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來源于多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096晶體結(jié)構(gòu)解析

發(fā)布時(shí)間:2021-01-06 03:07
  地爾硫卓是一種非二氫吡啶類鈣離子拮抗劑,作為臨床藥物具有高選擇性、高耐受性、廣適用性等特點(diǎn),目前已廣泛用于治療高血壓、心絞痛以及心律失常等心血管疾病。地爾硫卓在體內(nèi)代謝可生成多種代謝產(chǎn)物,這些代謝產(chǎn)物多具有藥物活性,對(duì)鈣離子通道有著不同的抑制作用。地爾硫卓及其代謝物在體內(nèi)的脫乙酰作用依賴于一種來源于腸道微生物多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096(GenBank,NP813007.1)。本實(shí)驗(yàn)以BT4096蛋白為研究對(duì)象,對(duì)其進(jìn)行表達(dá)、純化及晶體結(jié)構(gòu)解析。BT4096截去其N端信號(hào)肽后有440個(gè)氨基酸,分子量為51 kDa,全基因合成并構(gòu)建在pET32a載體上,后轉(zhuǎn)入工程菌株BL21(DE3)中進(jìn)行表達(dá)。通過兩次鎳親和層析純化,獲得了符合結(jié)晶純度的BT4096蛋白溶液。晶體條件的初篩通過微量蒸汽擴(kuò)散-坐滴法,使用商業(yè)化結(jié)晶試劑盒對(duì)晶體條件進(jìn)行篩選。晶體衍射數(shù)據(jù)的收集在同步輻射中心進(jìn)行。利用單波長反常散射的方法解析了BT4096的相位,通過PHENIX搭建初始結(jié)構(gòu)模型,使用COOT進(jìn)行結(jié)構(gòu)修正,最終獲得分辨率為2.33 A的結(jié)構(gòu)。BT4096的結(jié)構(gòu)可分為兩個(gè)部分,N端結(jié)構(gòu)... 

【文章來源】:中國科學(xué)技術(shù)大學(xué)安徽省 211工程院校 985工程院校

【文章頁數(shù)】:81 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

來源于多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096晶體結(jié)構(gòu)解析


圖1.2?SGNH家族水解。ǎ牵模樱碳易澹┐呋瘷C(jī)制??注:催化三聯(lián)體和水分子用黑色表示,氧陰離子洞為藍(lán)色,底物為紅色??

氨基酸序列,信號(hào)肽,氨基酸序列,生物信息學(xué)


?第3章結(jié)果與討論???第3章結(jié)果與討論??3.1?BT4096生物信息學(xué)預(yù)測??(1)?BT4096信號(hào)肽預(yù)測??用在線軟件SignalP5.0對(duì)BT4096氨基酸序列進(jìn)行分析,結(jié)果如圖3.1。序??列AFA-QT間有信號(hào)肽切點(diǎn),重組蛋白的表達(dá)需除去信號(hào)肽部分,在基因合成時(shí)??截去N端20個(gè)氨基酸。??Si^nalP-5.0?prediction?(Eukarya):?Sequence??i?j"?''?????"?SP(Sec/SPI)???J?i?OTHER??0.8-?p??安?i??『?!??:?a?^??o-?-一????w?????—??-?■?■?—'?■'?????NKKFLVLVAAVCMAyTTAPAQTVKPFKE6DRAVFLGNSlT〇6GRyH¥FZMLYYnTRFPNMPIRVFNGGIG??ssssssssssssssssssscxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx??I?1?I?1?I?1?I?'??0?20?40?60??Proirin?sequence??圖3.1?BT4096信號(hào)肽預(yù)測??(2)?BT4096跨膜區(qū)預(yù)測??用在線軟件TMHMM?2.0對(duì)BT4096氨基酸序列進(jìn)行分析,結(jié)果如圖3.2所??示,BT4096不含跨膜螺旋。??TMHMM?posterior?probabilities?for?WEBSEQUENCE??1.2????■???■???????????1???i?*??I??

來源于多形擬桿菌的乙酰酯酶BT4096晶體結(jié)構(gòu)解析


圖3.2?TMHMM跨膜預(yù)測??


本文編號(hào):2959817

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