目的:肝細(xì)胞肝癌（Hepatocellular carcinoma,HCC）是世界范圍內(nèi)死亡率較高的惡性腫瘤之一,且其發(fā)病率高約占全部原發(fā)性肝癌病例的70%～85%。HCC主要的治療方案包括手術(shù)治療、放射治療和藥物治療,其中手術(shù)治療是首選方案。但是由于HCC病程早期無明顯癥狀,50%以上患者診斷時已超出手術(shù)最佳時期。因此靶向藥物治療、介入治療、放射治療在更好的控制和治療HCC中也十分重要。HCC的發(fā)生經(jīng)歷了細(xì)胞內(nèi)信號通路的改變、腫瘤增殖代謝系統(tǒng)的改變以及局部腫瘤微環(huán)境的形成等極其復(fù)雜的多個過程。基于HCC發(fā)生和發(fā)展中基因表達(dá)譜的變化以及細(xì)胞內(nèi)信號通路的改變等進(jìn)行研究,可以篩選出潛在的治療新靶點(diǎn)。而利用篩選得到的HCC治療靶點(diǎn)的蛋白晶體結(jié)構(gòu),就可以進(jìn)行靶向藥物的設(shè)計。利用藥物受體學(xué)說,可以基于靶點(diǎn)蛋白或其配體的3D結(jié)構(gòu)設(shè)計出相應(yīng)的靶向藥物。以配體的肽模擬物為先導(dǎo)物,利用計算機(jī)模擬設(shè)計技術(shù)對其進(jìn)行合理的結(jié)構(gòu)改造,可以獲得與特定蛋白親和的多肽偶聯(lián)藥物。對此多肽偶聯(lián)藥物進(jìn)行合成路線設(shè)計后,通過化學(xué)合成即可獲得目標(biāo)肽類化合物。本研究旨在篩選HCC潛在的治療靶點(diǎn),并進(jìn)一步設(shè)計能與此靶點(diǎn)結(jié)合的靶向肽... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：109 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分:基于生物信息大數(shù)據(jù)分析篩選肝細(xì)胞肝癌治療新靶點(diǎn)
    1 前言
    2 材料與方法
        2.1 實驗材料與儀器
            2.1.1 組織樣本來源
            2.1.2 主要材料及試劑
            2.1.3 主要實驗儀器
        2.2 實驗方法
            2.2.1 TCGA數(shù)據(jù)庫肝癌轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜數(shù)據(jù)獲取
            2.2.2 差異表達(dá)基因篩選
            2.2.3 基因本體論分析
            2.2.4 構(gòu)建蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)
            2.2.5 Kaplan-Meier生存分析及Cox回歸分析
            2.2.6 免疫組化相關(guān)試劑配制
            2.2.7 免疫組織化學(xué)染色試驗（IHC）
            2.2.8 基因集富集分析（GSEA）
            2.2.9 統(tǒng)計分析
    3 結(jié)果
        3.1 肝細(xì)胞肝癌差異表達(dá)基因篩選及功能注釋分析結(jié)果
        3.2 候選靶點(diǎn)基因篩選策略及蛋白-蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        3.3 肝細(xì)胞肝癌患者的臨床病理特征
        3.4 候選靶點(diǎn)基因表達(dá)水平與肝細(xì)胞肝癌患者不良預(yù)后的關(guān)系
        3.5 候選靶點(diǎn)基因的腫瘤表達(dá)譜
        3.6 CTAG2和PRSS3 的表達(dá)情況與臨床病理參數(shù)的相關(guān)性
            3.6.1 CTAG2的表達(dá)情況與臨床病理參數(shù)的相關(guān)性
            3.6.2 PRSS3的表達(dá)情況與臨床病理參數(shù)的相關(guān)性
        3.7 CTAG2和PRSS3 相關(guān)KEGG信號通路和調(diào)控分子分析
            3.7.1 關(guān)于CTAG2的基因集富集分析及調(diào)控分子
            3.7.2 關(guān)于PRSS3的基因集富集分析及調(diào)控分子
    4 討論
第二部分:靶向PRSS3的多肽偶聯(lián)藥物設(shè)計及活性研究
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 材料與試劑
            2.1.1 細(xì)胞來源
            2.1.2 主要實驗試劑
            2.1.3 實驗儀器
        2.2 實驗方法
            2.2.1 基于MOE軟件的分子對接（Docking）
            2.2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的測定
            2.2.3 Fmoc-Ile-Wang樹脂替代度的測定
            2.2.4 靶向PRSS3 的多肽WZ-1 的合成方法
            2.2.5 多肽WZ-1偶聯(lián)連接臂的合成方法
            2.2.6 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥的合成方法
            2.2.7 多肽偶聯(lián)苯丁酸氮芥的純化方法
            2.2.8 含量分析方法驗證
            2.2.9 細(xì)胞培養(yǎng)
            2.2.10 基于四唑鹽比色法的細(xì)胞毒性實驗（MTT）
    3 結(jié)果
        3.1 基于PRSS3蛋白晶體結(jié)構(gòu)設(shè)計的親和多肽
            3.1.1 PRSS3與其蛋白抑制劑結(jié)構(gòu)細(xì)化及相互作用位點(diǎn)
            3.1.2 親和多肽設(shè)計與分子對接
        3.2 多肽WZ-1偶聯(lián)藥物的合成路線設(shè)計
            3.2.1 多肽WZ-1的合成路線設(shè)計
            3.2.2 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥的合成路線設(shè)計
        3.3 多肽WZ-1偶聯(lián)藥物的合成
            3.3.1 氨基酸縮合反應(yīng)研究
            3.3.2 氨基酸樹脂替代度的研究
            3.3.3 關(guān)鍵中間體的合成
            3.3.4 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥的合成
        3.4 相關(guān)化合物的表征
            3.4.1 關(guān)鍵中間體的質(zhì)譜
            3.4.2 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥的表征
        3.5 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥含量方法學(xué)驗證
            3.5.1 線性與范圍
            3.5.2 溶液穩(wěn)定性
            3.5.3 精密度
        3.6 多肽WZ-1偶聯(lián)苯丁酸氮芥的細(xì)胞毒性效果
    4 討論
結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2012—2017年美國食品和藥物管理局批準(zhǔn)的抗腫瘤新藥研發(fā)概況[J]. 王傳權(quán).  中國新藥與臨床雜志. 2018(06)
[2]Cancer incidence and mortality in China, 2014[J]. Wanqing Chen,Kexin Sun,Rongshou Zheng,Hongmei Zeng,Siwei Zhang,Changfa Xia,Zhixun Yang,He Li,Xiaonong Zou,Jie He.  Chinese Journal of Cancer Research. 2018(01)
[3]Hepatocellular carcinoma in the elderly:Meta-analysis and systematic literature review[J]. Annie K Hung,Jennifer Guy.  World Journal of Gastroenterology. 2015(42)
[4]多肽偶聯(lián)藥物的研究進(jìn)展[J]. 夏江華,馮軍.  世界臨床藥物. 2014(09)
[5]抗腫瘤藥NGR-hTNF[J]. 邢愛敏.  藥學(xué)進(jìn)展. 2011(11)

碩士論文
[1]基于多肽偶聯(lián)技術(shù)的新型抗腫瘤藥物的設(shè)計與研究[D]. 何自浩.華中科技大學(xué) 2016



本文編號：2986958