赤子愛勝蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-16 06:13
目的分析赤子愛勝蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列。方法從本院構(gòu)建的赤子愛勝蚓cDNA文庫(kù)中經(jīng)測(cè)序獲得其Calreticulin cDNA序列。采用生物信息學(xué)分析工具DNAMAN、NCBI ORF finder、ExPASy Protparam、ExPASY Protscale、NCBI Conserved Domains、SignalP 4. 1 Server、TMHMM Server v. 2. 0、SOSUI、NetPhos 3. 1 Server、PSORT、SOPMA、ExPASy COILS、SWISS-MODEL分別對(duì)Calreticulin的cDNA序列、氨基酸序列、一級(jí)結(jié)構(gòu)基本理化性質(zhì)、親/疏水性、保守結(jié)構(gòu)域、信號(hào)肽、跨膜區(qū)、可溶性、磷酸化修飾、亞細(xì)胞定位、二級(jí)結(jié)構(gòu)、卷曲螺旋域以及三級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè)及分析。結(jié)果赤子愛勝蚓Calreticulin cDNA序列長(zhǎng)476 bp,其中包含354 bp的開放閱讀框,編碼118個(gè)氨基酸殘基;Calreticulin由19種氨基酸組成,呈酸性,為穩(wěn)定的可溶性親水蛋白;具有1段Calreticulin超家族保守結(jié)構(gòu)域;不...
【文章來(lái)源】:中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2020,33(01)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
DNAMAN分析Calreticulin的cDNA序列
TMHMM分析Calreticulin的跨膜性
Calreticulin mRNA序列的ORF始于cDNA序列的第123位堿基,止于第477位堿基,共編碼118個(gè)氨基酸殘基,見圖2。2.3 Calreticulin的一級(jí)結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]龍眼Dlf3h基因的克隆、表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[J]. 鄭威,董學(xué)明,張秋穎,于雪飛,陳寧,季宇彬,李文蘭. 分子植物育種. 2019(15)
[2]山羊緊密連接相關(guān)蛋白ZO-1序列的生物信息學(xué)分析[J]. 王夢(mèng)雅,趙學(xué)亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡紅蓮,高民. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(21)
[3]人過(guò)氧化物氧還蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 楊瑩瑩,趙南晰,安麗萍,孫晶波,郭笑. 北華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(06)
[4]蚯蚓的藥用價(jià)值研究進(jìn)展[J]. 王東,楊歡,王瑞輝. 生物資源. 2018(05)
[5]蘆薈大黃素對(duì)胃癌SGC-7901細(xì)胞株鈣聯(lián)蛋白/鈣網(wǎng)蛋白循環(huán)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激凋亡的影響[J]. 宋吉寧,董錦忠,陳文禮. 中國(guó)臨床研究. 2018(06)
[6]蚯蚓提取物對(duì)伊莎雪佛黑雞生產(chǎn)性能及免疫功能的影響[J]. 李娟,邱時(shí)秀,雷春龍,李叢艷,許禎瑩,梅秀麗,吳永勝. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(08)
[7]蚯蚓的化學(xué)成分與應(yīng)用價(jià)值研究進(jìn)展[J]. 涂清波,林穎,蘇鵬亮,陸冬鶯,馬宇凡,王賽男,徐丹. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(34)
[8]鈣網(wǎng)蛋白相關(guān)信號(hào)通路在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 邱浩,朱軍輝,羅招陽(yáng),張志偉,張瑛,劉重元,朱建思,肖娟,張先鋒. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2017(05)
[9]蚯蚓提取物作用的研究進(jìn)展[J]. 吳澤宇,孫晉民,王儉,蔡冬梅. 山西醫(yī)藥雜志. 2015(13)
[10]蚯蚓提取物對(duì)動(dòng)物創(chuàng)傷愈合作用的研究進(jìn)展[J]. 殷建建,胡群,易子晴,劉洋,易丹,李文平. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2015(06)
碩士論文
[1]Calreticulin誘導(dǎo)鼻咽癌CNE2細(xì)胞EMT相關(guān)信號(hào)通路研究[D]. 朱軍輝.南華大學(xué) 2018
[2]蚯蚓活性蛋白抗結(jié)腸癌DLD-1細(xì)胞作用機(jī)制的研究[D]. 馬遠(yuǎn)娜.山東大學(xué) 2014
本文編號(hào):2980303
【文章來(lái)源】:中國(guó)生物制品學(xué)雜志. 2020,33(01)
【文章頁(yè)數(shù)】:7 頁(yè)
【部分圖文】:
DNAMAN分析Calreticulin的cDNA序列
TMHMM分析Calreticulin的跨膜性
Calreticulin mRNA序列的ORF始于cDNA序列的第123位堿基,止于第477位堿基,共編碼118個(gè)氨基酸殘基,見圖2。2.3 Calreticulin的一級(jí)結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]龍眼Dlf3h基因的克隆、表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[J]. 鄭威,董學(xué)明,張秋穎,于雪飛,陳寧,季宇彬,李文蘭. 分子植物育種. 2019(15)
[2]山羊緊密連接相關(guān)蛋白ZO-1序列的生物信息學(xué)分析[J]. 王夢(mèng)雅,趙學(xué)亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡紅蓮,高民. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(21)
[3]人過(guò)氧化物氧還蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 楊瑩瑩,趙南晰,安麗萍,孫晶波,郭笑. 北華大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(06)
[4]蚯蚓的藥用價(jià)值研究進(jìn)展[J]. 王東,楊歡,王瑞輝. 生物資源. 2018(05)
[5]蘆薈大黃素對(duì)胃癌SGC-7901細(xì)胞株鈣聯(lián)蛋白/鈣網(wǎng)蛋白循環(huán)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激凋亡的影響[J]. 宋吉寧,董錦忠,陳文禮. 中國(guó)臨床研究. 2018(06)
[6]蚯蚓提取物對(duì)伊莎雪佛黑雞生產(chǎn)性能及免疫功能的影響[J]. 李娟,邱時(shí)秀,雷春龍,李叢艷,許禎瑩,梅秀麗,吳永勝. 黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(08)
[7]蚯蚓的化學(xué)成分與應(yīng)用價(jià)值研究進(jìn)展[J]. 涂清波,林穎,蘇鵬亮,陸冬鶯,馬宇凡,王賽男,徐丹. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(34)
[8]鈣網(wǎng)蛋白相關(guān)信號(hào)通路在腫瘤中的研究進(jìn)展[J]. 邱浩,朱軍輝,羅招陽(yáng),張志偉,張瑛,劉重元,朱建思,肖娟,張先鋒. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2017(05)
[9]蚯蚓提取物作用的研究進(jìn)展[J]. 吳澤宇,孫晉民,王儉,蔡冬梅. 山西醫(yī)藥雜志. 2015(13)
[10]蚯蚓提取物對(duì)動(dòng)物創(chuàng)傷愈合作用的研究進(jìn)展[J]. 殷建建,胡群,易子晴,劉洋,易丹,李文平. 中國(guó)獸醫(yī)雜志. 2015(06)
碩士論文
[1]Calreticulin誘導(dǎo)鼻咽癌CNE2細(xì)胞EMT相關(guān)信號(hào)通路研究[D]. 朱軍輝.南華大學(xué) 2018
[2]蚯蚓活性蛋白抗結(jié)腸癌DLD-1細(xì)胞作用機(jī)制的研究[D]. 馬遠(yuǎn)娜.山東大學(xué) 2014
本文編號(hào):2980303
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