通過比較分子力場分析方法（CoMFA）研究氟喹諾酮均三唑衍生物對人肝癌細胞（SMMC-7721）、鼠白血病細胞（L1210）和人白血病細胞（HL60）的體外增值抑制活性的三維定量結(jié)構(gòu)-活性相關(guān)（3D-QSAR）.根據(jù)CoMFA模型的立體場和靜電場三維等勢線圖可知,外部苯環(huán)的4-位引入的近正遠負大體積基團,有利于提高氟喹諾酮均三唑衍生物的抗腫瘤活性. 

【文章來源】：分子科學學報. 2020,36(03)北大核心

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【部分圖文】：

氟喹諾酮均三唑衍生物的母體結(jié)構(gòu)

分別在母體結(jié)構(gòu)上部苯環(huán)的2-,3-和4-位引入—CO2H,—NO2,—CF3和—CN等基團,設(shè)計化合物15-19,取代基R依次為:2,4-2CN-C6H3,2,4-2NO2-C6H3,4-CF3-C6H4,3,4-2CO2H-C6H3和3,4-2CF3-C6H3.隨機選取化合物2,8,12,14和新設(shè)計的5個分子,共9個分子為測試集(其中化合物14為模板分子),余下11個分子作為訓練集(含模板分子).根據(jù)CoMFA的研究方法,通常選取抗腫瘤活性Ai最大的為模板分子.化合物14對SMMC-7721和L1210的抗腫瘤活性最強[7];對HL60的抗腫瘤活性稍低于化合物13,但不足0.1[7].故3種抗腫瘤活性均以化合物14為模板分子.基于原子契合疊合方式,即公共骨架的疊合方法,均通過圖1中除S*和N*外的左邊部分為公共骨架進行疊合.運用Align database模塊分別對訓練集和測試集按照均方根偏差最小的原則進行疊合,以保證所有分子取向的一致性(見圖2).由圖2可見,它們都與模板分子化合物14很好地吻合.1.2.3 訓練集CoMFA模型的建立

CoMFA模型的立體作用分布圖通常包含綠色區(qū)域和黃色區(qū)域,其中綠色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積較大的取代基有助于提高化合物的活性,黃色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積小的基團會使化合物的活性增強.以化合物14為模板分子的三維立體場等勢圖見圖3,其中圖3a,3b和3c依次為抗SMMC-7721,L1210和HL60細胞活性的立體場圖.這3個圖的中間苯環(huán)都被黃色區(qū)域包裹,外邊苯環(huán)及其取代基均連有綠色區(qū)域.因此,在中間苯環(huán)的4-位上連有大體積基團,將使抗腫瘤活性增強.例如,化合物6,7,13和14是4-位上連有帶取代基的苯環(huán),其體積最大,故其抗腫瘤活性均強于其他化合物.結(jié)合其他分子的體積與Ai可見,化合物的抗腫瘤活性與分子體積呈正相關(guān)關(guān)系.2.3.2 抗腫瘤活性的靜電場等勢圖

【參考文獻】：
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