G偶聯(lián)蛋白受體142活性位點預(yù)測及其與激動劑對接研究
發(fā)布時間:2020-12-24 22:40
G偶聯(lián)蛋白受體142(GPR142)主要在胰島B細(xì)胞中表達(dá),可通過內(nèi)源性配體色氨酸或合成的GPR142激動劑來調(diào)節(jié)胰島素分泌而治療糖尿病,是重要靶點蛋白,但因?qū)儆谀さ鞍?晶體結(jié)構(gòu)難以解析.本實驗對GPR142膜蛋白進行同源建模,優(yōu)化評估,構(gòu)建出可靠的蛋白模型;根據(jù)最優(yōu)蛋白三維模型預(yù)測到6個潛在藥物作用活性位點并分析其氨基酸組成;將潛在藥物苯并氧氮雜類衍生物對接至活性位點并分析蛋白-藥物相互作用力.本實驗獲得可靠的GPR142蛋白模型和蛋白-藥物作用模型,從而設(shè)計苯并氧氮雜類衍生物,為獲得以GPR142為靶點的更高效治療II型糖尿病的藥物提供了理論基礎(chǔ).
【文章來源】:昆明理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020年02期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
0 引 言
1 計算方法
1.1 GPR142同源模建
1.2 模型評估與優(yōu)化
1.3 藥物分子構(gòu)建與分子對接
2 結(jié)果與討論
2.1 序列比對
2.2 構(gòu)建GPR142蛋白三維模型
2.3 GPR142三維模型評估與優(yōu)化
2.4 活性位點分析及分子對接
2.4.1 活性位點分析
2.4.2 對接結(jié)果分析
3 結(jié) 論
本文編號:2936436
【文章來源】:昆明理工大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2020年02期 北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
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0 引 言
1 計算方法
1.1 GPR142同源模建
1.2 模型評估與優(yōu)化
1.3 藥物分子構(gòu)建與分子對接
2 結(jié)果與討論
2.1 序列比對
2.2 構(gòu)建GPR142蛋白三維模型
2.3 GPR142三維模型評估與優(yōu)化
2.4 活性位點分析及分子對接
2.4.1 活性位點分析
2.4.2 對接結(jié)果分析
3 結(jié) 論
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