RNA結(jié)合蛋白作為氯?朔铀幇械臋C(jī)制初探
發(fā)布時(shí)間:2021-01-21 02:18
目的探索氯?朔影邢騌NA結(jié)合蛋白的抗膠質(zhì)瘤機(jī)制。方法 Biotin pull-down實(shí)驗(yàn)檢測(cè)RNA結(jié)合蛋白N-ras上游蛋白(UNR)與靶基因Krüppel樣因子13(KLF13)mRNA各片段的結(jié)合,以及氯?朔訉(duì)UNR與下游靶基因KLF13 mRNA片段結(jié)合能力的影響;氯?朔影悬c(diǎn)穩(wěn)定性的藥物親和反應(yīng)(DARTS)樣品質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組芯片分析相結(jié)合,篩選其他RNA結(jié)合蛋白作用靶點(diǎn),并對(duì)其他下游靶基因進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。結(jié)果氯?朔涌梢栽鰪(qiáng)UNR與KLF13 mRNA片段的結(jié)合;氯?朔舆可與其他RNA結(jié)合蛋白相互作用,參與mTOR信號(hào)通路以及由腫瘤壞死因子相關(guān)凋亡誘導(dǎo)配體(TRAIL)激活的凋亡信號(hào)通路。結(jié)論氯?朔涌赏ㄟ^作用于RNA結(jié)合蛋白而起到抗膠質(zhì)瘤的效果。
【文章來源】:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020,40(05)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
氯福克酚增強(qiáng)UNR與KLF13 mRNA之間的互作
氯?朔幼饔糜赨NR的下游靶基因預(yù)測(cè)分析
本實(shí)驗(yàn)室前期篩選出了一種以RNA結(jié)合蛋白UNR為靶點(diǎn)的可有效治療膠質(zhì)瘤的潛在新藥氯?朔,但藥靶UNR調(diào)控靶基因KLF13表達(dá)的具體機(jī)制尚不清楚。為了證明靶基因KLF13 mRNA與藥靶UNR之間存在互作, 克隆并制備了包含UNR潛在結(jié)合位點(diǎn)的6條探針,體外pull-down篩選到了2條包含GAAGGA、GAAGAA序列的KLF13 mRNA所在探針片段可結(jié)合UNR,利用pull-down實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)氯?朔犹幚砜稍鰪(qiáng)其中一條探針與UNR的結(jié)合能力,這提示氯?朔涌赡苤饕ㄟ^該探針?biāo)谄?增強(qiáng)UNR與KLF13 mRNA的結(jié)合能力。為了找尋氯?朔涌鼓z質(zhì)瘤的其他重要作用靶點(diǎn)以及下游途徑,通過氯?朔覦ARTS樣品質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果結(jié)合轉(zhuǎn)錄組芯片分析,發(fā)現(xiàn)除了UNR蛋白外,另外3個(gè)經(jīng)典RNA結(jié)合蛋白XPO7、LARS和EIF3B也可以作為氯?朔拥陌悬c(diǎn),這4個(gè)RBP均具有可結(jié)合RNA的保守結(jié)構(gòu)域[6]。利用網(wǎng)上已公開的數(shù)據(jù)進(jìn)一步預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),氯?朔舆可能通過調(diào)控mTOR信號(hào)通路以及TRAIL激活的凋亡信號(hào)通路而起到抗膠質(zhì)瘤的效果,但氯?朔又委熌z質(zhì)瘤的這些潛在機(jī)制還尚未進(jìn)一步證實(shí)。圖4 氯?朔幼饔糜谄渌(jīng)典RBPs的下游靶基因預(yù)測(cè)分析
本文編號(hào):2990253
【文章來源】:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床. 2020,40(05)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
氯福克酚增強(qiáng)UNR與KLF13 mRNA之間的互作
氯?朔幼饔糜赨NR的下游靶基因預(yù)測(cè)分析
本實(shí)驗(yàn)室前期篩選出了一種以RNA結(jié)合蛋白UNR為靶點(diǎn)的可有效治療膠質(zhì)瘤的潛在新藥氯?朔,但藥靶UNR調(diào)控靶基因KLF13表達(dá)的具體機(jī)制尚不清楚。為了證明靶基因KLF13 mRNA與藥靶UNR之間存在互作, 克隆并制備了包含UNR潛在結(jié)合位點(diǎn)的6條探針,體外pull-down篩選到了2條包含GAAGGA、GAAGAA序列的KLF13 mRNA所在探針片段可結(jié)合UNR,利用pull-down實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)氯?朔犹幚砜稍鰪(qiáng)其中一條探針與UNR的結(jié)合能力,這提示氯?朔涌赡苤饕ㄟ^該探針?biāo)谄?增強(qiáng)UNR與KLF13 mRNA的結(jié)合能力。為了找尋氯?朔涌鼓z質(zhì)瘤的其他重要作用靶點(diǎn)以及下游途徑,通過氯?朔覦ARTS樣品質(zhì)譜檢測(cè)結(jié)果結(jié)合轉(zhuǎn)錄組芯片分析,發(fā)現(xiàn)除了UNR蛋白外,另外3個(gè)經(jīng)典RNA結(jié)合蛋白XPO7、LARS和EIF3B也可以作為氯?朔拥陌悬c(diǎn),這4個(gè)RBP均具有可結(jié)合RNA的保守結(jié)構(gòu)域[6]。利用網(wǎng)上已公開的數(shù)據(jù)進(jìn)一步預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),氯?朔舆可能通過調(diào)控mTOR信號(hào)通路以及TRAIL激活的凋亡信號(hào)通路而起到抗膠質(zhì)瘤的效果,但氯?朔又委熌z質(zhì)瘤的這些潛在機(jī)制還尚未進(jìn)一步證實(shí)。圖4 氯?朔幼饔糜谄渌(jīng)典RBPs的下游靶基因預(yù)測(cè)分析
本文編號(hào):2990253
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