氟喹諾酮均三唑衍生物抗腫瘤活性的CoFMA研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-18 03:58
通過(guò)比較分子力場(chǎng)分析方法(CoMFA)研究氟喹諾酮均三唑衍生物對(duì)人肝癌細(xì)胞(SMMC-7721)、鼠白血病細(xì)胞(L1210)和人白血病細(xì)胞(HL60)的體外增值抑制活性的三維定量結(jié)構(gòu)-活性相關(guān)(3D-QSAR).根據(jù)CoMFA模型的立體場(chǎng)和靜電場(chǎng)三維等勢(shì)線圖可知,外部苯環(huán)的4-位引入的近正遠(yuǎn)負(fù)大體積基團(tuán),有利于提高氟喹諾酮均三唑衍生物的抗腫瘤活性.
【文章來(lái)源】:分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,36(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
氟喹諾酮均三唑衍生物的母體結(jié)構(gòu)
分別在母體結(jié)構(gòu)上部苯環(huán)的2-,3-和4-位引入—CO2H,—NO2,—CF3和—CN等基團(tuán),設(shè)計(jì)化合物15-19,取代基R依次為:2,4-2CN-C6H3,2,4-2NO2-C6H3,4-CF3-C6H4,3,4-2CO2H-C6H3和3,4-2CF3-C6H3.隨機(jī)選取化合物2,8,12,14和新設(shè)計(jì)的5個(gè)分子,共9個(gè)分子為測(cè)試集(其中化合物14為模板分子),余下11個(gè)分子作為訓(xùn)練集(含模板分子).根據(jù)CoMFA的研究方法,通常選取抗腫瘤活性Ai最大的為模板分子.化合物14對(duì)SMMC-7721和L1210的抗腫瘤活性最強(qiáng)[7];對(duì)HL60的抗腫瘤活性稍低于化合物13,但不足0.1[7].故3種抗腫瘤活性均以化合物14為模板分子.基于原子契合疊合方式,即公共骨架的疊合方法,均通過(guò)圖1中除S*和N*外的左邊部分為公共骨架進(jìn)行疊合.運(yùn)用Align database模塊分別對(duì)訓(xùn)練集和測(cè)試集按照均方根偏差最小的原則進(jìn)行疊合,以保證所有分子取向的一致性(見(jiàn)圖2).由圖2可見(jiàn),它們都與模板分子化合物14很好地吻合.1.2.3 訓(xùn)練集CoMFA模型的建立
CoMFA模型的立體作用分布圖通常包含綠色區(qū)域和黃色區(qū)域,其中綠色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積較大的取代基有助于提高化合物的活性,黃色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積小的基團(tuán)會(huì)使化合物的活性增強(qiáng).以化合物14為模板分子的三維立體場(chǎng)等勢(shì)圖見(jiàn)圖3,其中圖3a,3b和3c依次為抗SMMC-7721,L1210和HL60細(xì)胞活性的立體場(chǎng)圖.這3個(gè)圖的中間苯環(huán)都被黃色區(qū)域包裹,外邊苯環(huán)及其取代基均連有綠色區(qū)域.因此,在中間苯環(huán)的4-位上連有大體積基團(tuán),將使抗腫瘤活性增強(qiáng).例如,化合物6,7,13和14是4-位上連有帶取代基的苯環(huán),其體積最大,故其抗腫瘤活性均強(qiáng)于其他化合物.結(jié)合其他分子的體積與Ai可見(jiàn),化合物的抗腫瘤活性與分子體積呈正相關(guān)關(guān)系.2.3.2 抗腫瘤活性的靜電場(chǎng)等勢(shì)圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]硝基苯衍生物對(duì)發(fā)光菌抑制毒性的CoMFA模型[J]. 馮長(zhǎng)君. 徐州工程學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(01)
[2]QSAR Studies on the Inhibitory Activity of Levofloxacin-thiadiazole HDACi Conjugates to Histone Deacetylases[J]. 王超,馮長(zhǎng)君. Chinese Journal of Structural Chemistry. 2018(11)
[3]基于分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬的新型酰胺-膦酸酯類hsEH抑制劑的QSAR研究[J]. 易忠勝,段家喜,聶瑾芳,趙賽. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[4]QSAR Study of the Action Strength of DOM of Phenyl-isopropyl-amine Dopes Using MLR and BP-ANN[J]. 王超,馮長(zhǎng)君. 結(jié)構(gòu)化學(xué). 2017(10)
[5]預(yù)測(cè)氯代芳烴對(duì)戈卑魚毒性的理論研究[J]. 堵錫華,吳瓊,田林,李昭. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[6]ACE抑制劑的QSAR研究與分子設(shè)計(jì)[J]. 仝建波,李康楠,吳英紀(jì),占培,李凌霄. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]C-3噁二唑硫乙酰腙取代的氟喹諾酮類似物的合成、抗腫瘤活性及構(gòu)-效關(guān)系[J]. 高留州,謝玉鎖,李濤,黃文龍,胡國(guó)強(qiáng). 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2014(12)
[8]Part Ⅳ.環(huán)丙沙星C-3羧基衍生物均三唑并噻二嗪及吡唑并均三唑的合成和抗腫瘤活性研究[J]. 謝松強(qiáng),陳寅生,王國(guó)強(qiáng),段楠楠,溫曉漪,曹鐵耀,銀俊,王偉,胡國(guó)強(qiáng),黃文龍. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[9]黃酮類化合物抑制MMP-9的定量結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系和結(jié)構(gòu)修飾的理論研究[J]. 張?bào)K,申鵬,陸濤,余丹妮,李卉,楊國(guó)忠. 化學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[10]藥物分子設(shè)計(jì)的策略:藥理活性與成藥性[J]. 郭宗儒. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2010(05)
