 2013(10)
[8]小單孢菌科研究進展[J]. 張曉敏,劉秋,劉限,王皓,閆建芳,劉長建,齊曉輝,白湜. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(09)
[9]大腸桿菌-鏈霉菌穿梭型BAC載體的構(gòu)建及功能驗證[J]. 戴素琴,周圍,邢玉華,劉體顏,譚俊杰,曲國龍,王微,劉剛,陳惠鵬,張部昌. 軍事醫(yī)學(xué). 2013(08)
[10]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組定點編輯技術(shù)[J]. 方銳,暢飛,孫照霖,李寧,孟慶勇. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2013(08)
碩士論文
[1]炭樣小單孢菌JXNU-1中抗生素合成相關(guān)基因篩選[D]. 江云.江西師范大學(xué) 2016
[2]紡錘鏈霉菌SD-07遺傳轉(zhuǎn)移體系的建立及產(chǎn)多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素基因簇的初步研究[D]. 王先坤.山東大學(xué) 2014
[3]冰城鏈霉菌屬間接轉(zhuǎn)移體系及南昌霉素中斷菌株的構(gòu)建[D]. 賀祖宏.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]鏈霉菌769遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立和優(yōu)化[D]. 張紅丹.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]nsdA基因中斷及orfX基因整合表達(dá)對阿維鏈霉菌次級代謝的影響[D]. 范與慶.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]稀有放線菌的分離及其發(fā)酵產(chǎn)物的農(nóng)用活性研究[D]. 沈玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
[7]黑暗鏈霉菌基因轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的研究[D]. 吳勝.沈陽藥科大學(xué) 2001
本文編號:3112958
【文章來源】:江西師范大學(xué)江西省
【文章頁數(shù)】:70 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
同源重組技術(shù)替換目的基因Fig.1-1Replacedesirablegenebyhomologousrecombination
圖 1-2 鋅指蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-2 Structure of the zinc finger proteinNA、RNA 這類核酸結(jié)合,還能結(jié)合 DNA白或自身,在轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上調(diào)控基因
圖 1-4TALE蛋白結(jié)構(gòu)Fig.1-4 Structure of the TALE proteinTALE 識別 DNA 的機制在于不同的 RVD 能夠相對特異地分別識別 A、TC、G 4 種堿基中的一種。通過對天然 TALE 的研究發(fā)現(xiàn),有 20 多種不同的 RVD
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]抑制性消減雜交法篩選炭樣小單孢菌JXNU-1中抗生素合成相關(guān)基因[J]. 江云,黃運紅,李非,龍中兒. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2016(10)
[2]CRISPR/Cas9基因編輯技術(shù)最新研究進展[J]. 謝亞磊,劉千琪,劉戟. 生命的化學(xué). 2016(01)
[3]Red/ET同源重組技術(shù)在載體構(gòu)建中的應(yīng)用[J]. 曾吉祥. 生物技術(shù)世界. 2015(07)
[4]一株具有廣譜抗菌活性炭樣小單孢菌的全基因組序列測定[J]. 江云,黃運紅,李非,龍中兒. 微生物學(xué)通報. 2015(11)
[5]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因編輯技術(shù)研究進展[J]. 李聰,曹文廣. 生物工程學(xué)報. 2015(11)
[6]靶向核酸酶介導(dǎo)基因編輯技術(shù)的發(fā)展[J]. 項光海,王皓毅. 生命科學(xué). 2015(01)
[7]基因組挖掘技術(shù)在海洋放線菌天然產(chǎn)物研究開發(fā)中的應(yīng)用及展望[J]. 陳亮宇,王玉梅,趙心清. 微生物學(xué)通報. 2013(10)
[8]小單孢菌科研究進展[J]. 張曉敏,劉秋,劉限,王皓,閆建芳,劉長建,齊曉輝,白湜. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2013(09)
[9]大腸桿菌-鏈霉菌穿梭型BAC載體的構(gòu)建及功能驗證[J]. 戴素琴,周圍,邢玉華,劉體顏,譚俊杰,曲國龍,王微,劉剛,陳惠鵬,張部昌. 軍事醫(yī)學(xué). 2013(08)
[10]CRISPR/Cas9介導(dǎo)的基因組定點編輯技術(shù)[J]. 方銳,暢飛,孫照霖,李寧,孟慶勇. 生物化學(xué)與生物物理進展. 2013(08)
碩士論文
[1]炭樣小單孢菌JXNU-1中抗生素合成相關(guān)基因篩選[D]. 江云.江西師范大學(xué) 2016
[2]紡錘鏈霉菌SD-07遺傳轉(zhuǎn)移體系的建立及產(chǎn)多烯大環(huán)內(nèi)酯類抗生素基因簇的初步研究[D]. 王先坤.山東大學(xué) 2014
[3]冰城鏈霉菌屬間接轉(zhuǎn)移體系及南昌霉素中斷菌株的構(gòu)建[D]. 賀祖宏.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]鏈霉菌769遺傳轉(zhuǎn)化體系的建立和優(yōu)化[D]. 張紅丹.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[5]nsdA基因中斷及orfX基因整合表達(dá)對阿維鏈霉菌次級代謝的影響[D]. 范與慶.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
[6]稀有放線菌的分離及其發(fā)酵產(chǎn)物的農(nóng)用活性研究[D]. 沈玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2006
[7]黑暗鏈霉菌基因轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的研究[D]. 吳勝.沈陽藥科大學(xué) 2001
本文編號:3112958
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