目的分析赤子愛勝蚓Calreticulin的cDNA和氨基酸序列。方法從本院構(gòu)建的赤子愛勝蚓cDNA文庫中經(jīng)測序獲得其Calreticulin cDNA序列。采用生物信息學(xué)分析工具DNAMAN、NCBI ORF finder、ExPASy Protparam、ExPASY Protscale、NCBI Conserved Domains、SignalP 4. 1 Server、TMHMM Server v. 2. 0、SOSUI、NetPhos 3. 1 Server、PSORT、SOPMA、ExPASy COILS、SWISS-MODEL分別對Calreticulin的cDNA序列、氨基酸序列、一級結(jié)構(gòu)基本理化性質(zhì)、親/疏水性、保守結(jié)構(gòu)域、信號肽、跨膜區(qū)、可溶性、磷酸化修飾、亞細胞定位、二級結(jié)構(gòu)、卷曲螺旋域以及三級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測及分析。結(jié)果赤子愛勝蚓Calreticulin cDNA序列長476 bp,其中包含354 bp的開放閱讀框,編碼118個氨基酸殘基;Calreticulin由19種氨基酸組成,呈酸性,為穩(wěn)定的可溶性親水蛋白;具有1段Calreticulin超家族保守結(jié)構(gòu)域;不... 

【文章來源】：中國生物制品學(xué)雜志. 2020,33(01)

【文章頁數(shù)】：7 頁

【部分圖文】：

DNAMAN分析Calreticulin的cDNA序列

TMHMM分析Calreticulin的跨膜性

Calreticulin mRNA序列的ORF始于cDNA序列的第123位堿基，止于第477位堿基，共編碼118個氨基酸殘基，見圖2。2.3 Calreticulin的一級結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)

【參考文獻】：
期刊論文
[1]龍眼Dlf3h基因的克隆、表達及其生物信息學(xué)分析[J]. 鄭威,董學(xué)明,張秋穎,于雪飛,陳寧,季宇彬,李文蘭.  分子植物育種. 2019(15)
[2]山羊緊密連接相關(guān)蛋白ZO-1序列的生物信息學(xué)分析[J]. 王夢雅,趙學(xué)亮,徐明,李洋,宋利文,高峰,胡紅蓮,高民.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(21)
[3]人過氧化物氧還蛋白的生物信息學(xué)分析[J]. 楊瑩瑩,趙南晰,安麗萍,孫晶波,郭笑.  北華大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(06)
[4]蚯蚓的藥用價值研究進展[J]. 王東,楊歡,王瑞輝.  生物資源. 2018(05)
[5]蘆薈大黃素對胃癌SGC-7901細胞株鈣聯(lián)蛋白/鈣網(wǎng)蛋白循環(huán)及內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激凋亡的影響[J]. 宋吉寧,董錦忠,陳文禮.  中國臨床研究. 2018(06)
[6]蚯蚓提取物對伊莎雪佛黑雞生產(chǎn)性能及免疫功能的影響[J]. 李娟,邱時秀,雷春龍,李叢艷,許禎瑩,梅秀麗,吳永勝.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2018(08)
[7]蚯蚓的化學(xué)成分與應(yīng)用價值研究進展[J]. 涂清波,林穎,蘇鵬亮,陸冬鶯,馬宇凡,王賽男,徐丹.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(34)
[8]鈣網(wǎng)蛋白相關(guān)信號通路在腫瘤中的研究進展[J]. 邱浩,朱軍輝,羅招陽,張志偉,張瑛,劉重元,朱建思,肖娟,張先鋒.  醫(yī)學(xué)研究雜志. 2017(05)
[9]蚯蚓提取物作用的研究進展[J]. 吳澤宇,孫晉民,王儉,蔡冬梅.  山西醫(yī)藥雜志. 2015(13)
[10]蚯蚓提取物對動物創(chuàng)傷愈合作用的研究進展[J]. 殷建建,胡群,易子晴,劉洋,易丹,李文平.  中國獸醫(yī)雜志. 2015(06)

碩士論文
[1]Calreticulin誘導(dǎo)鼻咽癌CNE2細胞EMT相關(guān)信號通路研究[D]. 朱軍輝.南華大學(xué) 2018
[2]蚯蚓活性蛋白抗結(jié)腸癌DLD-1細胞作用機制的研究[D]. 馬遠娜.山東大學(xué) 2014



本文編號：2980303