本文編號(hào):2984229
【文章來(lái)源】:分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,36(03)北大核心
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
氟喹諾酮均三唑衍生物的母體結(jié)構(gòu)
分別在母體結(jié)構(gòu)上部苯環(huán)的2-,3-和4-位引入—CO2H,—NO2,—CF3和—CN等基團(tuán),設(shè)計(jì)化合物15-19,取代基R依次為:2,4-2CN-C6H3,2,4-2NO2-C6H3,4-CF3-C6H4,3,4-2CO2H-C6H3和3,4-2CF3-C6H3.隨機(jī)選取化合物2,8,12,14和新設(shè)計(jì)的5個(gè)分子,共9個(gè)分子為測(cè)試集(其中化合物14為模板分子),余下11個(gè)分子作為訓(xùn)練集(含模板分子).根據(jù)CoMFA的研究方法,通常選取抗腫瘤活性Ai最大的為模板分子.化合物14對(duì)SMMC-7721和L1210的抗腫瘤活性最強(qiáng)[7];對(duì)HL60的抗腫瘤活性稍低于化合物13,但不足0.1[7].故3種抗腫瘤活性均以化合物14為模板分子.基于原子契合疊合方式,即公共骨架的疊合方法,均通過(guò)圖1中除S*和N*外的左邊部分為公共骨架進(jìn)行疊合.運(yùn)用Align database模塊分別對(duì)訓(xùn)練集和測(cè)試集按照均方根偏差最小的原則進(jìn)行疊合,以保證所有分子取向的一致性(見(jiàn)圖2).由圖2可見(jiàn),它們都與模板分子化合物14很好地吻合.1.2.3 訓(xùn)練集CoMFA模型的建立
CoMFA模型的立體作用分布圖通常包含綠色區(qū)域和黃色區(qū)域,其中綠色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積較大的取代基有助于提高化合物的活性,黃色區(qū)域表示該區(qū)域引入體積小的基團(tuán)會(huì)使化合物的活性增強(qiáng).以化合物14為模板分子的三維立體場(chǎng)等勢(shì)圖見(jiàn)圖3,其中圖3a,3b和3c依次為抗SMMC-7721,L1210和HL60細(xì)胞活性的立體場(chǎng)圖.這3個(gè)圖的中間苯環(huán)都被黃色區(qū)域包裹,外邊苯環(huán)及其取代基均連有綠色區(qū)域.因此,在中間苯環(huán)的4-位上連有大體積基團(tuán),將使抗腫瘤活性增強(qiáng).例如,化合物6,7,13和14是4-位上連有帶取代基的苯環(huán),其體積最大,故其抗腫瘤活性均強(qiáng)于其他化合物.結(jié)合其他分子的體積與Ai可見(jiàn),化合物的抗腫瘤活性與分子體積呈正相關(guān)關(guān)系.2.3.2 抗腫瘤活性的靜電場(chǎng)等勢(shì)圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]硝基苯衍生物對(duì)發(fā)光菌抑制毒性的CoMFA模型[J]. 馮長(zhǎng)君. 徐州工程學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(01)
[2]QSAR Studies on the Inhibitory Activity of Levofloxacin-thiadiazole HDACi Conjugates to Histone Deacetylases[J]. 王超,馮長(zhǎng)君. Chinese Journal of Structural Chemistry. 2018(11)
[3]基于分子對(duì)接、分子動(dòng)力學(xué)模擬的新型酰胺-膦酸酯類hsEH抑制劑的QSAR研究[J]. 易忠勝,段家喜,聶瑾芳,趙賽. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2018(03)
[4]QSAR Study of the Action Strength of DOM of Phenyl-isopropyl-amine Dopes Using MLR and BP-ANN[J]. 王超,馮長(zhǎng)君. 結(jié)構(gòu)化學(xué). 2017(10)
[5]預(yù)測(cè)氯代芳烴對(duì)戈卑魚毒性的理論研究[J]. 堵錫華,吳瓊,田林,李昭. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2017(02)
[6]ACE抑制劑的QSAR研究與分子設(shè)計(jì)[J]. 仝建波,李康楠,吳英紀(jì),占培,李凌霄. 分子科學(xué)學(xué)報(bào). 2016(04)
[7]C-3噁二唑硫乙酰腙取代的氟喹諾酮類似物的合成、抗腫瘤活性及構(gòu)-效關(guān)系[J]. 高留州,謝玉鎖,李濤,黃文龍,胡國(guó)強(qiáng). 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2014(12)
[8]Part Ⅳ.環(huán)丙沙星C-3羧基衍生物均三唑并噻二嗪及吡唑并均三唑的合成和抗腫瘤活性研究[J]. 謝松強(qiáng),陳寅生,王國(guó)強(qiáng),段楠楠,溫曉漪,曹鐵耀,銀俊,王偉,胡國(guó)強(qiáng),黃文龍. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2012(01)
[9]黃酮類化合物抑制MMP-9的定量結(jié)構(gòu)-活性關(guān)系和結(jié)構(gòu)修飾的理論研究[J]. 張?bào)K,申鵬,陸濤,余丹妮,李卉,楊國(guó)忠. 化學(xué)學(xué)報(bào). 2011(04)
[10]藥物分子設(shè)計(jì)的策略:藥理活性與成藥性[J]. 郭宗儒. 藥學(xué)學(xué)報(bào). 2010(05)
本文編號(hào):2984229
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