Hsp90~N抑制劑的虛擬篩選
發(fā)布時(shí)間:2020-12-23 23:08
目的采用虛擬篩選獲得與靶標(biāo)Hsp90N結(jié)合力較好的目標(biāo)化合物,為抗腫瘤新藥研發(fā)提供潛在先導(dǎo)化合物。方法采用SYBYL軟件對(duì)自主構(gòu)建的化合物庫(kù)進(jìn)行虛擬篩選,獲得目標(biāo)化合物,采用精細(xì)對(duì)接,分析復(fù)合物模擬三維結(jié)構(gòu)與分子互作機(jī)制。結(jié)果通過(guò)虛擬篩選,成功獲得21個(gè)目標(biāo)化合物(Total score>6,Cscore≥4),其中Total score>8且Cscore≥4者18個(gè),分別屬于冬凌草甲素類、小檗堿類、巴馬汀類、異長(zhǎng)春花苷類、白樺酸類、香蕉皮類、欖香烯類、人參皂苷類和其他類化合物。綜合考量Total score、Cscore打分值與結(jié)構(gòu)多樣性,選取5個(gè)最優(yōu)化合物為代表,構(gòu)建化合物與Hsp90N復(fù)合物模擬三維結(jié)構(gòu),分別為1號(hào)化合物2DPeiLL (Total score=12.98,Cscore=4)、2號(hào)化合物XBJ4463 (Total score=12.78,Cscore=4)、4號(hào)化合物V12ZhangYC (Total score=11.89,Cscore=4...
【文章來(lái)源】:醫(yī)學(xué)信息. 2020年19期
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 化合物庫(kù)構(gòu)建優(yōu)化
1.2 靶標(biāo)蛋白Hsp90N優(yōu)化
1.3 虛擬篩選
1.4精細(xì)對(duì)接
2 結(jié)果
2.1 虛擬篩選結(jié)果
2.2 復(fù)合物模擬三維結(jié)構(gòu)與分子互作機(jī)制分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Complex structure of human Hsp90~N and a novel small inhibitor FS5[J]. Rui Liu,Xiao-Lu Lu,Xian-Hua Huang,Wei He,Jing-Jing Duan,Jin Zhang,Jian Li. Nuclear Science and Techniques. 2020(03)
[2]基于分子對(duì)接的計(jì)算機(jī)虛擬篩選技術(shù)在新藥發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉玉甜,趙詩(shī)雨,呂邵娃. 化學(xué)工程師. 2020(02)
[3]Discovery of a novel small inhibitor RJ19 targeting to human Hsp90[J]. Hui-Ling Cao,Kai-Kai Lyu,Bin Liu,Jian Li,Jian-Hua He. Nuclear Science and Techniques. 2017(10)
[4]熱休克蛋白與肺癌相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 劉海玲,李旦,孫帥. 中藥新藥與臨床藥理. 2016(01)
博士論文
[1]熱休克蛋白90(HSP90)抑制劑的設(shè)計(jì)、合成及生物活性篩選[D]. 孫建.成都中醫(yī)藥大學(xué) 2016
本文編號(hào):2934502
【文章來(lái)源】:醫(yī)學(xué)信息. 2020年19期
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 化合物庫(kù)構(gòu)建優(yōu)化
1.2 靶標(biāo)蛋白Hsp90N優(yōu)化
1.3 虛擬篩選
1.4精細(xì)對(duì)接
2 結(jié)果
2.1 虛擬篩選結(jié)果
2.2 復(fù)合物模擬三維結(jié)構(gòu)與分子互作機(jī)制分析
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Complex structure of human Hsp90~N and a novel small inhibitor FS5[J]. Rui Liu,Xiao-Lu Lu,Xian-Hua Huang,Wei He,Jing-Jing Duan,Jin Zhang,Jian Li. Nuclear Science and Techniques. 2020(03)
[2]基于分子對(duì)接的計(jì)算機(jī)虛擬篩選技術(shù)在新藥發(fā)現(xiàn)中的應(yīng)用進(jìn)展[J]. 劉玉甜,趙詩(shī)雨,呂邵娃. 化學(xué)工程師. 2020(02)
[3]Discovery of a novel small inhibitor RJ19 targeting to human Hsp90[J]. Hui-Ling Cao,Kai-Kai Lyu,Bin Liu,Jian Li,Jian-Hua He. Nuclear Science and Techniques. 2017(10)
[4]熱休克蛋白與肺癌相關(guān)性的研究進(jìn)展[J]. 劉海玲,李旦,孫帥. 中藥新藥與臨床藥理. 2016(01)
博士論文
[1]熱休克蛋白90(HSP90)抑制劑的設(shè)計(jì)、合成及生物活性篩選[D]. 孫建.成都中醫(yī)藥大學(xué) 2016
本文編號(hào):2934502
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